
Atenção:
O eduCAPES é um repositório de objetos educacionais, não sendo responsável por materiais de terceiros submetidos na plataforma. O usuário assume ampla e total responsabilidade quanto à originalidade, à titularidade e ao conteúdo, citações de obras consultadas, referências e outros elementos que fazem parte do material que deseja submeter. Recomendamos que se reporte diretamente ao(s) autor(es), indicando qual parte do material foi considerada imprópria (cite página e parágrafo) e justificando sua denúncia.
Caso seja o autor original de algum material publicado indevidamente ou sem autorização, será necessário que se identifique informando nome completo, CPF e data de nascimento. Caso possua uma decisão judicial para retirada do material, solicitamos que informe o link de acesso ao documento, bem como quaisquer dados necessários ao acesso, no campo abaixo.
Todas as denúncias são sigilosas e sua identidade será preservada. Os campos nome e e-mail são de preenchimento opcional. Porém, ao deixar de informar seu e-mail, um possível retorno será inviabilizado e/ou sua denúncia poderá ser desconsiderada no caso de necessitar de informações complementares.
| Metadados | Descrição | Idioma |
|---|---|---|
| Autor(es): dc.creator | Roesch, Luiz Fernando W. | - |
| Autor(es): dc.creator | Dobbler, Priscila T. | - |
| Autor(es): dc.creator | Pylro, Victor S. | - |
| Autor(es): dc.creator | Kolaczkowski, Bryan | - |
| Autor(es): dc.creator | Drew, Jennifer C. | - |
| Autor(es): dc.creator | Triplett, Eric W. | - |
| Data de aceite: dc.date.accessioned | 2026-02-09T11:15:50Z | - |
| Data de disponibilização: dc.date.available | 2026-02-09T11:15:50Z | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2020-03-25 | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2020-03-25 | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2020-03-07 | - |
| Fonte completa do material: dc.identifier | https://repositorio.ufla.br/handle/1/39391 | - |
| Fonte completa do material: dc.identifier | https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1755-0998.13116 | - |
| Fonte: dc.identifier.uri | http://educapes.capes.gov.br/handle/capes/1137131 | - |
| Descrição: dc.description | The data used for profiling microbial communities is usually sparse with some microbes having high abundance in a few samples and being nearly absent in others. However, current bioinformatics tools able to deal with this sparsity are lacking. pime (Prevalence Interval for Microbiome Evaluation) was designed to remove those taxa that may be high in relative abundance in just a few samples but have a low prevalence overall. The reliability and robustness of pime were compared against existing methods and tested using 16S rRNA independent data sets. pime filters microbial taxa not shared in a per treatment prevalence interval started at 5% prevalence with increasing increments of 5% at each filtering step. For each prevalence interval, hundreds of decision trees were calculated to predict the likelihood of detecting differences in treatments. The best prevalence‐filtered data set was user‐selected by choosing the prevalence interval that kept a large portion of the 16S rRNA sequences in the data set while also showing the lowest error rate. To obtain the likelihood of introducing type I error while building prevalence‐filtered data sets, an error detection step based was also included. A pime reanalysis of published data sets uncovered other expected microbial associations than previously reported, which may be masked when only relative abundance was considered. | - |
| Idioma: dc.language | en | - |
| Publicador: dc.publisher | Wiley | - |
| Direitos: dc.rights | restrictAccess | - |
| ???dc.source???: dc.source | Molecular Ecology Resources | - |
| Palavras-chave: dc.subject | 16S rRNA | - |
| Palavras-chave: dc.subject | core microbial taxa | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Microbial biomarkers | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Microbial prevalence | - |
| Título: dc.title | PIME: A package for discovery of novel differences among microbial communities | - |
| Tipo de arquivo: dc.type | Artigo | - |
| Aparece nas coleções: | Repositório Institucional da Universidade Federal de Lavras (RIUFLA) | |
O Portal eduCAPES é oferecido ao usuário, condicionado à aceitação dos termos, condições e avisos contidos aqui e sem modificações. A CAPES poderá modificar o conteúdo ou formato deste site ou acabar com a sua operação ou suas ferramentas a seu critério único e sem aviso prévio. Ao acessar este portal, você, usuário pessoa física ou jurídica, se declara compreender e aceitar as condições aqui estabelecidas, da seguinte forma: