
Atenção:
O eduCAPES é um repositório de objetos educacionais, não sendo responsável por materiais de terceiros submetidos na plataforma. O usuário assume ampla e total responsabilidade quanto à originalidade, à titularidade e ao conteúdo, citações de obras consultadas, referências e outros elementos que fazem parte do material que deseja submeter. Recomendamos que se reporte diretamente ao(s) autor(es), indicando qual parte do material foi considerada imprópria (cite página e parágrafo) e justificando sua denúncia.
Caso seja o autor original de algum material publicado indevidamente ou sem autorização, será necessário que se identifique informando nome completo, CPF e data de nascimento. Caso possua uma decisão judicial para retirada do material, solicitamos que informe o link de acesso ao documento, bem como quaisquer dados necessários ao acesso, no campo abaixo.
Todas as denúncias são sigilosas e sua identidade será preservada. Os campos nome e e-mail são de preenchimento opcional. Porém, ao deixar de informar seu e-mail, um possível retorno será inviabilizado e/ou sua denúncia poderá ser desconsiderada no caso de necessitar de informações complementares.
| Metadados | Descrição | Idioma |
|---|---|---|
| Autor(es): dc.creator | Fernandes-Brum, Christiane Noronha | - |
| Autor(es): dc.creator | Garcia, Bruno de Oliveira | - |
| Autor(es): dc.creator | Moreira, Rafael Oliveira | - |
| Autor(es): dc.creator | Ságio, Solange Aparecida | - |
| Autor(es): dc.creator | Barreto, Horllys Gomes | - |
| Autor(es): dc.creator | Lima, André Almeida | - |
| Autor(es): dc.creator | Freitas, Natália Chagas | - |
| Autor(es): dc.creator | Lima, Renato Ribeiro de | - |
| Autor(es): dc.creator | Carvalho, Carlos Henrique Siqueira de | - |
| Autor(es): dc.creator | Chalfun-Júnior, Antonio | - |
| Data de aceite: dc.date.accessioned | 2026-02-09T11:25:14Z | - |
| Data de disponibilização: dc.date.available | 2026-02-09T11:25:14Z | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2018-08-09 | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2018-08-09 | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2017-12 | - |
| Fonte completa do material: dc.identifier | https://repositorio.ufla.br/handle/1/29934 | - |
| Fonte completa do material: dc.identifier | https://link.springer.com/article/10.1007/s11295-017-1213-1 | - |
| Fonte: dc.identifier.uri | http://educapes.capes.gov.br/handle/capes/1140425 | - |
| Descrição: dc.description | The reliability of analyses using real-time quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) depends on the selection of appropriate reference genes to correct for sample-to-sample and run-to-run variations. The aim of the present study was to select the most suitable reference genes for gene expression analyses in tissue samples from coffee, Coffea arabica L. (Arabica) grown under well-watered (WW) and water-deficit (WD) conditions and C. canephora Pierre ex A. Froehner (Robusta) grown under WW conditions. Expression profiles and stabilities were evaluated for 12 reference genes in different tissues from C. arabica and for 8 genes in tissues from C. canephora. The web-based RefFinder tool, which combines the geNorm, NormFinder, Bestkeeper, and Delta-Ct algorithms, was employed to assess the stability of the tested genes. The most stable reference genes identified for all tissues grouped (WW/WD) of C. arabica were clathrin adaptor protein medium subunit (AP47), ubiquitin (UBQ), 60S ribosomal protein L39 (RPL39), and elongation factor 1α (EF1α), while class III alcohol dehydrogenase (ADH2), β-actin (ACT), glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), and ubiquitin (UBQ) genes were the most stable for all tissues grouped (WW) of C. canephora tissues. Validation by the expression level analysis of CaACO-like demonstrated that the use of the best and the worst set of reference genes produced different expression results. The results reinforce the general assumption that there is no universal reference gene and that it is essential to select the most appropriate gene for each individual experiment to apply adequate normalization procedures of RT-qPCR data. | - |
| Idioma: dc.language | en | - |
| Publicador: dc.publisher | Springer | - |
| Direitos: dc.rights | restrictAccess | - |
| ???dc.source???: dc.source | Tree Genetics & Genomes | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Coffea arabica | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Coffea canephora | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Coffee plants | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Reference genes | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Normalization | - |
| Título: dc.title | A panel of the most suitable reference genes for RT-qPCR expression studies of coffee: screening their stability under different conditions | - |
| Tipo de arquivo: dc.type | Artigo | - |
| Aparece nas coleções: | Repositório Institucional da Universidade Federal de Lavras (RIUFLA) | |
O Portal eduCAPES é oferecido ao usuário, condicionado à aceitação dos termos, condições e avisos contidos aqui e sem modificações. A CAPES poderá modificar o conteúdo ou formato deste site ou acabar com a sua operação ou suas ferramentas a seu critério único e sem aviso prévio. Ao acessar este portal, você, usuário pessoa física ou jurídica, se declara compreender e aceitar as condições aqui estabelecidas, da seguinte forma: