Atenção:
O eduCAPES é um repositório de objetos educacionais, não sendo responsável por materiais de terceiros submetidos na plataforma. O usuário assume ampla e total responsabilidade quanto à originalidade, à titularidade e ao conteúdo, citações de obras consultadas, referências e outros elementos que fazem parte do material que deseja submeter. Recomendamos que se reporte diretamente ao(s) autor(es), indicando qual parte do material foi considerada imprópria (cite página e parágrafo) e justificando sua denúncia.
Caso seja o autor original de algum material publicado indevidamente ou sem autorização, será necessário que se identifique informando nome completo, CPF e data de nascimento. Caso possua uma decisão judicial para retirada do material, solicitamos que informe o link de acesso ao documento, bem como quaisquer dados necessários ao acesso, no campo abaixo.
Todas as denúncias são sigilosas e sua identidade será preservada. Os campos nome e e-mail são de preenchimento opcional. Porém, ao deixar de informar seu e-mail, um possível retorno será inviabilizado e/ou sua denúncia poderá ser desconsiderada no caso de necessitar de informações complementares.
Metadados | Descrição | Idioma |
---|---|---|
Autor(es): dc.creator | Morgante, Carolina Vianna | - |
Autor(es): dc.creator | Guimarães, Patrícia Messenberg | - |
Autor(es): dc.creator | Martins, Andressa da Cunha Quintana | - |
Autor(es): dc.creator | Araujo, Ana Claudia Guerra de | - |
Autor(es): dc.creator | Bertioli, Soraya Cristina de Macedo Leal | - |
Autor(es): dc.creator | Bertioli, David John | - |
Autor(es): dc.creator | Brasileiro, Ana Cristina Miranda | - |
Data de aceite: dc.date.accessioned | 2024-10-23T15:14:20Z | - |
Data de disponibilização: dc.date.available | 2024-10-23T15:14:20Z | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2017-08-22 | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2017-08-22 | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2011-09-09 | - |
Fonte completa do material: dc.identifier | http://repositorio.unb.br/handle/10482/24208 | - |
Fonte completa do material: dc.identifier | https://dx.doi.org/10.1186/1756-0500-4-339 | - |
Fonte: dc.identifier.uri | http://educapes.capes.gov.br/handle/capes/878025 | - |
Descrição: dc.description | Background: Wild peanut species (Arachis spp.) are a rich source of new alleles for peanut improvement. Plant transcriptome analysis under specific experimental conditions helps the understanding of cellular processes related, for instance, to development, stress response, and crop yield. The validation of these studies has been generally accomplished by quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction (qRT-PCR) which requires normalization of mRNA levels among samples. This can be achieved by comparing the expression ratio between a gene of interest and a reference gene which is constitutively expressed. Nowadays there is a lack of appropriate reference genes for both wild and cultivated Arachis. The identification of such genes would allow a consistent analysis of qRT-PCR data and speed up candidate gene validation in peanut. Results: A set of ten reference genes were analyzed in four Arachis species (A. magna; A. duranensis; A. stenosperma and A. hypogaea) subjected to biotic (root-knot nematode and leaf spot fungus) and abiotic (drought) stresses, in two distinct plant organs (roots and leaves). By the use of three programs (GeNorm, NormFinder and BestKeeper) and taking into account the entire dataset, five of these ten genes, ACT1 (actin depolymerizing factorlike protein), UBI1 (polyubiquitin), GAPDH (glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase), 60S (60S ribosomal protein L10) and UBI2 (ubiquitin/ribosomal protein S27a) emerged as top reference genes, with their stability varying in eight subsets. The former three genes were the most stable across all species, organs and treatments studied. Conclusions: This first in-depth study of reference genes validation in wild Arachis species will allow the use of specific combinations of secure and stable reference genes in qRT-PCR assays. The use of these appropriate references characterized here should improve the accuracy and reliability of gene expression analysis in both wild and cultivated Arachis and contribute for the better understanding of gene expression in, for instance, stress tolerance/resistance mechanisms in plants. | - |
Formato: dc.format | application/pdf | - |
Publicador: dc.publisher | BioMed Central | - |
Direitos: dc.rights | Acesso Aberto | - |
Direitos: dc.rights | © 2011 Brasileiro et al; licensee BioMed Central Ltd. This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License (http://creativecommons.org/licenses/by/2.0), which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited. | - |
Palavras-chave: dc.subject | Amendoim | - |
Palavras-chave: dc.subject | Reação em cadeia de polimerase | - |
Palavras-chave: dc.subject | Genes | - |
Título: dc.title | Reference genes for quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction expression studies in wild and cultivated peanut | - |
Tipo de arquivo: dc.type | livro digital | - |
Aparece nas coleções: | Repositório Institucional – UNB |
O Portal eduCAPES é oferecido ao usuário, condicionado à aceitação dos termos, condições e avisos contidos aqui e sem modificações. A CAPES poderá modificar o conteúdo ou formato deste site ou acabar com a sua operação ou suas ferramentas a seu critério único e sem aviso prévio. Ao acessar este portal, você, usuário pessoa física ou jurídica, se declara compreender e aceitar as condições aqui estabelecidas, da seguinte forma: