Análise e proposta de um sistema para validar a quantificação de proteoformas

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorZamith, Juliana Mendes N. Silva-
Autor(es): dc.contributorSchots, Natália Chaves Lessa-
Autor(es): dc.creatorPacheco, Bruno Gorini de Araujo Passos-
Autor(es): dc.creatorSeckler, Carolina dos Santos-
Data de aceite: dc.date.accessioned2024-07-11T18:48:06Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2024-07-11T18:48:06Z-
Data de envio: dc.date.issued2023-09-29-
Data de envio: dc.date.issued2023-09-29-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://app.uff.br/riuff/handle/1/30662-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/capes/777877-
Descrição: dc.descriptionA Biologia Molecular estuda a estrutura e função do material genético e seus produtos de expressão, as proteínas. Cada proteína codificada por um único gene pode ser encontrada em diversas formas moleculares, denominadas proteoformas. Tais moléculas são estudadas com o auxílio de aparelhos conhecidos como Cromatógrafo e Espectrômetro de Massa, que geram uma série de dados com o objetivo de descobrir a quantidade de cada proteoforma na amostra analisada. Atualmente, não existem sistemas estabelecidos e disseminados para quantificação dirigida de proteoformas. Uma alternativa comum é analisar manualmente os dados gerados para validar a qualidade e especificidade da quantificação de cada proteoforma. Para cada amostragem, são geradas uma ou mais centenas de dados espectrométricos. Estuda-se normalmente de cinco a 20 proteoformas por projeto. Dessa forma, são analisados milhares de gráficos por amostragem de maneira manual. O objetivo deste trabalho é propor um sistema que auxilie nesse processo de validação, verificando vários arquivos de saída do Espectrômetro de Massa por vez e gerando gráficos a partir das tabelas inseridas para melhorar a visualização dos resultados e permitir um ajuste fino nos parâmetros de seleção dos dados-
Descrição: dc.descriptionMolecular biology is the branch of biology concerned with the structure and the purpose of both the genetic material and its expression products, the proteins. Each protein coded by a single gene can be found as different molecular forms, known as proteoforms. These molecules are studied using devices such as a Chromatograph and a Mass Spectrometer, that generate several data used to discover the amount of each proteoform in analyzed samples. Currently, there is no established and well-known system for targeted proteoform quantification. A common alternative is to analyze the data manually in order to validate the quality and specificity of the quantification of each proteoform. For each data set, hundreds of spectrometric datapoints are generated. Also, a single project generally focuses on studying five to 20 different proteoforms. Therefore, thousands of graphs are analyzed manually for each sample. This work aims to propose a system that aids this validation process, verifying several Mass Spectrometer output files at a time, and generating charts from the tables on these files to help visualize the results and allowing fine-tuning of the data selection parameters-
Descrição: dc.description81 p.-
Formato: dc.formatapplication/pdf-
Idioma: dc.languagept_BR-
Direitos: dc.rightsOpen Access-
Direitos: dc.rightsCC-BY-SA-
Palavras-chave: dc.subjectProteômica-
Palavras-chave: dc.subjectProteoforma-
Palavras-chave: dc.subjectSoftware-
Palavras-chave: dc.subjectBiologia molecular-
Palavras-chave: dc.subjectSistema de validação-
Palavras-chave: dc.subjectSoftware-
Palavras-chave: dc.subjectBiologia molecular-
Palavras-chave: dc.subjectEspectrometria de massa-
Palavras-chave: dc.subjectProteomics-
Palavras-chave: dc.subjectProteoform-
Palavras-chave: dc.subjectMolecular biology-
Palavras-chave: dc.subjectValidation system-
Título: dc.titleAnálise e proposta de um sistema para validar a quantificação de proteoformas-
Tipo de arquivo: dc.typeTrabalho de conclusão de curso-
Aparece nas coleções:Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense - RiUFF

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