Nuclear and chloroplast molecular markers for a tropical tree in dry forests.

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.creatorBrandão, Murilo Malveira-
Autor(es): dc.creatorVieira, Fábio de Almeida-
Autor(es): dc.creatorMoreira, Patrícia de Abreu-
Autor(es): dc.creatorFajardo, Cristiane Gouvêa-
Autor(es): dc.creatorMelo Júnior, Afrânio Farias de-
Autor(es): dc.creatorSantos, Rubens Manoel dos-
Autor(es): dc.creatorCarvalho, Dulcineia de-
Data de aceite: dc.date.accessioned2025-08-21T15:12:30Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2025-08-21T15:12:30Z-
Data de envio: dc.date.issued2024-10-04-
Data de envio: dc.date.issued2024-10-04-
Data de envio: dc.date.issued2022-
Fonte completa do material: dc.identifierhttps://www.repositorio.ufop.br/handle/123456789/18781-
Fonte completa do material: dc.identifierhttps://doi.org/10.5039/agraria.v18i3a3022-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/capes/1005897-
Descrição: dc.descriptionThe seasonal dry tropical forests (SDTFs) on limestone outcrops are peculiar formations subject to degradation by the removal of timber and exploitation of limestone for cement production. The species Ceiba pubiflora (Malvaceae) is conspicuous in limestone outcrops in Brazil. This work aimed to select nuclear primers Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) and chloroplast DNA (cpDNA) for application in studies aimed at genetic diversity and phylogeographic inferences in natural populations of C. pubiflora. After DNA extraction, the samples went through the polymerase chain reaction (PCR), electrophoresis and sequencing. We utilized a total of eight ISSR primers that exhibited the most optimal amplification profiles. This led to the identification of a combined total of 95 loci, along with the successful sequencing of five cpDNA regions, all achieving a satisfactory level of resolution. Thus, the selected molecular markers are suitable to study of the genetic diversity of populations and phylogeography of C. pubiflora and other species of the genus.-
Descrição: dc.descriptionAs florestas tropicais sazonalmente secas (FTSS) em afloramentos de calcário são formações peculiares sujeitas à degradação devido a extração de madeira e de calcário para produção de cimento. A espécie Ceiba pubiflora (Malvaceae) tem ocorrência comum em afloramentos calcários no Brasil. Este trabalho teve como objetivo selecionar primers do genoma nuclear Entre Sequencias Simples Repetidas (ISSR) e do DNA de cloroplasto (cpDNA) para aplicação em estudos de diversidade genética e inferências filogeográficas em populações naturais de C. pubiflora. Após a extração do DNA, as amostras foram submetidas à reação em cadeia da polimerase (PCR), eletroforese e sequenciamento. Ao todo, foram obtidos oito primers ISSR que apresentaram melhor perfil de amplificação, resultando em um total de 95 locus e cinco regiões de cpDNA sequenciadas com resolução satisfatória. Assim, os marcadores moleculares selecionados são adequados para subsidiar estudos de diversidade genética de populações e filogeografia de C. pubiflora e outras espécies do gênero.-
Formato: dc.formatapplication/pdf-
Idioma: dc.languageen-
Direitos: dc.rightsaberto-
Direitos: dc.rightsThis is an open-access article distributed under the Creative Commons Attribution 4.0 International License. Fonte: PDF do artigo.-
Palavras-chave: dc.subjectCeiba pubiflora-
Palavras-chave: dc.subjectConservation genetics-
Palavras-chave: dc.subjectDNA sequencing-
Palavras-chave: dc.subjectInter simple sequence repeat-
Título: dc.titleNuclear and chloroplast molecular markers for a tropical tree in dry forests.-
Título: dc.titleMarcadores moleculares nucleares e de cloroplasto para uma árvore tropical em florestas secas.-
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