Comparative chloroplast genomics and insights into the molecular evolution of Tanaecium (Bignonieae, Bignoniaceae)

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorUniversidade de São Paulo (USP)-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual Paulista (UNESP)-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Federal do Rio Grande do Sul-
Autor(es): dc.contributorBerkeley-
Autor(es): dc.creatorFrazão, Annelise-
Autor(es): dc.creatorThode, Verônica A.-
Autor(es): dc.creatorLohmann, Lúcia G.-
Data de aceite: dc.date.accessioned2025-08-21T18:13:10Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2025-08-21T18:13:10Z-
Data de envio: dc.date.issued2025-04-29-
Data de envio: dc.date.issued2023-11-30-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.1038/s41598-023-39403-z-
Fonte completa do material: dc.identifierhttps://hdl.handle.net/11449/306666-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/11449/306666-
Descrição: dc.descriptionSpecies of Tanaecium (Bignonieae, Bignoniaceae) are lianas distributed in the Neotropics and centered in the Amazon. Members of the genus exhibit exceptionally diverse flower morphology and pollination systems. Here, we sequenced, assembled, and annotated 12 complete and four partial chloroplast genomes representing 15 Tanaecium species and more than 70% of the known diversity in the genus. Gene content and order were similar in all species of Tanaecium studied, with genome sizes ranging between 158,470 and 160,935 bp. Tanaecium chloroplast genomes have 137 genes, including 80–81 protein-coding genes, 37 tRNA genes, and four rRNA genes. No rearrangements were found in Tanaecium plastomes, but two different patterns of boundaries between regions were recovered. Tanaecium plastomes show nucleotide variability, although only rpoA was hypervariable. Multiple SSRs and repeat regions were detected, and eight genes were found to have signatures of positive selection. Phylogeny reconstruction using 15 Tanaecium plastomes resulted in a strongly supported topology, elucidating several relationships not recovered previously and bringing new insights into the evolution of the genus.-
Descrição: dc.descriptionConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)-
Descrição: dc.descriptionFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)-
Descrição: dc.descriptionInternational Association for Plant Taxonomy-
Descrição: dc.descriptionSociety of Systematic Biologists-
Descrição: dc.descriptionAmerican Society of Plant Taxonomists-
Descrição: dc.descriptionCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Botânica Instituto de Biociências Universidade de São Paulo, SP-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Biodiversidade e Bioestatística Instituto de Biociências Universidade Estadual Paulista, SP-
Descrição: dc.descriptionPrograma de Pós-Graduação em Botânica Departamento de Botânica Instituto de Biociências Universidade Federal do Rio Grande do Sul, RS-
Descrição: dc.descriptionDepartment of Integrative Biology University and Jepson Herbaria University of California Berkeley-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Biodiversidade e Bioestatística Instituto de Biociências Universidade Estadual Paulista, SP-
Descrição: dc.descriptionCNPq: 142224/2015-4-
Descrição: dc.descriptionFAPESP: 2011/50859-2-
Descrição: dc.descriptionFAPESP: 2015/10914-5-
Descrição: dc.descriptionInternational Association for Plant Taxonomy: 2016-
Descrição: dc.descriptionSociety of Systematic Biologists: 2017-
Descrição: dc.descriptionAmerican Society of Plant Taxonomists: 2019-
Descrição: dc.descriptionCNPq: 310871/2017-4-
Descrição: dc.descriptionCAPES: Finance Code 001-
Idioma: dc.languageen-
Relação: dc.relationScientific Reports-
???dc.source???: dc.sourceScopus-
Título: dc.titleComparative chloroplast genomics and insights into the molecular evolution of Tanaecium (Bignonieae, Bignoniaceae)-
Tipo de arquivo: dc.typelivro digital-
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