Algoritmos para o Cálculo de Estruturas de Proteínas

Registro completo de metadados
MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorOchi, Luiz Satoru-
Autor(es): dc.contributorCPF:31609080822-
Autor(es): dc.contributorhttp://lattes.cnpq.br/9171815778534257-
Autor(es): dc.contributorLavor, Carlile Campos-
Autor(es): dc.contributorCPF:31870800722-
Autor(es): dc.contributorhttp://lattes.cnpq.br/2019624495480547-
Autor(es): dc.contributorProtti, Fábio-
Autor(es): dc.contributorCPF:28907060422-
Autor(es): dc.contributorhttp://lattes.cnpq.br/5898801580033554-
Autor(es): dc.contributorNogueira, Loana Tito-
Autor(es): dc.contributorCPF:31110908022-
Autor(es): dc.contributorhttp://lattes.cnpq.br/2537709612833688-
Autor(es): dc.contributorMartins, Simone de Lima-
Autor(es): dc.contributorCPF:30120908222-
Autor(es): dc.contributorhttp://lattes.cnpq.br/5202429302236084-
Autor(es): dc.creatorSilva, Warley Gramacho da-
Data de aceite: dc.date.accessioned2024-07-11T17:37:13Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2024-07-11T17:37:13Z-
Data de envio: dc.date.issued2021-03-10-
Data de envio: dc.date.issued2009-03-05-
Data de envio: dc.date.issued2021-03-10-
Data de envio: dc.date.issued2008-04-04-
Fonte completa do material: dc.identifierhttps://app.uff.br/riuff/handle/1/17206-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/capes/753975-
Descrição: dc.descriptionOne of the most important problems in computational biology is the determination of the three-dimensional structure of a protein. This structure can be determined experimentally using NMR techniques. Generally, the NMR data provide only a sparse set of distances between atoms in a molecule. In this case the problem is to determine the three-dimensional structure of a molecule using a set of distances between certain pairs of atoms of the molecule, and is known as the molecular distance geometry problem which is generally expressed as a problem of continuous optimization. However, conditions for dealing with it as a combinatorial optimization problem were presented recently in the literature by using a discrete formulation. Two algorithms and two softwares for visualizing are proposed in this work. In order to test the algorithms we have used real and artificial instances-
Descrição: dc.descriptionCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior-
Descrição: dc.descriptionUm dos problemas mais importantes em biologia computacional é a determinação da estrutura tridimensional de uma proteína. Esta estrutura pode ser determinada experimentalmente através de téecnicas de RMN. Geralmente, dados de RMN provêem apenas um conjunto esparso de distâncias entre os átomos de uma molécula. Neste caso, o problema é determinar a estrutura tridimensional de uma molécula usando um conjunto de distâncias entre alguns pares de átomos da molécula. Na literatura, este problema é conhecido como Problema de Geometria das Distâncias em Moléculas e é geralmente formulado como um problema de otimização contíınua. Entretanto, recentemente, foram apresentadas condições para tratá-lo como um problema de otimização combinatória, através de uma formulaçãao discreta. Dois algoritmos e dois softwares de visualização são propostos nesta dissertação. Para testar os algoritmos, foram utilizadas instâncias artificiais e reais.-
Formato: dc.formatapplication/pdf-
Formato: dc.formatapplication/pdf-
Idioma: dc.languagept_BR-
Publicador: dc.publisherPrograma de Pós-Graduação em Computação-
Publicador: dc.publisherComputação-
Direitos: dc.rightsAcesso Aberto-
Direitos: dc.rightsCC-BY-SA-
Palavras-chave: dc.subjectComputação-
Palavras-chave: dc.subjectProblema de geometria das distâncias em moléculas-
Palavras-chave: dc.subjectEstrutura tridimensional de proteí&#305-
Palavras-chave: dc.subjectna-
Palavras-chave: dc.subjectBiologia computacional-
Palavras-chave: dc.subjectComputer science-
Palavras-chave: dc.subjectDiscretizable molecular distance geometry problem-
Palavras-chave: dc.subjectthree-dimensional structure of protein-
Palavras-chave: dc.subjectComputational biology-
Palavras-chave: dc.subjectCNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO-
Título: dc.titleAlgoritmos para o Cálculo de Estruturas de Proteínas-
Tipo de arquivo: dc.typeDissertação-
Aparece nas coleções:Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense - RiUFF

Não existem arquivos associados a este item.