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Metadados | Descrição | Idioma |
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Autor(es): dc.contributor | Cota, Renata Guerra de Sá | - |
Autor(es): dc.contributor | Cota, Renata Guerra de Sá | - |
Autor(es): dc.contributor | Cabral, Fernanda Janku | - |
Autor(es): dc.contributor | Gomes, Matheus de Souza | - |
Autor(es): dc.contributor | Jeremias, Vander de Jesus | - |
Autor(es): dc.contributor | Garcia, Camila Carrião Machado | - |
Autor(es): dc.creator | Rocha, Flávia Arêdes | - |
Data de aceite: dc.date.accessioned | 2025-08-21T15:52:31Z | - |
Data de disponibilização: dc.date.available | 2025-08-21T15:52:31Z | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2025-08-19 | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2024 | - |
Fonte completa do material: dc.identifier | https://www.repositorio.ufop.br/handle/123456789/20862 | - |
Fonte: dc.identifier.uri | http://educapes.capes.gov.br/handle/capes/1026254 | - |
Descrição: dc.description | Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia. Núcleo de Pesquisas em Ciências Biológicas, Pró-Reitoria de Pesquisa de Pós Graduação, Universidade Federal de Ouro Preto. | - |
Descrição: dc.description | A epigenética da interação parasito-hospedeiro é pouco explorada no contexto das parasitoses, incluindo a esquistossomose, cujo impacto social e econômico é grande. Modificações epigenéticas coordenadas por mantenedores epigenéticos, como metiltranferases/desmetilases de DNA e desacetilases de histonas, podem ser direta e indiretamente influenciados por moduladores epigenéticos, que são estímulos externos ao organismo ou à célula. Muitas moléculas liberadas por estágios de desenvolvimento do Schistosoma, podem ser efetores de modificações epigenéticas no hospedeiro definitivo, favorecendo processos de evasão do sistema imune e patologia da doença. Entre essas moléculas, os RNAs longos não codificantes (lncRNA) – RNAs regulatórios maiores de 200 nts com nenhuma ou baixa capacidade codificante – possuem grande potencial a serem biomarcadores. A patologia da esquistossomose, se concentra na fibrose hepática, mas ainda pouco se sabe sobre as regulações epigenéticas desse processo. Considerando esses fatores, esta tese foi desenvolvida para investigar extensivamente a epigenética na interação parasito-hospedeiro da esquistossomose. Para isso, foram analisadas 41 bibliotecas públicas de RNA-seq representando diferentes estágios do ciclo de vida do parasito (ovo, miracídio, esporocistos, cercária, esquistossômulo e verme adulto jovem), utilizando um pipeline de bioinformática atualizado para identificar e caracterizar lncRNAs em Schistosoma mansoni. Foram identificados 1.082 novos lncRNAs, dos quais MSTRG.5305.1, MSTRG.1246.3 e MSTRG.277.1 se destacaram por estarem coexpressos com genes relacionados à evasão imune e à interação parasito-hospedeiro. Além disso, três lncRNAs relacionados com o estágio de vermes jovens (MSTRG.5305.1, MSTRG.6595.5 e MSTRG.804.4) e quatro lncRNAs previamente identificados pelo grupo (Sm- lncRNAs19, 69, 72 e 76) foram validados experimentalmente. Os lncRNAs MSTRG.5305.1, MSTRG.6595.5 e MSTRG.804.4 apresentaram-se mais expressos em vermes adultos do que em cercária e por outro lado, o Sm-lncRNA19 e o Sm-lncRNA76 tiveram padrão inverso de expressão, sugerindo regulação estágio-específica. Os Sm-lncRNAs19 e 72 foram detectados em fígado e sangue de camundongos infectados, indicando seu potencial como biomarcadores da infecção. Na perspectiva do hospedeiro, foram analisadas amostras hepáticas de camundongos BALB/c infectados por S. mansoni (9 semanas pós-infecção). Verificou-se a desregulação de importantes mantenedores epigenéticos: entre os modificadores de DNA, Dnmt3b e Tet1 foram downreguladas, enquanto Tet3 foi upregulada; entre as desacetilases de histonas, Hdacs2, 5, 7, 10 e Sirts4, 5, 7 foram downreguladas, enquanto Hdacs4, 9, Sirts1 e 6 foram upreguladas. Os lncRNAs Malat1, H19 e Gas5 apresentaram expressão reduzida pela infecção. Esses achados reforçam a hipótese de que moléculas do hospedeiro, moduladas direta ou indiretamente pela presença do parasito, participam ativamente da regulação epigenética envolvida na resposta à infecção. Nesse sentido, os lncRNAs e os marcadores epigenéticos identificados emergem como plataformas biotecnológicas promissoras para diagnóstico e monitoramento da esquistossomose, uma vez que refletem alterações funcionais associadas à infecção e à progressão da fibrose hepática, com potencial aplicação translacional em estratégias moleculares não invasivas. O conhecimento gerado pode subsidiar o desenvolvimento de abordagens diagnósticas e terapêuticas mais eficazes para a esquistossomose mansoni. | - |
Descrição: dc.description | The epigenetics of host-parasite interaction is poorly explored in the context of parasitic diseases, including schistosomiasis, which has significant social and economic impact. Epigenetic modifications coordinated by epigenetic regulators, such as DNA methyltransferases/demethylases and histone deacetylases, can be directly and indirectly influenced by epigenetic modulators – external stimuli to the organism or cell. Many molecules released by developmental stages of Schistosoma may act as effectors of epigenetic modifications in the definitive host, promoting immune evasion and disease pathology. Among these molecules, long non-coding RNAs (lncRNAs) – regulatory RNAs longer than 200 nucleotides with little or no coding potential – have great potential as biomarkers. The pathology of schistosomiasis centers on hepatic fibrosis, but little is known about the epigenetic regulation of this process. Considering these factors, this thesis was developed to extensively investigate epigenetics in the parasite-host interaction of schistosomiasis. To this end, 41 public RNA-seq libraries representing different life cycle stages of the parasite (egg, miracidium, sporocysts, cercaria, schistosomulum, and young adult worm) were analyzed using an updated bioinformatics pipeline to identify and characterize lncRNAs in Schistosoma mansoni. A total of 1,082 novel lncRNAs were identified, among which MSTRG.5305.1, MSTRG.1246.3, and MSTRG.277.1 stood out for being co-expressed with genes related to immune evasion and parasite-host interaction. Additionally, three lncRNAs associated with the young worm stage (MSTRG.5305.1, MSTRG.6595.5, and MSTRG.804.4) and four lncRNAs previously identified by the group (Sm-lncRNAs19, 69, 72, and 76) were experimentally validated. The lncRNAs MSTRG.5305.1, MSTRG.6595.5, and MSTRG.804.4 showed higher expression in adult worms than in cercariae, whereas Sm-lncRNA19 and Sm-lncRNA76 exhibited the opposite expression pattern, suggesting stage-specific regulation. Sm-lncRNAs19 and 72 were detected in liver and blood of infected mice, indicating their potential as infection biomarkers. From the host perspective, liver samples from BALB/c mice infected with S. mansoni (9 weeks post-infection) were analyzed. Significant dysregulation of key epigenetic regulators was observed: among DNA modifiers, Dnmt3b and Tet1 were downregulated, while Tet3 was upregulated; among histone deacetylases, Hdacs2, 5, 7, 10 and Sirts4, 5, 7 were downregulated, whereas Hdacs4, 9, Sirts1 and 6 were upregulated. The lncRNAs Malat1, H19, and Gas5 showed reduced expression due to infection. These findings support the hypothesis that host molecules, modulated directly or indirectly by the parasite’s presence, actively participate in the epigenetic regulation involved in the infection response. In this context, the identified lncRNAs and epigenetic markers emerge as promising biotechnological platforms for the diagnosis and monitoring of schistosomiasis, as they reflect functional alterations associated with infection and progression of hepatic fibrosis, with potential translational application in non-invasive molecular strategies. The knowledge generated may support the development of more effective diagnostic and therapeutic approaches for S. mansoni infection. | - |
Formato: dc.format | application/pdf | - |
Idioma: dc.language | pt_BR | - |
Direitos: dc.rights | aberto | - |
Direitos: dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 United States | - |
Direitos: dc.rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/us/ | - |
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Palavras-chave: dc.subject | Esquistossomose | - |
Palavras-chave: dc.subject | Epigenética | - |
Palavras-chave: dc.subject | Biomarcadores | - |
Título: dc.title | LncRNAs e marcadores epigenéticos como plataformas biotecnológicas para diagnóstico e monitoramento da esquistossomose. | - |
Tipo de arquivo: dc.type | livro digital | - |
Aparece nas coleções: | Repositório Institucional - UFOP |
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