Avaliação do
Você é humano?
8
5
=
Denunciar conteúdo impróprio
Atenção:
O eduCAPES é um repositório de objetos educacionais, não sendo responsável por materiais de terceiros submetidos na plataforma. O usuário assume ampla e total responsabilidade quanto à originalidade, à titularidade e ao conteúdo, citações de obras consultadas, referências e outros elementos que fazem parte do material que deseja submeter. Recomendamos que se reporte diretamente ao(s) autor(es), indicando qual parte do material foi considerada imprópria (cite página e parágrafo) e justificando sua denúncia.
Caso seja o autor original de algum material publicado indevidamente ou sem autorização, será necessário que se identifique informando nome completo, CPF e data de nascimento. Caso possua uma decisão judicial para retirada do material, solicitamos que informe o link de acesso ao documento, bem como quaisquer dados necessários ao acesso, no campo abaixo.
Todas as denúncias são sigilosas e sua identidade será preservada. Os campos nome e e-mail são de preenchimento opcional. Porém, ao deixar de informar seu e-mail, um possível retorno será inviabilizado e/ou sua denúncia poderá ser desconsiderada no caso de necessitar de informações complementares.
Fenotipagem via NIR e predição genômica em Eucalyptus benthamii
Use este link compartilhar ou citar este material: http://educapes.capes.gov.br/handle/1884/48867
Registro completo de metadados
| Metadados | Descrição | Idioma |
|---|---|---|
| Autor(es): dc.contributor | Oliveira, Ricardo Augusto de | - |
| Autor(es): dc.contributor | Resende, Marcos Deon Vilela de | - |
| Autor(es): dc.contributor | Azevedo, Camila Ferreira | - |
| Autor(es): dc.contributor | Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Agronomia | - |
| Autor(es): dc.creator | Estopa, Regiane Abjaud | - |
| Data de aceite: dc.date.accessioned | 2019-08-22T00:01:27Z | - |
| Data de disponibilização: dc.date.available | 2019-08-22T00:01:27Z | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2018-04-16 | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2018-04-16 | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2017 | - |
| Fonte completa do material: dc.identifier | http://hdl.handle.net/1884/48867 | - |
| Fonte: dc.identifier.uri | http://educapes.capes.gov.br/handle/1884/48867 | - |
| Descrição: dc.description | Orientador : Dr. Ricardo Augusto de Oliveira | - |
| Descrição: dc.description | Coorientador : Dr. Marcos Deon Vilela de Resende, Dra. Camila Ferreira Azevedo | - |
| Descrição: dc.description | Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Agronomia. Defesa: Curitiba, 16/03/2017 | - |
| Descrição: dc.description | Inclui bibliografia: fl.92-104 | - |
| Descrição: dc.description | Área de concentração: Produção vegetal | - |
| Descrição: dc.description | Resumo: O melhoramento tradicional contribuiu por muitos anos para o aumento expressivo de produtividade do Eucalyptus no Brasil, porém, para completar um ciclo de melhoramento leva-se muito tempo. A seleção genômica tem apresentado potencial para acelerar os programas, e os melhoristas estão com uma expectativa grande sobre essa técnica, visto que une a biotecnologia com a genética quantitativa para acelerar a seleção genética. O objetivo principal desse trabalho foi validar biotecnologias que possam acelerar os ganhos de seleção dos programas de melhoramento genético de Eucalyptus benthamii. Para isso, foi avaliada a Seleção Genômica para caracteres de crescimento e qualidade da madeira. Também, foi realizada a caracterização não destrutiva da madeira por meio da espectroscopia de infravermelho próximo (NIR) para estimativa de densidade da madeira, dos teores de carboidratos totais, lignina e extrativos. Para o desenvolvimento dos modelos de seleção genômica ampla foi realizada a fenotipagem da população de 'treinamento' aos três anos de idade quanto ao volume de madeira, em seguida foi realizada a genotipagem utilizando marcadores moleculares do tipo SNPs em 780 indivíduos selecionados por meio de modelos mistos. Essa genotipagem foi processada utilizando um chip de alta densidade que resultou em 43.266 marcadores SNPs, após o controle de qualidade 27.462 marcas foram utilizadas para a estimativa dos efeitos. A predição de valores genéticos genômicos foi obtida para o caráter volume de madeira aos 3 de idade, e aos 4 anos para densidade da madeira, lignina, extrativos e carboidratos, utilizando o modelo RR-BLUP (Random Regression Best Linear Unbiased Predictor), sendo que as capacidades preditivas foram estimadas por diferentes metodologias de validação. A capacidade preditiva variou de 0,24 a 0,74 para volume de madeira aos três anos de idade. Para densidade básica da madeira, teor de lignina, extrativos e carboidratos, os valores de capacidade preditiva foram 0,44, 0,39, 0,33 e 0,35 respectivamente. Conclui-se que a seleção genômica ampla é aplicável para a espécie Eucalyptus benthamii. Com 2 a 5 mil marcadores consegue-se acessar a variabilidade para as características de crescimento e qualidade da madeira. A tecnologia NIR também se apresenta como uma potencial ferramenta para o programa de melhoramento de E. benthamii tornando possível a avaliação precoce e não destrutiva de características físico-químicas importantes para o processo de produção de polpa celulósica. Palavras-chave: Eucalyptus benthamii, Seleção Genômica; SNPs, espectroscopia near-infrared. | - |
| Descrição: dc.description | Abstract: Traditional breeding has contributed for many years to increase productivity of Eucalyptus in Brazil. However, the time to complete a breeding cycle is long and genomic selection has potential to accelerate programs. The breeders have a great expectation about this technique, because biotechnology works with quantitative genetics to accelerate the genetic selection. The main objective of this work was to evaluate biotechnologies that accelerate the genetic improvement program of Eucalyptus benthamii. For this, the study of the technique of genomic selection for traits of growth and wood quality was carried out. In addition, Eucalyptus benthamii wood was non-destructively characterized and the performance of near infrared spectroscopy (NIR) in estimating the wood basic density, lignin, extractive contents and total carbohydrates was evaluated. To develop genomic selection models was done the phenotyping of the training population with three years old for wood volume trait; the genotyped was done using SNPs molecular markers to 780 selected individuals by traditional BLUP. The genotyping was performed using a high density chip which resulted in 43,266 SNPs markers, after quality control marks 27,462 were used to estimate the effects of markers. The prediction ability was estimated by RR-BLUP model (Random Regression Best Linear Unbiased Predictor) with different validation methods by the new estimator for wood volume. The prediction model was developed at 4 years for wood density, lignin, extractives and carbohydrates, too. The prediction ability was 0,24 to 0,74 for wood volume at three years old. For wood density, lignin content, extractives and carbohydrates, the prediction ability was 0,44, 0,39, 0,33 e 0,35, respectively. In conclusion, the genome selection applies to the species of Eucalyptus benthamii. With 2000 to 5000 markers can be access the genetic variability of this population with good accuracy. And, the NIR technology presents itself as a potential tool for the E. benthamii breeding program, enabling the early and non-destructive evaluation of important physical and chemical wood features for the pulp production process and allowing cost reduction of chemical analysis, which may also be optimized. Keywords: Eucalytpus benthamii, Genomic selection, SNPs, near-infrared spectroscopy. | - |
| Formato: dc.format | 104 f. : il. algumas color., grafs., tabs. | - |
| Formato: dc.format | application/pdf | - |
| Formato: dc.format | application/pdf | - |
| Relação: dc.relation | Disponível em formato digital | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Agronomia | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Eucalipto - Melhoramento genético | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Genetica vegetal | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Biotecnologia vegetal | - |
| Título: dc.title | Fenotipagem via NIR e predição genômica em Eucalyptus benthamii | - |
| Tipo de arquivo: dc.type | livro digital | - |
| Aparece nas coleções: | Repositório Institucional - Rede Paraná Acervo | |
Não existem arquivos associados a este item.
O Portal eduCAPES é oferecido ao usuário, condicionado à aceitação dos termos, condições e avisos contidos aqui e sem modificações. A CAPES poderá modificar o conteúdo ou formato deste site ou acabar com a sua operação ou suas ferramentas a seu critério único e sem aviso prévio. Ao acessar este portal, você, usuário pessoa física ou jurídica, se declara compreender e aceitar as condições aqui estabelecidas, da seguinte forma:
- O Termo de Uso pode ser modificado pela CAPES a qualquer tempo, sem necessidade de notificação prévia, sendo que tais modificações serão válidas a partir da data de sua veiculação neste portal;
- Para aprovação de cadastro do usuário ao sistema, a CAPES pode requisitar o fornecimento de informações, haja vista a política de segurança adotada, objetivando resguardar a segurança dos usuários nesse ambiente virtual;
- O usuário aceita e declara compreender que, em razão do peculiar ambiente da Internet, a CAPES não poderá garantir que o acesso ao site seja livre de erros ou problemas decorrentes de casos fortuitos, internos ou externos, casos de força maior ou ainda de outros casos não inteiramente sujeitos a controle direto dos administradores do site e, portanto o usuário se obriga a isentar a CAPES de quaisquer reclamações ou indenizações. A CAPES também não se responsabiliza por interrupções, interceptações, invasões, disseminação de vírus ou outros atos ilícitos, típicos e atípicos de ambiente virtual, e de web, dos quais a CAPES não tenha tido intenção deliberada de participar ou praticar;
- O usuário aceita e declara compreender que qualquer texto, marca, áudio, imagem, ou conteúdo veiculados no site são protegidos por direitos de propriedade intelectual o qual deve ser respeitado de acordo com a licença concedida pelo respectivo detentor dos referidos direitos, sob pena de apuração das responsabilidades cabíveis;
-
Desta forma a CAPES se exime de toda e qualquer responsabilidade por eventuais perdas, danos e prejuízos de qualquer natureza decorrentes:
- Do descumprimento da lei, da moral e dos bons costumes, como consequência da transmissão, difusão, armazenamento, disponibilização, recepção, obtenção ou acesso aos conteúdos;
- Da infração aos direitos de propriedade intelectual e industrial, segredos empresariais, compromissos contratuais de qualquer tipo, direitos à honra, à intimidade pessoal e familiar, à imagem das pessoas, direitos de propriedade e de toda e qualquer natureza pertencentes a um terceiro por consequência da transmissão, difusão, armazenamento, disponibilização, recepção, obtenção ou acesso aos conteúdos;
- Da falta de veracidade, precisão, exatidão, pertinência e/ou atualidade dos conteúdos;
- Da inadequação para qual seja o propósito, ou da frustração, das expectativas geradas pelos conteúdos;
- Exceto quando mencionado explicitamente, ou quando se tratar de citação de material alheio ou ilustração, nos limites estabelecidos pela Lei 9.610/98, todo o Conteúdo textual original do Portal eduCAPES está disponível livremente para leitura, entre outros direitos, conforme definido na licença Creative Commons;
- A CAPES não se responsabiliza pelos comentários, opiniões, informações, depoimentos, mensagens, vídeos, textos, imagens, áudios ou qualquer outro tipo de conteúdo que sejam, postados, publicados e disponibilizados através do Portal eduCAPES pelos usuários, sendo a responsabilidade civil e criminal atribuída única e exclusivamente ao autor dos comentários, opiniões, informações, ou mensagens. Todo o conteúdo publicado por usuários são de responsabilidade exclusiva dos mesmos e de caráter completamente independente, sendo que todo e qualquer tipo de opinião, ideal e/ou posição expressados não refletem necessariamente o ponto de vista e a posição do Portal eduCAPES e/ou da CAPES. A CAPES se reserva o direito de armazenar as informações destes autores e/ou Usuários, a fim de viabilizar sua identificação;
- O usuário aceita e declara compreender que a CAPES poderá disponibilizar no Portal eduCAPES, links de acesso para outros sites e endereços virtuais administrados, controlados ou operados por terceiros. Qualquer site conectado a partir do eduCAPES não está sob o controle da CAPES;
- A CAPES não assume nenhuma responsabilidade ou obrigação por qualquer informação, comunicação ou material encontrado em tais sites, ou em qualquer site conectado a tais sites. A CAPES não assume qualquer responsabilidade pelos serviços ou funcionalidades ali dispostos, sendo a decisão de utilização e a forma de relacionamento com os mesmos de exclusiva responsabilidade do usuário, que inclusive isenta a CAPES de fiscalizar o conteúdo ou zelar pela integridade de tais sites ou endereços virtuais.
- O usuário aceita e declara compreender que o acesso a determinadas áreas do site será restrito. Para acessá-las, o usuário deverá fazer o login e cadastrar uma senha de acesso. A senha é individual, sigilosa e intransferível, sendo o usuário o único responsável pela guarda da mesma. O usuário assume toda e qualquer responsabilidade pelo mau uso ou pela utilização da senha por terceiros;
- A CAPES reserva o direito de excluir o cadastro, de excluir o material submetido ou proibir o acesso do usuário ao portal eduCAPES no caso de qualquer abuso ou indício de prática ilícita no uso do site ou de qualquer uso não autorizado ou proibido pelo usuário, nos termos da legislação brasileira;
- As condições estabelecidas no Termo de Aceite e Uso do Site são regidas pela lei brasileira. Sob nenhuma circunstância o usuário deverá violar qualquer lei usando o portal eduCAPES para propósitos que incluam, mas não limitados a isso, difamação ou perturbação de outros, violação de direitos de propriedade intelectual ou de terceiros, envio de material obsceno ou ofensivo, vírus, arquivos corrompidos, ou outros programas que poderiam danificar ou alterar este site ou os computadores de empresa ou de terceiros;
- A CAPES reserva o direito de retirar qualquer conteúdo que infrinja a lei, a moral e os bons costumes nos termos da legislação vigente e também na hipótese de o conteúdo não se coadunar com as finalidades educativas do Portal. A CAPES garante o direito de defesa e contraditório dos usuários. O usuário reconhece que o material enviado por terceiros, que não a CAPES, não é endossado pela mesma.
Concordo e desejo baixar o arquivo
Não concordo e não irei baixar o arquivo
Não concordo e não irei baixar o arquivo