A distributed computation of Interpro Pfam, PROSITE and ProDom for protein annotation

Registro completo de metadados
MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.creatorRibeiro, Edward de Oliveira-
Autor(es): dc.creatorZerlotini, Gustavo G.-
Autor(es): dc.creatorLopes, Irving R. M.-
Autor(es): dc.creatorRibeiro, Victor B. R.-
Autor(es): dc.creatorMelo, Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de-
Autor(es): dc.creatorWalter, Maria Emília Machado Telles-
Autor(es): dc.creatorCosta, Marcos Mota-
Autor(es): dc.creatorBIOFOCO Network-
Data de aceite: dc.date.accessioned2021-10-14T17:32:56Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2021-10-14T17:32:56Z-
Data de envio: dc.date.issued2018-06-26-
Data de envio: dc.date.issued2018-06-26-
Data de envio: dc.date.issued2005-09-30-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://repositorio.unb.br/handle/10482/32103-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/capes/610505-
Descrição: dc.descriptionInterpro is a widely used tool for protein annotation in genome sequencing projects, demanding a large amount of computation and representing a huge time-consuming step. We present a strategy to execute programs using databases Pfam, PROSITE and ProDom of Interpro in a distributed environment using a Java-based messaging system. We developed a two-layer scheduling architecture of the distributed infrastructure. Then, we made experiments and analyzed the results. Our distributed system gave much better results than Interpro Pfam, PROSITE and ProDom running in a centralized platform. This approach seems to be appropriate and promising for highly demanding computational tools used for biological applications.-
Formato: dc.formatapplication/pdf-
Publicador: dc.publisherFUNPEC-RP-
Direitos: dc.rightsAcesso Aberto-
Direitos: dc.rightsGenetics and Molecular Research - Autorização concedida ao Repositório Institucional da Universidade de Brasília (RIUnB) pelo editor da revista, em 29 mar. 2016, com os seguintes termos: disponível sob Licença Creative Commons 4.0 International, que permite copiar, distribuir e transmitir o trabalho, desde que seja citado o autor e licenciante. Não permite o uso para fins comerciais nem a adaptação desta.-
Palavras-chave: dc.subjectProcessamento eletrônico de dados - processamento distribuído-
Palavras-chave: dc.subjectInterpro-
Palavras-chave: dc.subjectBiologia computacional-
Título: dc.titleA distributed computation of Interpro Pfam, PROSITE and ProDom for protein annotation-
Tipo de arquivo: dc.typelivro digital-
Aparece nas coleções:Repositório Institucional – UNB

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