Model-based estimation of transmissibility and reinfection of SARS-CoV-2 P.1 variant

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorUniversidade Federal do ABC (UFABC)-
Autor(es): dc.contributorObservatório COVID-19 BR-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual de Campinas (UNICAMP)-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual Paulista (UNESP)-
Autor(es): dc.contributorSecretaria de Saúde de Florianópolis-
Autor(es): dc.contributorUniversidade de São Paulo (USP)-
Autor(es): dc.contributorCenters for Disease Control and Prevention-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Federal do Maranhão-
Autor(es): dc.contributorFaculdade de Ciências Médicas da Santa Casa de São Paulo-
Autor(es): dc.creatorCoutinho, Renato Mendes-
Autor(es): dc.creatorMarquitti, Flavia Maria Darcie-
Autor(es): dc.creatorFerreira, Leonardo Souto-
Autor(es): dc.creatorBorges, Marcelo Eduardo-
Autor(es): dc.creatorda Silva, Rafael Lopes Paixão-
Autor(es): dc.creatorCanton, Otavio-
Autor(es): dc.creatorPortella, Tatiana P.-
Autor(es): dc.creatorPoloni, Silas-
Autor(es): dc.creatorFranco, Caroline-
Autor(es): dc.creatorPlucinski, Mateusz M.-
Autor(es): dc.creatorLessa, Fernanda C.-
Autor(es): dc.creatorda Silva, Antônio Augusto Moura-
Autor(es): dc.creatorKraenkel, Roberto Andre-
Autor(es): dc.creatorde Sousa Mascena Veras, Maria Amélia-
Autor(es): dc.creatorPrado, Paulo Inácio-
Data de aceite: dc.date.accessioned2025-08-21T22:52:53Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2025-08-21T22:52:53Z-
Data de envio: dc.date.issued2025-04-29-
Data de envio: dc.date.issued2021-11-30-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.1038/s43856-021-00048-6-
Fonte completa do material: dc.identifierhttps://hdl.handle.net/11449/307794-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/11449/307794-
Descrição: dc.descriptionBackground: The SARS-CoV-2 variant of concern (VOC) P.1 (Gamma variant) emerged in the Amazonas State, Brazil, in November 2020. The epidemiological consequences of its mutations have not been widely studied, despite detection of P.1 in 36 countries, with local transmission in at least 5 countries. A range of mutations are seen in P.1, ten of them in the spike protein. It shares mutations with VOCs previously detected in the United Kingdom (B.1.1.7, Alpha variant) and South Africa (B.1.351, Beta variant). Methods: We estimated the transmissibility and reinfection of P.1 using a model-based approach, fitting data from the national health surveillance of hospitalized individuals and frequency of the P.1 variant in Manaus from December-2020 to February-2021. Results: Here we estimate that the new variant is about 2.6 times more transmissible (95% Confidence Interval: 2.4–2.8) than previous circulating variant(s). Manaus already had a high prevalence of individuals previously affected by the SARS-CoV-2 virus and our fitted model attributed 28% of Manaus cases in the period to reinfections by P.1, confirming the importance of reinfection by this variant. This value is in line with estimates from blood donors samples in Manaus city. Conclusions: Our estimates rank P.1 as one of the most transmissible among the SARS-CoV-2 VOCs currently identified, and potentially as transmissible as the posteriorly detected VOC B.1.617.2 (Delta variant), posing a serious threat and requiring measures to control its global spread.-
Descrição: dc.descriptionCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)-
Descrição: dc.descriptionUniversidade Federal do ABC-
Descrição: dc.descriptionObservatório COVID-19 BR-
Descrição: dc.descriptionUniversidade Estadual de Campinas-
Descrição: dc.descriptionUniversidade Estadual Paulista-
Descrição: dc.descriptionVigilância Epidemiológica Secretaria de Saúde de Florianópolis-
Descrição: dc.descriptionUniversidade de São Paulo-
Descrição: dc.descriptionCenters for Disease Control and Prevention-
Descrição: dc.descriptionUniversidade Federal do Maranhão-
Descrição: dc.descriptionFaculdade de Ciências Médicas da Santa Casa de São Paulo-
Descrição: dc.descriptionUniversidade Estadual Paulista-
Idioma: dc.languageen-
Relação: dc.relationCommunications Medicine-
???dc.source???: dc.sourceScopus-
Título: dc.titleModel-based estimation of transmissibility and reinfection of SARS-CoV-2 P.1 variant-
Tipo de arquivo: dc.typelivro digital-
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