Avaliação da quantificação e genotipagem do DNA de biopsia de embriões bovinos produzidos In vitro

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorNogueira, Luiz Altamiro Garcia-
Autor(es): dc.contributorhttp://lattes.cnpq.br/3530272019702436-
Autor(es): dc.contributorOliveira, Clara Slade de-
Autor(es): dc.contributorSerapião, Raquel Varella-
Autor(es): dc.contributorhttp://lattes.cnpq.br/3940470394972991-
Autor(es): dc.contributorBenevides Filho, Irineu Machado-
Autor(es): dc.contributorhttp://lattes.cnpq.br/6235460343519595-
Autor(es): dc.contributorFerreira, Janaína Barcelos Porto-
Autor(es): dc.contributorhttp://lattes.cnpq.br/9627181527561619-
Autor(es): dc.contributorhttp://lattes.cnpq.br/0477536889632387-
Autor(es): dc.creatorMartins, , Júlia Medeiros Cruz de Lima-
Data de aceite: dc.date.accessioned2024-07-11T17:41:32Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2024-07-11T17:41:32Z-
Data de envio: dc.date.issued2023-12-14-
Data de envio: dc.date.issued2023-12-14-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://app.uff.br/riuff/handle/1/31442-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/capes/755492-
Descrição: dc.descriptionA produção in vitro de embriões (PIVE) e a seleção genômica representam tendências em programas de melhoramento genético bovino. A genotipagem do embrião biopsiado possibilita obter informações genômicas que o selecio nam antes mesmo da transferência. O objetivo da presente pesquisa foi avaliar amostras de biopsia de embriões bovinos, sob a hipótese de que a raça (Gir ou Girolando), o estádio embrionário (blastocisto ou blastocisto expandido) e a competência embrionária pós-transferência (embriões com prenhez positiva ou negativa) afetariam a quantidade e qualidade da amostra de DNA obtida. Para tanto, foram utilizadas amostras congeladas de biopsia embrionária de bovinos Gir e Girolando F1 produzidos in vitro. Os embriões foram cultivados para aná lise da reexpansão e somente amostras de embriões reexpandidos e transferi dos para receptoras, foram consideradas nesse estudo (n=47). O material foi submetido à extração e amplificação de DNA utilizando o kit Illustra Single Cell Genomiphi™ DNA Amplification (GE Healthcare, Buckinghamshire, United Kingdom). A quantidade de DNA do material amplificado foi analisada pelo ele troesferograma gerado pelo equipamento 2100-“Bioanalyzer” (Agilent Techno logies, Santa Clara, CA, USA) e as amostras foram encaminhadas para genoti pagem utilizando o ensaio Bovine SNP50k (Illumina Inc., San Diego, CA, USA), realizando avaliação qualitativa dos resultados, através da call rate (CR). Obti vemos, após a amplificação, concentração média de DNA de 86,07±171,66, com alta variação entre as amostras. A CR média de 0,73±0,17 não variou em função da quantidade de DNA nas amostras (CR>80%: 67,6 ng, CR<80%: 101ng). As variáveis raça, estádio embrionário e prenhez não influenciaram nos resultados da concentração de DNA e da CR. Porém, houve efeito da prenhez negativa sobre os resultados da CR (p=0,0187). Concluímos que não há inter ferência da raça e estádio embrionário na qualidade da amostra submetida à genotipagem, e que embriões com maiores chances de implantação não refle te-
Descrição: dc.descriptionCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior-
Descrição: dc.descriptionFundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro-
Descrição: dc.descriptionEmbryo in vitro production (IVEP) and genomic selection represent some trends in bovine genetic breeding programs. Genotyping of the biopsy embryo allows obtaining genomic information for selection, even before the transference. The objective of the current research was evaluating samples of bovine embryos biopsy, under the hypothesis that the breed (Gyr or Girolando), the embryonic stage (blastocyst or expanded blastocyst) and the post transference embryo competence may affect the quantity and quality of the obtained DNA sample. For that, frozen and biopsy bovine Gir and Girolando F1 embryo samples were used, produced in vitro. The embryos were cultured for reexpansion analysis and only reexpanded embryo samples and transferred to recipients, were considered in this study (n=47). The material was submitted to DNA extraction and amplification, using the kit Illustra Single Cell Genomiphi DNA Amplification (GE Healthcare, Buckinghamshire, United Kingdom). The DNA quantity of the amplified material was analyzed by electrophoresis generated by the Equipment 2100 - "Bioanalyzer" (Agilent Technologies, Santa Clara, CÁ, USA) and the samples were referred for genotyping using the assay Bovine SNP50K (Illumina Inc., San Diego, CA,USA), conducting qualitative evaluation of the results, through call rate (CR). It was obtained, after the amplification, an average DNA concentration of 86,07±171,66, with high variation among the samples. The average CR of 0,73±0,17 did not range due to DNA quantity in the samples (CR>80%: 67,6 ng, CR<80%: 101 ng). The variables breed, embryo stage and pregnancy did not influence the results of DNA concentration and CR. However, there was effective of negative pregnancy on the CR results (P=0,0187). It was concluded that there is no interference of breed and embryo stage in the quality of the sample submitted to genotyping, and the embryos with higher chances of implantation do not reflect high quality in the samples of genotyping biopsy-
Descrição: dc.description44 f.-
Formato: dc.formatapplication/pdf-
Idioma: dc.languagept_BR-
Direitos: dc.rightsOpen Access-
Direitos: dc.rightsCC-BY-SA-
Palavras-chave: dc.subjectBiopsia embrionária-
Palavras-chave: dc.subjectSeleção genômica,-
Palavras-chave: dc.subjectProdução in vitro de embriões,-
Palavras-chave: dc.subjectGir-
Palavras-chave: dc.subjectReprodução animal-
Palavras-chave: dc.subjectReprodução de bovino-
Palavras-chave: dc.subjectFertilização in vitro-
Palavras-chave: dc.subjectEmbryo biopsy-
Palavras-chave: dc.subjectGenomic selection-
Palavras-chave: dc.subjectEmbryo in vitro production-
Palavras-chave: dc.subjectGyr-
Título: dc.titleAvaliação da quantificação e genotipagem do DNA de biopsia de embriões bovinos produzidos In vitro-
Tipo de arquivo: dc.typeDissertação-
Aparece nas coleções:Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense - RiUFF

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