Sequenciamento parcial do Replicon pAZ6 de Azospirillum brasilense FP2

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorSouza, Emanuel Maltempi de, 1964--
Autor(es): dc.contributorFadel-Picheth, Cyntia Maria Telles, 1957--
Autor(es): dc.contributorUniversidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Ciências (Bioquímica)-
Autor(es): dc.creatorAndreazza, Ana Paula-
Data de aceite: dc.date.accessioned2025-09-01T11:34:11Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2025-09-01T11:34:11Z-
Data de envio: dc.date.issued2022-09-06-
Data de envio: dc.date.issued2022-09-06-
Data de envio: dc.date.issued2004-
Fonte completa do material: dc.identifierhttps://hdl.handle.net/1884/78534-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/1884/78534-
Descrição: dc.descriptionOrientadores: Dr. Emanuel M. de Souza e Dr.ª Cynthia M. T. Fadel Picheth-
Descrição: dc.descriptionDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Curso de Pós-Graduação em Bioquímica e Biologia Molecular-
Descrição: dc.descriptionInclui referências: p. 76-94-
Descrição: dc.descriptionResumo: A organização genômica das alfa-proteobactérias é altamente variável e geralmente muito complexa. O genoma da rizobactéria A. brasilense é composto de vários replicons variando de 100 a 3000 kb. Quatro destes replicons hibridizam com a sonda do gene 16S rDNA, sugerindo que A. brasilense possui vários cromossomos. O perfil eletroforético em campo pulsado do DNA intacto de Azospirillum brasilense estirpe FP2 obtido neste trabalho revelou dois novos replicons (de 745 e 785 kb), que não haviam sido descritos anteriormente, sugerindo que o tamanho genoma do Azospirillum brasilense estirpe FP2 é de aproximadamente 8,2 Mpb. O replicon de 630 Kb, denominado pAZ6, de A. brasilense é o menor da estirpe FP2 que hibridiza com a sonda do gene 16S rDNA. Neste estudo foi realizado o seqüenciamento parcial deste replicon. O pAZ6 foi isolado e purificado por eletroforese em campo pulsado utilizando o sistema CHEF-DRIII (Bio-Rad) e, posteriormente, o DNA extraído do gel de agarose foi amplificado usando o sistema TempliPhi (Amersham Biosciences), uma técnica não-PCR. O DNA amplificado foi utilizado para construir uma biblioteca genômica no vetor pCR4Blunt-TOPO. Os plasmídeos (1858) foram seqüenciados e as leituras de seqüências montadas em contíguos pelos programas PHRED/PHRAP e, em seguida, os contíguos formados foram analisados utilizando os programas FramePlot e BlastP. Os resultados revelaram que o replicon pAZ6 apresenta genes envolvidos em processos biossintéticos (parede celular, de vitamina BI2, lipídeos e nucleotídeos), metabolismo de piruvato, produção de energia, degradação de aminoácidos, metabolismo de carboidratos e de lipídeos, regulação transcricional, metabolismo nitrogenado, transporte de solutos e quimiotaxia. A categoria funcional mais representada entre os prováveis produtos gênicos do replicon foi a de transportadores. Os resultados sugerem fortemente que o replicon pAZ6 é parte essencial do genoma de A. brasilense estirpe FP2.-
Formato: dc.formatix, 94 f. : il., tabs.-
Formato: dc.formatapplication/pdf-
Formato: dc.formatapplication/pdf-
Relação: dc.relationDisponível em formato digital-
Palavras-chave: dc.subjectBioquímica-
Palavras-chave: dc.subjectAzospirillum brasilense-
Palavras-chave: dc.subjectTeses-
Palavras-chave: dc.subjectBioquímica-
Título: dc.titleSequenciamento parcial do Replicon pAZ6 de Azospirillum brasilense FP2-
Tipo de arquivo: dc.typelivro digital-
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