Cadeia de Markov com estados latentes com aplicação em análises de seqüências de DNA

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorChaves, Lucas Monteiro-
Autor(es): dc.contributorSilva, Cibele Queiroz da-
Autor(es): dc.contributorSáfedi, Thelma-
Autor(es): dc.creatorOliveira, Deive Ciro de-
Data de aceite: dc.date.accessioned2026-02-09T11:14:36Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2026-02-09T11:14:36Z-
Data de envio: dc.date.issued2017-12-18-
Data de envio: dc.date.issued2017-12-18-
Data de envio: dc.date.issued2017-12-18-
Data de envio: dc.date.issued2005-02-28-
Fonte completa do material: dc.identifierhttps://repositorio.ufla.br/handle/1/28287-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/capes/1136686-
Descrição: dc.descriptionEsta dissertação/tese está disponível online com base na Resolução CEPE nº 090, de 24 de março de 2015, disponível em http://www.biblioteca.ufla.br/wordpress/wp-content/uploads/res090-2015.pdf, que dispõe sobre a disponibilização da coleção retrospectiva de teses e dissertações online no Repositório Institucional da UFLA, sem autorização prévia dos autores. Parágrafo Único. Caberá ao autor ou orientador a solicitação de restrição quanto à divulgação de teses e dissertações com pedidos de patente ou qualquer embargo similar. Art. 5º A obra depositada no RIUFLA que tenha direitos autorais externos à Universidade Federal de Lavras poderá ser removida mediante solicitação por escrito, exclusivamente do autor, encaminhada à Comissão Técnica da Biblioteca Universitária./ Arquivo gerado por meio da digitalização de material impresso. Alguns caracteres podem ter sido reconhecidos erroneamente.-
Descrição: dc.descriptionHidden Markov models (HMM's) are applied to locate segments with homogeneous C+G proportions (DNA sequence segmentation). The HMM's are showed in a didactic way and the methods ofan extended model are obtained. The isMalgorithm is used to obtain maximum-likehood estimators ofHMM's. A software that implement some HMMs methods was developed and applied to sequences fragments from Xylella fastidiosa, Escherichia coli, Streptococcus pneumoniae, Xanthomonas axonopodis pv. citri, and the complete genome of bacteriophage lambda. The results are discussed and compared with the research ofChurchill (1989) and da Silva (2003).-
Descrição: dc.descriptionA teoria das Cadeias de Markov com estados latentes, HMM's (hidden markov models\ é aplicada ao problema de discriminação de regiões homogêneas em seqüências de DNA. Uma abordagem didática é apresentada e os métodos de uma extensão do modelo são deduzidos. O algoritmo EM (ExpectationMaximization) é utilizado para obtenção de estimativas de máxima verossimilhança. Um software específico foi desenvolvido e aplicado na seqüência de DNA completa do vírus bacteriófago lambda, e em fragmentos do genoma das bactérias Xylella fastidiosa, Escherichia coli, Streptococcus pneumoniae, Xanthomonas axonopodis pv. citri. Os resultados obtidos são comparados com os trabalhos de Churchill (1989) e da Silva(2003).-
Formato: dc.formatapplication/pdf-
Idioma: dc.languagept_BR-
Publicador: dc.publisherUniversidade Federal de Lavras-
Publicador: dc.publisherPrograma de Pós-Graduação em Estatística e Experimentação Agropecuária-
Publicador: dc.publisherUFLA-
Publicador: dc.publisherbrasil-
Publicador: dc.publisherDepartamento de Ciências Exatas-
Direitos: dc.rightsacesso aberto-
Palavras-chave: dc.subjectModelo de Markov-
Palavras-chave: dc.subjectAnálise sequencial-
Palavras-chave: dc.subjectEstatística-
Palavras-chave: dc.subjectBiologia molecular-
Palavras-chave: dc.subjectEstatística-
Título: dc.titleCadeia de Markov com estados latentes com aplicação em análises de seqüências de DNA-
Título: dc.titleHidden Markov Chain with applicatíon in DNA sequence analysi-
Tipo de arquivo: dc.typedissertação-
Aparece nas coleções:Repositório Institucional da Universidade Federal de Lavras (RIUFLA)

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