Análise multi-ômica comparativa do secretoma de isolados ambiental (NEFF) e clínico (T4) de Acanthamoeba castellanii através da técnica de MPLEX

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorGuimarães, Allan Jefferson-
Autor(es): dc.contributorhttp://lattes.cnpq.br/2621111326126440-
Autor(es): dc.contributorBarbosa, Alynne da Silva-
Autor(es): dc.contributorRizzo, Juliana-
Autor(es): dc.contributorPinto, Márcia Ribeiro-
Autor(es): dc.contributorhttp://lattes.cnpq.br/4738429689490737-
Autor(es): dc.creatorMedeiros, Elisa Gonçalves-
Data de aceite: dc.date.accessioned2024-07-11T17:52:14Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2024-07-11T17:52:14Z-
Data de envio: dc.date.issued2022-11-28-
Data de envio: dc.date.issued2022-11-28-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://app.uff.br/riuff/handle/1/27109-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.22409/PPGMPA.2022.m.15762913759-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/capes/759164-
Descrição: dc.descriptionAcanthamoeba castellanii é um patógeno humano e devido ao seu caráter ubíquo, pode desemprenhar importante papel de hospedeiro ambiental de diversos patógenos no solo. Alguns genótipos importantes foram descritos na literatura, dentre estes o T4, englobando isolados ambientais e clínicos, sendo que estes últimos demonstram maior virulência e frequentemente pior prognóstico Diferenças foram observadas entre isolados clínicos (T4) e isolados ambientais (Neff) durante infecção, sugerindo que distintas moléculas estão envolvidas na patogenia. Estas podem ser liberadas por meio de vesículas extracelulares (EVs), veículos de fatores de virulência em diversos patógenos, destacando a importância da caracterização destes componentes através de um estudo multi-ômico nestas estruturas. Assim, para analisar as EVs obtidas dos isolados clínicos (T4) e ambiental (NEff) de A. castellanii por multi-ômica utilizamos a técnica MPLEX (Metabolite, Protein and Lipid Extraction) acoplada à espectrometria de massas, para comparar a sua composição protéica, lipídica e as vias metabólicas expressas com possíveis implicações na patogênese. Após o cultivo dos organismos, foram coletados os sobrenadantes das cepas, e após a eliminação das células e uma sequência de etapas de concentração/filtração e ultracentrifugações, as EVs foram coletadas. Posteriormente, foram realizadas a extração de metabólito, proteína e lipídeo (MPLEx) e as distintas frações analisadas por cromatografia líquida de ultra eficiência acopladas à espectrometria de massas para as análises multi-ômicas. As identificações foram feitas comparando-se distintas bases de dados (www.uniprot.org e www.kegg.org). Foram observadas diferenças significantes na expressão de proteínas, metabólitos e lipídios entre os isolados T4 e Neff nas análises multi-ômicas. Entre os lipídios foram observadas populações com mais insaturações em Neff enquanto T4 predominou populações monoinsaturadas. Já para proteínas e metabólitos, foram observadas diferenças de expressão nas triplicatas, demonstrando que as vias metabólicas estão sendo reguladas diferentemente entre para ambos os grupos. Desta forma, observou-se diferenças na expressão de moléculas entre os isolados, o que sugere que as vias metabólicas estão sendo reguladas de forma distinta, o que poderia mudar o comportamento dessas cepas durante um processo infeccioso-
Descrição: dc.descriptionCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior-
Descrição: dc.descriptionFundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro-
Descrição: dc.descriptionConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico-
Descrição: dc.descriptionAcanthamoeba castellanii is a human pathogen and environmental host of several pathogens in the soil. Differences are observed between the T4 and Neff strains in infection indicating that distinct molecules are involved in pathogenesis. These can be released by means of extracellular vesicles (EVs), vehicles of virulence factors in several pathogens, highlighting the importance of a multi-omic study on these structures. Thus, to compare the composition of EVs by multi-omic analysis between the strains of A. castellanii using the MPLEX (Metabolite, Protein and Lipid Extraction) technique to observe active metabolic pathways during pathogenesis. After the cultivation of the organisms, the supernatants of the strains were collected, and upon elimination of cells and a sequence of concentration/filtration and ultracentrifugation steps, the EVs were collected. After, the extraction of metabolite, protein and lipid (MPLEx) were carried out and fractions analyzed by ultra-efficient liquid chromatography and mass spectrometry for multi-omic analyses. The identification of these molecules will be by comparison to several databases (www.uniprot.org and www.kegg.org). Significant differences in protein, metabolite and lipid expression were observed between the T4 and Neff strains in the multi-omic analyses. Among lipids, populations with more unsaturations were observed in Neff, whereas T4 predominated monounsaturated populations. For proteins and metabolites, differences in expression were observed in triplicates, demonstrating that metabolic pathways are being regulated differently for both groups. In summary, differences in the expression of molecules among isolates were observed, concluding that metabolic pathways are being regulated differently, which changes the behavior of these strains during an infectious process-
Descrição: dc.description62 f.-
Formato: dc.formatapplication/pdf-
Idioma: dc.languagept_BR-
Direitos: dc.rightsOpen Access-
Direitos: dc.rightsCC-BY-SA-
Palavras-chave: dc.subjectAnálises multi-ômicas-
Palavras-chave: dc.subjectPatogênese ameba-
Palavras-chave: dc.subjectVesícula extracelular-
Palavras-chave: dc.subjectAcanthamoeba castellanii-
Palavras-chave: dc.subjectGenótipo-
Palavras-chave: dc.subjectVesículas extracelulares-
Palavras-chave: dc.subjectMulti-omics analyses-
Palavras-chave: dc.subjectAmoeba pathogenesis-
Palavras-chave: dc.subjectExtracellular vesicle-
Título: dc.titleAnálise multi-ômica comparativa do secretoma de isolados ambiental (NEFF) e clínico (T4) de Acanthamoeba castellanii através da técnica de MPLEX-
Tipo de arquivo: dc.typeDissertação-
Aparece nas coleções:Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense - RiUFF

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