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Desenvolvimento de marcadores moleculares microssatélites para espécie arbórea não modelo Pseudobombax marginatum.
Use este link compartilhar ou citar este material: http://educapes.capes.gov.br/handle/capes/1005531
Registro completo de metadados
| Metadados | Descrição | Idioma |
|---|---|---|
| Autor(es): dc.contributor | Moreira, Patrícia de Abreu | - |
| Autor(es): dc.contributor | Moreira, Patrícia de Abreu | - |
| Autor(es): dc.contributor | Campos, Victoria Rabelo | - |
| Autor(es): dc.contributor | Sant'Anna, Eneida Maria Eskinazi | - |
| Autor(es): dc.creator | Oliveira, Fernanda Lima de | - |
| Data de aceite: dc.date.accessioned | 2025-08-21T15:12:04Z | - |
| Data de disponibilização: dc.date.available | 2025-08-21T15:12:04Z | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2024-11-18 | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2024-11-18 | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2023 | - |
| Fonte completa do material: dc.identifier | https://www.repositorio.ufop.br/handle/123456789/19027 | - |
| Fonte: dc.identifier.uri | http://educapes.capes.gov.br/handle/capes/1005531 | - |
| Descrição: dc.description | Programa de Pós-Graduação em Ecologia de Biomas Tropicais. Departamento de Biodiversidade, Evolução e Meio Ambiente, Instituto de Ciências Exatas e Biológicas, Universidade Federal de Ouro Preto. | - |
| Descrição: dc.description | A Caatinga é um bioma exclusivamente brasileiro e tem sido bastante modificado por ações antrópicas, o que a torna um dos ambientes mais ameaçados do país com cerca de 13% de suas áreas desertificadas. Essas ameaças ao bioma colocam em risco a biodiversidade a ela associada, fazendo-se assim, importante, estudos sobre a diversidade e estrutura genética, para compreensão da viabilidade das espécies ali presente. Estudos com uso de marcadores moleculares do tipo microssatélites se mostram ferramentas ideais para obter informações como fluxo gênico, diversidade e estrutura genética, construção de mapas genômicos, entre outros e, por isso, já foram desenvolvidos para várias espécies arbóreas tropicais no Brasil. Desta forma, o presente estudo teve como objetivo desenvolver marcadores moleculares do tipo microssatélites para a espécie arbórea Pseudobombax marginatum, utilizando a tecnologia de sequenciamento de nova geração Illumina MiSeq. As sequências geradas foram utilizadas para identificar loci repetitivos potencialmente amplificáveis que, após filtrados e analisados, foram utilizados para o desenho de 16 iniciadores com motivos de repetição perfeitos. Destes, oito tiveram amplificação satisfatória com bandas polimórficas na etapa de otimização. A caracterização dos marcadores desenvolvidos utilizando 90 indivíduos revelou média de Ho menor do que o esperado (0,468 vs. 0,620) para os loci analisados indicando assim, desvio do equilibro de Hardy-Weinberg e sugerindo possível redução de heterozigotos o que foi evidencia pelo coeficiente de endogamia (Fis) positivo (0,224). Os valores de poder discriminativo e informativo demonstraram que os marcadores desenvolvidos são ferramentas altamente eficientes para a discriminação individual e possuem alto valor informativo. Dessa forma, o presente estudo alcançou seu objetivo ao desenvolver marcadores microssatélites eficientes e altamente informativos, os quais podem ser usados para levantar valiosas informações genéticas que podem subsidiar decisões cruciais para a conservação da espécie. | - |
| Descrição: dc.description | The Caatinga is an exclusively Brazilian biome and has been greatly modified by human actions, which makes it one of the most threatened environments in the country with around 13% of its areas desertified. These threats to the biome put the biodiversity associated with it at risk, making studies on diversity and genetic structure important for understanding the investigation of the species presented there. Studies using microsatellite-type molecular markers show ideal tools for obtaining information such as gene flow, diversity and genetic structure, construction of genomic maps, among others and, therefore, have already been developed for several tropical tree species in Brazil. Therefore, the present study aimed to develop microsatellite-type molecular markers for the tree species Pseudobombax marginatum, using the Illumina MiSeq new generation sequencing technology. The sequences generated were used to identify environmentally amplifiable repetitive sites that, after filtered and analyzed, were used to design 16 primers with perfect reproduction motifs. Of these, eight primers had satisfactory amplification with polymorphic bands in the optimization stage. The characterization of the markers developed using 90 individuals revealed a Ho mean lower than expected (0.468 vs. 0.620) for the loci analyzed, thus indicating a deviation from the Hardy-Weinberg equilibrium and suggesting a possible reduction in heterozygotes, which was evidenced by the coefficient of inbreeding (Fis) positive (0.224).The discriminative and informative power values reveal that the markers developed are highly efficient tools for individual discrimination and have high informative value. Thus, the present study achieved its objective by developing efficient and highly informative microsatellite markers, which can be used to gather valuable genetic information that can support crucial decisions for the conservation of the species. | - |
| Formato: dc.format | application/pdf | - |
| Idioma: dc.language | pt_BR | - |
| Direitos: dc.rights | aberto | - |
| Direitos: dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 United States | - |
| Direitos: dc.rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/us/ | - |
| Direitos: dc.rights | Autorização concedida ao Repositório Institucional da UFOP pelo(a) autor(a) em 11/11/2024 com as seguintes condições: disponível sob Licença Creative Commons 4.0 que permite copiar, distribuir e transmitir o trabalho, desde que sejam citados o autor e o licenciante. Não permite o uso para fins comerciais nem a adaptação. | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Caatinga | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Biodiversidade | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Malvácea | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Iniciadores | - |
| Título: dc.title | Desenvolvimento de marcadores moleculares microssatélites para espécie arbórea não modelo Pseudobombax marginatum. | - |
| Tipo de arquivo: dc.type | livro digital | - |
| Aparece nas coleções: | Repositório Institucional - UFOP | |
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