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Metadados | Descrição | Idioma |
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Autor(es): dc.contributor | Neves, Felipe Piedade Gonçalves | - |
Autor(es): dc.contributor | Cerqueira, Aloysio de Mello Figueiredo | - |
Autor(es): dc.contributor | Barreto, Maria Lúcia | - |
Autor(es): dc.contributor | Pereira, Virginia Léo de Almeida | - |
Autor(es): dc.contributor | Silva, Rita de Cássia Figueira | - |
Autor(es): dc.creator | Brito, Samara Gomes de | - |
Data de aceite: dc.date.accessioned | 2024-07-11T17:34:49Z | - |
Data de disponibilização: dc.date.available | 2024-07-11T17:34:49Z | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2023-12-18 | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2023-12-18 | - |
Fonte completa do material: dc.identifier | http://app.uff.br/riuff/handle/1/31584 | - |
Fonte: dc.identifier.uri | http://educapes.capes.gov.br/handle/capes/753179 | - |
Descrição: dc.description | Doenças infecciosas em animais selvagens podem levar à morte de indivíduos, reduzindo a diversidade genética, causando o declínio da população e representando grande risco para espécies em perigo de extinção. Dentre as doenças bacterianas com grande potencial patogênico em aves selvagens, destacam-se os micoplasmas, Escherichia coli e Enterococcus spp. O caráter oportunista de micoplasmas, E. coli e Enterococcus spp. pode ocasionar enfermidades em aves imunossuprimidas, favorecer infecções secundárias, comprometer a vida selvagem e a humana, bem como a indústria avícola. Os objetivos deste estudo foram investigar a presença de Mycoplasma spp., E. coli e Enterococcus spp., avaliar perfil de resistência de E. coli e identificar as espécies dos isolados de micoplasmas obtidos de aves marinhas encontradas em praias do litoral brasileiro. Foram coletadas amostras de swabs de traqueia e de cloaca de 50 aves marinhas, provenientes de resgate por três centros de conservação e reabilitação de animais marinhos, localizados no Rio de Janeiro, São Paulo e Espírito Santo. As amostras de traqueia e cloaca foram submetidas ao cultivo para micoplasma, os isolados identificados pela PCR e os não caracterizadas na PCR para espécie-específicas foram sequenciados e realizada a análise filogenética. Para o cultivo de E. coli e Enterococcus spp., amostras de 47 cloacas foram utilizadas. Das colônias isoladas, foram selecionadas até cinco colônias características de E. coli e Enterococcus spp. para identificação pelo MALDI-TOF. As cepas de E. coli foram submetidas a triagem em placas de ágar MacConkey enriquecido com ceftriaxona, ágar MacConkey com ciprofloxacina, ágar cromogênico ESBL e ágar cromogênico KPC. Entre as cepas resistentes na triagem, houve a seleção de uma cepa com maior perfil de resistência por animal. Estas cepas foram submetidas ao teste de sensibilidade à 16 antimicrobianos, utilizados na clínica humana e veterinária, englobando a detecção fenotípica de ESBL. O teste foi realizado por difusão em disco, conforme CLSI. As cepas positivas fenotipicamente para ESBL foram submetidas a detecção dos genes blaCTX-M1, blaCTX-M2, blaCTX-M8. Das 50 aves estudadas, 36% (n=18) foram positivas para micoplasmas ao isolamento. Na PCR para gênero, 56% (n=28) das 50 aves foram positivas para Mycoplasma spp., tendo sido detectado 26% (n=13) na traqueia, 2% (n=1) na cloaca e 28% (n=14) em ambos os sítios. Na PCR especifica, M. gallisepticum foi detectado em 17,8% (5/28) e M. meleagridis em 17,8% (5/28). Ambas as espécies foram detectadas em 14,3% (4/28). Em 50% (14/28) das amostras não foi possível caracterizar a espécie de micoplasma na PCR e estas amostras foram sequenciadas, obtendo-se 10 sequências que apresentam cerca de 98% de similaridade a cepas detectadas em outras aves marinhas, separadas em três clusters. O primeiro próximo a M. meleagridis, o segundo a M. synoviae e o terceiro cluster, mais distante, agrupou o M. tully, M. gallisepticum e M. imitans. Das nove espécies de aves marinhas estudadas, quatro apresentaram micoplasmas no isolamento (Spheniscus magellanicus, Sula leucogaster, Larus dominicanus e Phalacrocorax brasilianus) e cinco na PCR, referindo-se Spheniscus magellanicus, Fregata magnificens, Sula leucogaster, Sula dactylatra e Phalacrocorax brasilianus. Um total de 185 cepas de E. coli foram isoladas e confirmadas em 85,1% (40/47) das amostras aves analisadas. Todas as cepas foram submetidas a triagem para perfil de resistência antimicrobiana, sendo identificadas 109 cepas. Destas, 40 cepas foram selecionadas para teste de sensibilidade frente a 16 antimicrobianos. A maioria (92,5%) apresentou resistência a pelo menos um antimicrobiano e 50% exibiram perfil de multirresistência a até seis classes de antimicrobianos. Seis cepas de E. coli foram positivas no teste fenotípico para ESBL, porém negativas quanto à presença de genes blaCTX-M dos subtipos 1, 2 e 8. Das 182 (84,6%) cepas confirmadas como Enterococcus spp., a mais encontrada foi E. faecalis (n=144) enquanto a menos encontrada foi E. avium (n=1) e E. casseliflavus (n=1), E. faecalis foi detectado em todas as espécies de aves estudadas. E. faecium e E. gallinarum foram identificados em Spheniscus magellanicus e Fregata magnificens, E. hirae em Spheniscus magellanicus, Sula leucogaster e Phalacrocorax brasilianus; E. avium foi identificado em um Spheniscus magellanicus e E. casseliflavus foi identificado apenas no Phalacrocorax brasilianus. Os micoplasmas estavam presentes na maioria dos animais estudados, a maior prevalência ocorreu, proporcionalmente, em Sula leucogaster (77,7%), enquanto a menor em Fregata magnificens (22,2%). Ao conhecimento dos autores, este é o primeiro registro de Mycoplasma meleagridis em Sula dactylatra, Sula leucogaster e Spheniscus magellanicus no Brasil. A análise filogenética identificou Mycoplasma spp adaptados a aves aquáticas. Cepas multirresistentes de E. coli e Enterococcus spp. estavam presentes nas aves estudadas, podendo atuar na sua disseminação | - |
Descrição: dc.description | Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoa de Nível Superior | - |
Descrição: dc.description | Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro | - |
Descrição: dc.description | Infectious diseases in wild animals can lead to the death of individuals, reducing genetic diversity, causing population decline, and posing a significant risk to endangered species. Among the bacterial diseases with high pathogenic potential in wild birds, mycoplasmas, Escherichia coli, and Enterococcus spp. stand out. The opportunistic nature of mycoplasmas, E. coli, and Enterococcus spp. can cause illnesses in immunosuppressed birds, promote secondary infections, compromise wildlife and human health, as well as the poultry industry. The aim of this study was to investigate the presence of Mycoplasma spp., E. coli, and Enterococcus spp., evaluate the antimicrobial resistance profile of E. coli and identify the species of mycoplasma isolates obtained from marine birds found on the Brazilian coast. Samples from tracheal and cloacal swabs of 50 marine birds, rescued by three marine animal conservation and rehabilitation centers located in Rio de Janeiro, São Paulo, and Espírito Santo, were collected. The tracheal and cloacal samples were cultured for mycoplasma, and the isolates were identified by PCR. Those not characterized by specie-specific PCR were sequenced, and phylogenetic analysis was performed. Samples from 47 cloacae were cultured for E. coli and Enterococcus spp. Up to five characteristic colonies of E. coli and Enterococcus spp. were selected for identification by MALDI-TOF. E. coli strains were screened on agar plates enriched with ceftriaxone, ciprofloxacin, chromogenic ESBL, and chromogenic KPC. Among the resistant strains, one strain per animal with the highest resistance profile was selected. These strains were subjected to sensitivity testing against 16 antimicrobials used in human and veterinary clinics, including phenotypic detection of ESBL, following the disk diffusion method as per CLSI guidelines. Out of the 50 studied birds, 36% (n=18) tested positive for mycoplasmas upon isolation. In the PCR for the genus, 56% (n=28) of the 50 birds were positive for Mycoplasma spp., with 26% (n=13) detected in the trachea, 2% (n=1) in the cloaca, and 28% (n=14) in both sites. In the specific PCR, M. gallisepticum was detected in 17.8% (5/28) and M. meleagridis in 17.8% (5/28). Both species were detected in 14.3% (4/28). In 50% (14/28) of the samples, the mycoplasma species could not be characterized by PCR. These samples were sequenced, resulting in 10 sequences showing about 98% similarity to strains detected in other marine birds, grouped into three clusters: the first close to M. meleagridis, the second to M. synoviae, and the third, more distant, clustering M. tully, M. gallisepticum, and M. imitans. Out of the nine species of marine birds studied, four showed mycoplasma isolates (Spheniscus magellanicus, Sula leucogaster, Larus dominicanus e Phalacrocorax brasilianus), and five tested positive in PCR, referring to Spheniscus magellanicus, Fregata magnificens, Sula leucogaster, Sula dactylatra e Phalacrocorax brasilianus. A total of 185 E. coli strains were isolated and confirmed in 85.1% (40/47) of the analyzed bird samples. All strains underwent screening for antimicrobial resistance, with 109 strains identified. Among them, 92.5% exhibited resistance to at least one antimicrobial, and 50% showed a multidrug-resistant profile against up to six classes of antimicrobials. Six E. coli strains tested positive phenotypically for ESBL but were negative for the presence of blaCTX-M genes of subtypes 1, 2, and 8. Out of the 182 (84.6%) confirmed Enterococcus spp. strains, E. faecalis was the most prevalent (n=144), while E. avium (n=1) and E. casseliflavus (n=1) were the least prevalent. E. faecalis was detected in all studied bird species. E. faecium and E. gallinarum were identified in Spheniscus magellanicus and Fregata magnificens, while E. hirae was found in Spheniscus magellanicus, Sula leucogaster e Phalacrocorax brasilianus. E. avium was identified in a Spheniscus magellanicus, and E. casseliflavus was found only in a Phalacrocorax brasilianus. Mycoplasmas were present in the majority of studied animals, with the highest detection rate proportionally found in Sula leucogaster (77.7%) and the lowest in Fregata magnificens (22.2%). To the authors' knowledge, this is the first record of Mycoplasma meleagridis in Sula dactylatra, Sula leucogaster, and Spheniscus magellanicus in Brazil. Phylogenetic analysis identified Mycoplasma spp. adapted to aquatic birds. Multidrug-resistant strains of E. coli and Enterococcus spp. were present in the studied birds, potentially contributing to their dissemination | - |
Descrição: dc.description | 52 f. | - |
Formato: dc.format | application/pdf | - |
Idioma: dc.language | pt_BR | - |
Direitos: dc.rights | Open Access | - |
Direitos: dc.rights | CC-BY-SA | - |
Palavras-chave: dc.subject | Aves marinhas | - |
Palavras-chave: dc.subject | Mycoplasma spp | - |
Palavras-chave: dc.subject | Escherichia coli | - |
Palavras-chave: dc.subject | Enterococcus spp | - |
Palavras-chave: dc.subject | Mycoplasma | - |
Palavras-chave: dc.subject | Aves | - |
Palavras-chave: dc.subject | Escherichia coli | - |
Palavras-chave: dc.subject | Enterococcus | - |
Palavras-chave: dc.subject | Marine birds | - |
Palavras-chave: dc.subject | Mycoplasma spp | - |
Palavras-chave: dc.subject | Escherichia coli | - |
Palavras-chave: dc.subject | Enterococcus spp | - |
Palavras-chave: dc.subject | Aves | - |
Título: dc.title | Detecção de Mycoplasma spp., Escherichia coli e Enterococcus spp. em aves marinhas de vida livre no litoral do Brasil | - |
Tipo de arquivo: dc.type | Dissertação | - |
Aparece nas coleções: | Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense - RiUFF |
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