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Padronização da técnica de extração do DNA com pelos de búfalos e análise da diversidade genética em um rebanho de búfalos utilizando marcadores microssatélite (SSRs)
Use este link compartilhar ou citar este material: http://educapes.capes.gov.br/handle/capes/663447
Registro completo de metadados
| Metadados | Descrição | Idioma |
|---|---|---|
| Autor(es): dc.contributor | Perseguini, Juliana Morini Küpper Cardoso | - |
| Autor(es): dc.contributor | Maeda, Emilyn Midori | - |
| Autor(es): dc.contributor | Kuhn, Betty Cristiane | - |
| Autor(es): dc.contributor | Montagner, Marcelo Marcos | - |
| Autor(es): dc.contributor | Hernández, Hilda Vanessa Poquioma | - |
| Autor(es): dc.contributor | Perseguini, Juliana Morini Küpper Cardoso | - |
| Autor(es): dc.creator | Neves, Andressa Santana | - |
| Data de aceite: dc.date.accessioned | 2022-02-21T21:54:40Z | - |
| Data de disponibilização: dc.date.available | 2022-02-21T21:54:40Z | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2020-11-12 | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2020-11-12 | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2018-11-27 | - |
| Fonte completa do material: dc.identifier | http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/11352 | - |
| Fonte: dc.identifier.uri | http://educapes.capes.gov.br/handle/capes/663447 | - |
| Descrição: dc.description | In Brazil, the herd of buffaloes is relatively low compared to other crops such as cattle herds. The largest herds of buffalo in Brazil are located in the northern region. Knowing the genetic variability contained in buffalo populations from different regions is essential for establishing a good breeding program. However, few studies using molecular markers in buffalo have been conducted. However, there are few works that make use of different tissues to obtain the DNA, fundamental material to realize this type of study. Thus, the objective of the present study was to perform the standardization of DNA extraction, to later make the analysis of genetic diversity with the microsatellite markers. The microsatellite markers that were used are multi-allelic and polymorphic, being efficient in the detection of molecular polymorphisms. Thirty animals were used to extract the total genomic DNA, and it was necessary to test three different protocols for the standardization of the extraction, being them; protocol with bovine blood, bee wing and 2 animal tissue. Afterwards PCR standardizations were performed to verify the best annealing temperature of the microsatellite primers. For the standardization of extraction the best protocol was the 2 animal tissue. The PCR reactions were performed by touchdown of 55 to 60 ° C, amplified in metaphor agarose gel. The data obtained through the genotyping of three molecular markers of the microsatellite type were analyzed by the Darwin program, separating into two different groups, showing that the animals used are genetically different. The PIC values were 0.5732 for the BL41 locus, 0.4786 for IDVGA 53 and 0.5149 for CSSM054, being shown to be an efficient marker for detecting polymorphism. However, a larger number of microsatellite markers should be used to verify the genetic diversity among the buffaloes evaluated, since the number of markers is still considered low to estimate the genetic variability that may actually exist between the genotypes. | - |
| Descrição: dc.description | No Brasil o rebanho de bubalinos é relativamente baixo se comparada com outras culturas como por exemplo o rebanho de bovinos. Os maiores rebanhos de búfalos no Brasil estão situados na região norte. Conhecer a variabilidade genética em populações de búfalos de diferentes regiões é essencial para estabelecer um bom programa de melhoramento genético. Contudo, poucos estudos utilizando marcadores moleculares em búfalos foram realizados. Todavia, existem poucos trabalhos que fazem uso de tecidos diferentes para obter o DNA, material fundamental para realizar este tipo de estudo. Desta forma, o objetivo do presente estudo foi realizar a padronização da extração de DNA, para posteriormente fazer a análise de diversidade genética com os marcadores microssatélites. Os marcadores microssatélites que foram utilizados são multialélicos e polimórficos, sendo eficientes na detecção de polimorfismos moleculares. Foram utilizados 30 animais para realização da extração do DNA genômico total, sendo que foram necessários realizar o teste de 3 protocolos diferentes para a padronização da extração, sendo eles; protocolo com sangue bovino, asa de abelha e 2 animal tissue. Em seguida foram realizadas padronizações de reações de PCR, para verificar a melhor temperatura de anelamento dos primers microssatélites. Para a padronização da extração o melhor protocolo foi o 2 animal tissue. As reações de PCR foram realizadas através de touchdown de 55 a 60°C, amplificados em gel de agarose metaphor. Os dados obtidos através da genotipagem de três marcadores moleculares do tipo microssatélites foram analisados pelo programa Darwin, separando em dois grupos diferentes, demostrando que os animais usados são geneticamente diferentes. Os valores de PIC foram 0,5732 para o loco BL41, 0,4786 para IDVGA 53 e 0,5149 para CSSM054, se mestrando ser um marcador eficiente para detectar polimorfismo. Entretanto, um número maior de marcadores microssatélites deverá ser utilizado para verificar a diversidade genética existente entre o conjunto de búfalos avaliados, pois o número de marcadores ainda é considerado baixo para estimar a variabilidade genética que possa de fato existir entre os genótipos. | - |
| Formato: dc.format | application/pdf | - |
| Idioma: dc.language | pt_BR | - |
| Publicador: dc.publisher | Universidade Tecnológica Federal do Paraná | - |
| Publicador: dc.publisher | Dois Vizinhos | - |
| Publicador: dc.publisher | Brasil | - |
| Publicador: dc.publisher | Bacharelado em Zootecnia | - |
| Publicador: dc.publisher | UTFPR | - |
| Direitos: dc.rights | embargoedAccess | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Búfalos | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Genética molecular | - |
| Palavras-chave: dc.subject | DNA | - |
| Palavras-chave: dc.subject | African buffalo | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Molecular genetics | - |
| Palavras-chave: dc.subject | CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::ZOOTECNIA | - |
| Título: dc.title | Padronização da técnica de extração do DNA com pelos de búfalos e análise da diversidade genética em um rebanho de búfalos utilizando marcadores microssatélite (SSRs) | - |
| Título: dc.title | Standardization of the technique of DNA extraction with buffalo hairs and analysis of genetic diversity in a herd of buffaloes using microsatellite markers (SSRs) | - |
| Tipo de arquivo: dc.type | livro digital | - |
| Aparece nas coleções: | Repositorio Institucional da UTFPR - RIUT | |
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