Perfil de virulência e filogenética de isolados clínicos de Escherichia coli resistentes a carbapenem recuperados em hospitais de Brasília-DF

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorPereira, Alex Leite-
Autor(es): dc.creatorSousa, Jéssica Fernandes de-
Data de aceite: dc.date.accessioned2024-10-23T16:08:46Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2024-10-23T16:08:46Z-
Data de envio: dc.date.issued2019-10-29-
Data de envio: dc.date.issued2019-10-29-
Data de envio: dc.date.issued2019-10-29-
Data de envio: dc.date.issued2019-03-15-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://repositorio.unb.br/handle/10482/35708-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/capes/900915-
Descrição: dc.descriptionDissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Biologia, Pós-Graduação em Biologia Microbiana, 2019.-
Descrição: dc.descriptionA espécie Escherichia coli tem o intestino de humanos, como habitat primário, vivendo em relação de comensalismo. Contudo, a aquisição de fatores de virulência por cepas especializadas, permite o estabelecimento de tipos patogênicos (patotipos) de E. coli. Patotipos de E. coli são agentes de infecção de uma série de sítios extraintestinais incluindo o trato urinário, corrente sanguínea e sistema nervoso central. A emergência de E. coli patogênica extraintestinal (ExPEC) portando genes de resistência a carbapenem blaKPC e blaNDM é temerária, sendo importante saber qual o potencial de virulência destas cepas de E. coli portando os genes blaKPC e blaNDM circulando no Distrito Federal. Isolados resistentes a carbapenem (carba-R) de E. coli mantidos pelo Laboratório Central de Saúde Pública (LACEN-DF) foram caracterizados em função de filogrupo e tipo de sequência e quanto a presença fatores de virulência (n=19) e de genes de resistência a carbapenens (n=5) e cefalosporinas (n=5). Foram analisadas 36 cepas isoladas de amostras de swab retal, urina, sangue, escara, líquido peritoneal e aspirado traqueal. A maioria dos isolados carba-R (58%) foi definida como de filogrupos comensais (A ou B1). Os fatores de virulência do patotipo ExPEC foram os mais detectados [Fyua (44, %), Foca (44, %), Yfcv (33, 3%), Vat (27,7 %) e Chua (25 %)]. O gene blaKPC foi detectado em maior frequência (52,7%) do que o gene blaNDM (36,1%) e de forma excludente. Entretanto, cepas positivas para KPC ou NDM acumularam blaIMP e genes de ESBL. Foram detectados 11 complexos clonais (CC) entre as cepas de E. coli carba-R, incluindo o CC de potencial epidêmico 131. No DF, isolados carba-R de E. coli circulam majoritariamente como cepas comensais (filogrupos A e B1) acumulando genes de resistência (blaKPC/NDM+blaCTX-M) e integram uma diversidade de grupos clonais.-
Descrição: dc.descriptionThe specie Escherichia coli has the intestinal tract of humans as its main habitat, residing in a commensal relationship. However, the acquisition of virulence factors by specialized strains allows the establishment of pathogenic types (pathotype) of E. coli. E. coli strains are the etiological agents of infection of several extraintestinal sites including urinary tract, bloodstream and central nervous system. The emergence of extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC) harbouring carbapenem resistance genes blaKPC and blaNDM it’s temerarious, becoming important to know the virulence potential of those strains carrying the blaKPC and blaNDM genes circulating at Distrito Federal. E. coli carbapenem-resistant isolates maintained by the Laboratório Central de Saúde Pública (LACEN-DF) were characterized as phylogenetic group and sequence type and characterized the presence of virulence factors (n=19) and genes of antibiotic resistance to carbapenems (n=5) and cephalosporins (n=5). Thirty six strains of rectal swab, urine, blood, eschar, peritoneal fluid and tracheal aspirate samples were analyzed. Most carba-R isolates (58%) were defined as commensal phylogroups (A or B1). The virulence factors of the pathotype ExPEC were the most detected [Fyua (44,4%), Foca (44,4%), Yfcv (33.3%), Vat (27.7%) and Chua (25%)]. The blaKPC gene was more detected (52.7%) than the blaNDM gene (36.1%) and they both were not harboured at the same strain. However, positive strains for KPC or NDM also harboured blaIMP and ESBL genes. 11 clonal complexes (CC) were detected among the strains of E. coli carba-R, including the CC of epidemic potential 131. At DF, E. coli carba-R strains circulate mainly as commensal strains (phylogroups A and B1) accumulating resistance genes (blaKPC/blaNDM + blaCTX-M) which integrate a variety of clonal groups.-
Descrição: dc.descriptionInstituto de Ciências Biológicas (IB)-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Biologia Celular (IB CEL)-
Descrição: dc.descriptionPrograma de Pós-Graduação em Biologia Microbiana-
Formato: dc.formatapplication/pdf-
Direitos: dc.rightsAcesso Aberto-
Direitos: dc.rightsA concessão da licença deste item refere-se ao termo de autorização impresso assinado pelo autor com as seguintes condições: Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade de Brasília e o IBICT a disponibilizar por meio dos sites www.bce.unb.br, www.ibict.br, http://hercules.vtls.com/cgi-bin/ndltd/chameleon?lng=pt&skin=ndltd sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra disponibilizada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, a partir desta data.-
Palavras-chave: dc.subjectEscherichia coli - genética-
Palavras-chave: dc.subjectResistência antimicrobiana-
Palavras-chave: dc.subjectFilogenética-
Palavras-chave: dc.subjectGenotipagem-
Título: dc.titlePerfil de virulência e filogenética de isolados clínicos de Escherichia coli resistentes a carbapenem recuperados em hospitais de Brasília-DF-
Título: dc.titleVirulence profile and phylogenetics of clinical strains of Escherichia coli with carbapenem resistance at hospitals from Brasília-DF-
Tipo de arquivo: dc.typelivro digital-
Aparece nas coleções:Repositório Institucional – UNB

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