Anatomical, computational and molecular analyses of vascularization in coffee peduncles of reproductive buds and fruits future perspectives for the Coffea arabica L.

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorChalfun Junior, Antonio-
Autor(es): dc.contributorFolter, Stefan de-
Autor(es): dc.contributorPereira , Luciano-
Autor(es): dc.contributorMagalhães, Thiago Alves-
Autor(es): dc.contributorMarchiori , Paulo Eduardo Ribeiro-
Autor(es): dc.creatorJaramillo Mesa, Andrea-
Data de aceite: dc.date.accessioned2026-02-09T11:47:18Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2026-02-09T11:47:18Z-
Data de envio: dc.date.issued2024-10-20-
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Data de envio: dc.date.issued2024-10-20-
Data de envio: dc.date.issued2024-10-20-
Data de envio: dc.date.issued2024-07-30-
Fonte completa do material: dc.identifierhttps://repositorio.ufla.br/handle/1/59582-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/capes/1147470-
Descrição: dc.descriptionCoffee beans are an agricultural commodity predominantly cultivated in tropical regions, supporting the livelihoods of millions. The flowering process of coffee plants is indispensable for bean development but often suffers from unevenness, resulting in inconsistent fruit maturation. This issue is particularly pronounced in Brazil, where mechanized harvesting blends unripe and ripe beans, negatively affecting quality. Moreover, non-uniform flowering complicates pest and disease management. Given the sensitivity of floral buds to water availability, understanding vascular development in reproductive organs, especially peduncles that connect inflorescences to branches, is necessary. Our study investigates the anatomical and molecular aspects of vascular development in coffee's reproductive organs through a combination of anatomical, molecular, and computational analyses. We performed in silico analyses to identify orthologous key genes involved in vascular development, such as Class III Homeodomain-Leucine Zipper (HB Zip III) and OCTOPUS (OPS) from Arabidopsis thaliana, and VASCULAR-RELATED NAC-DOMAIN7 (VND7) from Populus trichocarpa. Subsequently, we quantified the expression levels of these orthologous group members (HB, OPS, and VND7). Finally, we combined in silico analyses with a comprehensive study of peduncle vasculature across 16 stages, encompassing the development of flower buds, flowers, and fruits. Our findings deepen the understanding of vascular development in coffee, providing insights that could enhance cultivation practices by optimizing conditions for flowering and fruiting. This study aims to fill the knowledge gap regarding the anatomical and vascular development of coffee peduncles, offering a comprehensive view of their role in supporting the growth and maturation of coffee flowers and fruits.-
Descrição: dc.descriptionCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal do Nível Superior (CAPES)-
Descrição: dc.descriptionOs grãos de café são uma commodity agrícola predominantemente cultivada em regiões tropicais, sustentando os meios de subsistência de milhões de pessoas. O processo de floração das plantas de café é indispensável para o desenvolvimento dos grãos, mas frequentemente sofre com o desenvolvimento assincrônico, resultando em maturação inconsistente dos frutos. Esse problema é particularmente pronunciado no Brasil, onde a colheita mecanizada mistura grãos verdes e maduros, afetando negativamente a qualidade. Além disso, a floração não uniforme complica o manejo de pragas e doenças. Dada a sensibilidade dos botões florais à disponibilidade de água, compreender o desenvolvimento vascular nos órgãos reprodutivos, especialmente nos pedúnculos que conectam inflorescências aos ramos, é necessário. Nosso estudo investigou os aspectos anatômicos e moleculares do desenvolvimento vascular nos órgãos reprodutivos do café por meio de uma combinação de análises anatômicas, moleculares e computacionais. Realizamos análises in silico para identificar genes-chave envolvidos no desenvolvimento vascular, como os ortólogos pertencentes a família Homeodomain Leucine Zipper Class III (HB Zip III) e OCTOPUS (OPS) de Arabidopsis thaliana, e VASCULAR-RELATED NAC-DOMAIN7 (VND7) de Populus trichocarpa. Em seguida, quantificamos os níveis de expressão de genes pertencentes aos grupos ortólogos (HB, OPS e VND7) no café. Por fim, combinamos a análise in silico com um estudo abrangente da vasculatura dos pedúnculos em 16 estágios, incluindo o desenvolvimento de gemas florais, flores e frutos. Nossas descobertas aprofundam a compreensão do desenvolvimento vascular no café, fornecendo novas percepções que podem melhorar as práticas de cultivo, otimizando as condições para floração e frutificação. Este estudo visa preencher a lacuna de conhecimento sobre o desenvolvimento anatômico e vascular dos pedúnculos de café, oferecendo uma visão abrangente de seu papel no suporte ao crescimento e maturação das flores e frutos do cafeeiro.-
Formato: dc.formatapplication/pdf-
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Idioma: dc.languagept_BR-
Publicador: dc.publisherUniversidade Federal de Lavras-
Publicador: dc.publisherPrograma de Pós-graduação em Agronomia/Fisiologia Vegetal-
Publicador: dc.publisherUFLA-
Publicador: dc.publisherbrasil-
Publicador: dc.publisherDepartamento de Biologia-
Direitos: dc.rightsAttribution-NoDerivatives 4.0 International-
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Direitos: dc.rightsacesso aberto-
Direitos: dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by-nd/4.0/-
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Palavras-chave: dc.subjectAnálises anatômicas-
Palavras-chave: dc.subjectAnálises moleculares-
Palavras-chave: dc.subjectVasos condutores-
Palavras-chave: dc.subjectGene HB Zip III-
Palavras-chave: dc.subjectRNAseq-
Palavras-chave: dc.subjectPedúnculos florais-
Palavras-chave: dc.subjectVascularização-
Palavras-chave: dc.subjectAnatomical analyses-
Palavras-chave: dc.subjectMolecular analyses-
Palavras-chave: dc.subjectConducting vessels-
Palavras-chave: dc.subjectFloral peduncles-
Palavras-chave: dc.subjectVascularization-
Palavras-chave: dc.subjectFisiologia Vegetal-
Título: dc.titleAnatomical, computational and molecular analyses of vascularization in coffee peduncles of reproductive buds and fruits future perspectives for the Coffea arabica L.-
Título: dc.titleAnatomical, computational and molecular analyses of vascularization in coffee peduncles of reproductive buds and fruits: future perspectives for Coffea arabica L.-
Tipo de arquivo: dc.typetese-
Aparece nas coleções:Repositório Institucional da Universidade Federal de Lavras (RIUFLA)

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