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RNAs não codificadores longos em Schistosoma mansoni : predição e perfil de expressão diferencial no estágio evolutivo de verme adulto.
Use este link compartilhar ou citar este material: http://educapes.capes.gov.br/handle/capes/1013514
Registro completo de metadados
| Metadados | Descrição | Idioma |
|---|---|---|
| Autor(es): dc.contributor | Cota, Renata Guerra de Sá | - |
| Autor(es): dc.contributor | Cota, Renata Guerra de Sá | - |
| Autor(es): dc.contributor | Freitas, Henrique Cota de | - |
| Autor(es): dc.contributor | Moreira, Leandro Marcio | - |
| Autor(es): dc.contributor | Gomes, Matheus de Souza | - |
| Autor(es): dc.contributor | Borges, William de Castro | - |
| Autor(es): dc.creator | Oliveira, Victor Fernandes de | - |
| Data de aceite: dc.date.accessioned | 2025-08-21T15:24:20Z | - |
| Data de disponibilização: dc.date.available | 2025-08-21T15:24:20Z | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2019-06-05 | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2019-06-05 | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2018 | - |
| Fonte completa do material: dc.identifier | http://www.repositorio.ufop.br/handle/123456789/11422 | - |
| Fonte: dc.identifier.uri | http://educapes.capes.gov.br/handle/capes/1013514 | - |
| Descrição: dc.description | Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia. Núcleo de Pesquisas em Ciências Biológicas, Pró-Reitoria de Pesquisa de Pós Graduação, Universidade Federal de Ouro Preto. | - |
| Descrição: dc.description | A esquistossomose é considerada uma doença debilitante de grande impacto socioeconômico no mundo causada por platelmintos do gênero Schistosoma. Uma das principais espécies identificadas nesse gênero é o parasita Schistosoma mansoni, que apresenta um ciclo de vida bastante complexo. Acredita-se que a complexidade dos programas de diferenciação e desenvolvimento observado entre os diferentes estágios evolutivos e ambientes onde o parasita vive seja dependente da regulação da expressão gênica. Os RNAs não codificantes representam uma das principais classes de moléculas que potencialmente controlam a regulação gênica nos níveis: epigenético, transcricional, pós-transcricional e traducional. Esses RNAs são divididos em dois grandes grupos, os RNAs pequenos não codificantes de proteína e os RNAs longos não codificantes (lncRNAs), o foco desse projeto. Os lncRNAs correspondem aos transcritos com mais de 200 nucleotídeos e que não codificam proteínas. Particularmente, estão envolvidos em diversas funções regulatórias celulares, como regular a transcrição, induzir o remodelamento da cromatina e modificações em histonas, originar siRNAs endógenos, modular atividades de proteínas, alterar a localização celular de proteínas, ser precursores de pequenos RNAs, entre outros. A hipótese desse trabalho é que o S. mansoni expresse um conjunto de lncRNAs de forma diferencial através da reprogramação de sua expressão gênica em determinados estágios evolutivos. Para investigá-la foi utilizado um conjunto de dados de RNA-seq disponível para a fase adulta do parasito objetivando: (i) a montagem de um pipeline para identificar e caracterizar lncRNAs a partir de dados de RNA-seq com alta confiança; (ii) classificar os novos lncRNAs preditos utilizando a anotação Gene Ontology; (iii) analisar a expressão de um conjunto de 20 lncRNAs em cercária, esquistossômulos com 3,5h de cultivo in vitro, machos, fêmeas, casal e ovos; (iv) analisar a expressão de lncRNAs em parasitos resistentes ao praziquantel e (v) analisar a expressão de lncRNAs em fígado de camundongo infectado e não infectado com S. mansoni. Foram identificados 170 novos Sm-lncRNAs com termos de ontologia relacionados ao metabolismo, transporte e biossíntese. Quinze dos preditos lncRNAs mostraram expressão diferencial nos estágios avaliados, bem como entre machos e fêmeas. Alguns apresentaram expressão diferencial em parasitos com resistência ao praziquantel e em fígado de camundongos infectados. Esses achados abrem novas perspectivas para estudos funcionais focados em resistência a essa droga e desenvolvimento de biomarcadores específicos para a esquistossomose. | - |
| Descrição: dc.description | Schistosomiasis is a debilitating disease of great socioeconomic impact in the world caused by flatworms of the genus Schistosoma. One of the main species identified in this genus is the parasite Schistosoma mansoni, which presents a very complex life cycle. The differentiation and development programs complexity observed among the different evolutionary stages and environments where the parasite lives depend on the gene expression. Non-coding RNAs represent one of the major classes of molecules that potentially control gene regulation at levels: epigenetic, transcriptional, post-transcriptional, and translational. These RNAs are divided into two large groups, the small non-coding RNAs and the long non-coding RNAs (lncRNAs), the focus of this study. The lncRNAs correspond to transcripts with more than 200 nucleotides and are not responsible for protein coding. In particular, they are involved in several cellular regulatory functions, such as regulating transcription, inducing chromatin remodeling and histone modifications, originating endogenous siRNAs, modulating protein activities, altering cell localization of proteins, being precursors of small RNAs and others functions. This study hypothesis is that S. mansoni expresses a set of lncRNAs differentially by reprogramming their gene expression at certain evolutionary stages. To investigate it, a set of available RNA-seq data was used for the adult phase of the parasite aiming at: (i) assembling a pipeline to identify and characterize lncRNAs from highly reliable RNA-seq data; (ii) classify the novel lncRNAs predicted using the Gene Ontology annotation; (iii) to analyze the expression of a set of 20 lncRNAs in cercariae, schistosomules with 3.5 h of in vitro culture, males, females, couple and eggs; (iv) to analyze the expression of lncRNAs in praziquantel resistant parasites and (v) to analyze the expression of lncRNAs in the liver of infected and uninfected S. mansoni mice. We identified 170 new Sm-lncRNAs with terms of ontology related to metabolism, transport and biosynthesis. Fifteen of them showed differential expression in the evaluated stages, as well as between males and females. Some showed differential expression in parasites with resistance to praziquantel and in liver of infected mice. These findings highlight new perspectives for functional studies focused on resistance to this drug and specific biomarkers development for schistosomiasis. | - |
| Formato: dc.format | application/pdf | - |
| Idioma: dc.language | pt_BR | - |
| Direitos: dc.rights | aberto | - |
| Direitos: dc.rights | Autorização concedida ao Repositório Institucional da UFOP pelo(a) autor(a) em 11/05/2018 com as seguintes condições: disponível sob Licença Creative Commons 4.0 que permite copiar, distribuir e transmitir o trabalho desde que sejam citados o autor e o licenciante. Não permite o uso para fins comerciais nem a adaptação. | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Schistosoma mansoni | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Regulação de expressão gênica | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Bioinformática | - |
| Título: dc.title | RNAs não codificadores longos em Schistosoma mansoni : predição e perfil de expressão diferencial no estágio evolutivo de verme adulto. | - |
| Tipo de arquivo: dc.type | livro digital | - |
| Aparece nas coleções: | Repositório Institucional - UFOP | |
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