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Metadados | Descrição | Idioma |
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Autor(es): dc.contributor | Raittz, Roberto Tadeu | - |
Autor(es): dc.contributor | Pedrosa, Fábio de Oliveira, 1947- | - |
Autor(es): dc.contributor | Universidade Federal do Paraná. Setor de Educação Profissional e Tecnológica. Programa de Pós-Graduação em Bioinformática | - |
Autor(es): dc.creator | Vialle, Ricardo Assunção | - |
Data de aceite: dc.date.accessioned | 2019-08-21T22:56:53Z | - |
Data de disponibilização: dc.date.available | 2019-08-21T22:56:53Z | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2014-03-20 | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2014-03-20 | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2013 | - |
Fonte completa do material: dc.identifier | http://hdl.handle.net/1884/34801 | - |
Fonte: dc.identifier.uri | http://educapes.capes.gov.br/handle/1884/34801 | - |
Descrição: dc.description | Resumo: Na Bioinformática, a comparação de sequências é uma tarefa essencial para diversas atividades e é onde geralmente se tem o maior custo computacional. A anotação de genomas é uma atividade que envolve tarefas distintas, dentre elas a comparação de sequências contra grandes bancos de dados. Este trabalho apresenta um sistema para anotação automática de genomas de procariotos chamado SILA e uma nova abordagem independente de alinhamento para busca e comparação de sequências de proteínas chamado Rapid Alignment Free Tool for Sequences Similarity Search (RAFTS3). O SILA combina duas ferramentas para realizar a predições de genes. Os genes preditos são comparados com três bancos de sequências de proteínas (NR, Pfam e COG) utilizando o RAFTS3 para buscar informações que possam inferir, através da semelhança de sequências, as funções dos genes. Os testes realizados mostraram que o RAFTS3 obteve resultados comparáveis ao BLASTp com desempenho até 500 vezes superior em buscas por sequências com alta similaridade contra grandes bancos. O SILA apresenta resultados de anotação comparáveis ao estado da arte com altas taxas de acerto na predição e identificação dos genes. O serviço de anotação está disponível em ambiente Web. | - |
Formato: dc.format | application/pdf | - |
Formato: dc.format | application/pdf | - |
Palavras-chave: dc.subject | Genoma humano | - |
Palavras-chave: dc.subject | Bioinformática | - |
Título: dc.title | SILA | - |
Tipo de arquivo: dc.type | livro digital | - |
Aparece nas coleções: | Repositório Institucional - Rede Paraná Acervo |
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