
Atenção:
O eduCAPES é um repositório de objetos educacionais, não sendo responsável por materiais de terceiros submetidos na plataforma. O usuário assume ampla e total responsabilidade quanto à originalidade, à titularidade e ao conteúdo, citações de obras consultadas, referências e outros elementos que fazem parte do material que deseja submeter. Recomendamos que se reporte diretamente ao(s) autor(es), indicando qual parte do material foi considerada imprópria (cite página e parágrafo) e justificando sua denúncia.
Caso seja o autor original de algum material publicado indevidamente ou sem autorização, será necessário que se identifique informando nome completo, CPF e data de nascimento. Caso possua uma decisão judicial para retirada do material, solicitamos que informe o link de acesso ao documento, bem como quaisquer dados necessários ao acesso, no campo abaixo.
Todas as denúncias são sigilosas e sua identidade será preservada. Os campos nome e e-mail são de preenchimento opcional. Porém, ao deixar de informar seu e-mail, um possível retorno será inviabilizado e/ou sua denúncia poderá ser desconsiderada no caso de necessitar de informações complementares.
| Metadados | Descrição | Idioma |
|---|---|---|
| Autor(es): dc.contributor | Domingues, Douglas Silva [Orientador] | - |
| Autor(es): dc.contributor | Paschoal, Alexandre Rossi [Coorientador] | - |
| Autor(es): dc.creator | Lorenzetti, Alan Péricles Rodrigues | - |
| Data de aceite: dc.date.accessioned | 2025-05-15T12:44:00Z | - |
| Data de disponibilização: dc.date.available | 2025-05-15T12:44:00Z | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2024-05-01 | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2024-05-01 | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2025-05-15 | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2025-05-15 | - |
| Fonte completa do material: dc.identifier | https://repositorio.uel.br/handle/123456789/15712 | - |
| Fonte: dc.identifier.uri | http://educapes.capes.gov.br/handle/capes/973759 | - |
| Descrição: dc.description | Resumo: Os elementos transponíveis (TEs) constituem uma grande parte dos genomas eucariotos e desempenham grande importância em sua evolução Esse componente do genoma pode atuar de diversas maneiras, seja inativando genes, alterando a expressão deles, aumentando seu número de cópias, ou até mesmo criando novas sequências nucleotídicas capazes de influenciar no funcionamento do organismo Nesse último caso, sabe-se que os TEs podem originar loci responsáveis pela transcrição de RNAs não codificantes funcionais (ncRNAs), como microRNAs (miRNAs), os quais podem atuar na regulação pós-transcricional de genes Com base nessas informações, os objetivos da primeira parte do trabalho foram a anotação de TEs de 15 genomas vegetais utilizando métodos de busca baseados em similaridade, e a procura por interseções posicionais com precursores de miRNAs anotados Os resultados obtidos permitiram a criação do Plant Transposable Element-related microRNAs Database (PlanTE-MIR DB, disponível em <http://bioinfo-toolcputfpredubr/plantemirdb/>), que agrega 152 TE-MIRs para 1 espécies vegetais e facilita o acesso às anotações por meio de uma interface amigável, disponibilizando múltiplos formatos de arquivo Boa parte desses loci produtores de pequenos ncRNAs estão relacionados a um tipo específico de TEs: os elementos transponíveis de repetição invertida em miniatura (MITEs, do inglês Miniature Inverted-Repeat Transposable Elements) Visando explorar em maior profundidade essa relação, o objetivo da segunda parte do trabalho foi realizar a busca por pequenos RNAs relacionados aos MITEs no genoma de Coffea canephora A análise revelou que aproximadamente 1,5% do genoma da espécie é composto por MITEs e que a maior parte das inserções está localizada em regiões ricas em genes Além disso, foram encontradas e classificadas 44 famílias relacionadas a pequenos RNAs, sendo pelo menos uma delas representada em ESTs A maior parte dos pequenos RNAs associados a essas famílias são de 24 nt, sugerindo a participação desses elementos na biogênese de siRNAs Esses dados trazem importantes contribuições para a compreensão da evolução genômica em plantas, fornecendo informações sobre a inter-relação entre os seus diversos componentes | - |
| Descrição: dc.description | Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Londrina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular | - |
| Descrição: dc.description | Abstract: Transposable elements (TEs) comprise a major fraction of eukaryotic genomes and they are known to drive their evolution by several mechanisms They can act inactivating genes, changing the expression levels, raising their copy number, or even creating new nucleotide sequences In this context, sometimes they are responsible for shaping new functional non-coding RNA loci (eg microRNAs), which may participate in post-transcriptional gene regulation process The first part of this work had as main objective the similarity search-based TE annotation for 15 plant genomes in order to find positional intersections with annotated miRNAs We assembled these findings in the Plant Transposable Elementrelated miRNAs Database (PlanTE-MIR DB), hosted at <http://bioinfo-toolcputfpr edubr/plantemirdb/> This database has 152 TE-MIR annotations for 1 plant species in a user-friendly web interface, providing annotation data using several file formats Many ncRNA loci producing small RNAs are related to a specific TE type: the Miniature Inverted-Repeat Transposable Elements (MITEs) Considering this, the second part of this work had as main objective the investigation of MITE-associated small RNAs in the Coffea canephora genome We observed that 1,5% of this genome is composed by MITEs We also found genome-wide association between the MITE and exon densities Moreover, 44 MITE families were associated to small RNAs, and at least one family is represented in EST contig data Most small RNAs are 24 nt, suggesting participation of MITEs in the siRNA biogenesis pathway These data bring important insights for the comprehension of plant genomes evolution, providing information about the relationship of their different components | - |
| Formato: dc.format | application/pdf | - |
| Idioma: dc.language | pt_BR | - |
| Relação: dc.relation | Mestrado | - |
| Relação: dc.relation | Genética e Biologia Molecular | - |
| Relação: dc.relation | Centro de Ciências Biológicas | - |
| Relação: dc.relation | Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Genética vegetal | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Genomas | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Bancos de genes de plantas | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Biotecnologia vegetal | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Sequência de nucleotídeos | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Genomes | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Plant gene banks | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Plant genetics | - |
| Título: dc.title | Análise em larga escala de pequenos RNAs derivados de elementos transponíveis em genomas vegetais | - |
| Tipo de arquivo: dc.type | livro digital | - |
| Aparece nas coleções: | Repositório Institucional da UEL - RIUEL | |
O Portal eduCAPES é oferecido ao usuário, condicionado à aceitação dos termos, condições e avisos contidos aqui e sem modificações. A CAPES poderá modificar o conteúdo ou formato deste site ou acabar com a sua operação ou suas ferramentas a seu critério único e sem aviso prévio. Ao acessar este portal, você, usuário pessoa física ou jurídica, se declara compreender e aceitar as condições aqui estabelecidas, da seguinte forma: