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Metadados | Descrição | Idioma |
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Autor(es): dc.creator | Ribeiro, Edward de Oliveira | - |
Autor(es): dc.creator | Zerlotini, Gustavo G. | - |
Autor(es): dc.creator | Lopes, Irving R. M. | - |
Autor(es): dc.creator | Ribeiro, Victor B. R. | - |
Autor(es): dc.creator | Melo, Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
Autor(es): dc.creator | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
Autor(es): dc.creator | Costa, Marcos Mota | - |
Autor(es): dc.creator | BIOFOCO Network | - |
Data de aceite: dc.date.accessioned | 2024-07-22T11:40:09Z | - |
Data de disponibilização: dc.date.available | 2024-07-22T11:40:09Z | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2018-06-26 | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2018-06-26 | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2005-09-30 | - |
Fonte completa do material: dc.identifier | http://repositorio.unb.br/handle/10482/32103 | - |
Fonte: dc.identifier.uri | http://educapes.capes.gov.br/handle/capes/785990 | - |
Descrição: dc.description | Interpro is a widely used tool for protein annotation in genome sequencing projects, demanding a large amount of computation and representing a huge time-consuming step. We present a strategy to execute programs using databases Pfam, PROSITE and ProDom of Interpro in a distributed environment using a Java-based messaging system. We developed a two-layer scheduling architecture of the distributed infrastructure. Then, we made experiments and analyzed the results. Our distributed system gave much better results than Interpro Pfam, PROSITE and ProDom running in a centralized platform. This approach seems to be appropriate and promising for highly demanding computational tools used for biological applications. | - |
Formato: dc.format | application/pdf | - |
Publicador: dc.publisher | FUNPEC-RP | - |
Direitos: dc.rights | Acesso Aberto | - |
Direitos: dc.rights | Genetics and Molecular Research - Autorização concedida ao Repositório Institucional da Universidade de Brasília (RIUnB) pelo editor da revista, em 29 mar. 2016, com os seguintes termos: disponível sob Licença Creative Commons 4.0 International, que permite copiar, distribuir e transmitir o trabalho, desde que seja citado o autor e licenciante. Não permite o uso para fins comerciais nem a adaptação desta. | - |
Palavras-chave: dc.subject | Processamento eletrônico de dados - processamento distribuído | - |
Palavras-chave: dc.subject | Interpro | - |
Palavras-chave: dc.subject | Biologia computacional | - |
Título: dc.title | A distributed computation of Interpro Pfam, PROSITE and ProDom for protein annotation | - |
Aparece nas coleções: | Repositório Institucional – UNB |
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