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Metadados | Descrição | Idioma |
---|---|---|
Autor(es): dc.contributor | City of Hope National Medical Center | - |
Autor(es): dc.contributor | Universidade Estadual Paulista (UNESP) | - |
Autor(es): dc.contributor | Indian Institute of Science Education and Research Kolkata | - |
Autor(es): dc.contributor | Indian Institute of Science | - |
Autor(es): dc.contributor | North Carolina State University | - |
Autor(es): dc.contributor | University of Maryland Institute for Bioscience and Biotechnology Research | - |
Autor(es): dc.contributor | University of Maryl | - |
Autor(es): dc.contributor | Rice University | - |
Autor(es): dc.contributor | University of South Florida | - |
Autor(es): dc.contributor | the Russian Academy of Sciences | - |
Autor(es): dc.creator | Kulkarni, Prakash | - |
Autor(es): dc.creator | Leite, Vitor B. P. | - |
Autor(es): dc.creator | Roy, Susmita | - |
Autor(es): dc.creator | Bhattacharyya, Supriyo | - |
Autor(es): dc.creator | Mohanty, Atish | - |
Autor(es): dc.creator | Achuthan, Srisairam | - |
Autor(es): dc.creator | Singh, Divyoj | - |
Autor(es): dc.creator | Appadurai, Rajeswari | - |
Autor(es): dc.creator | Rangarajan, Govindan | - |
Autor(es): dc.creator | Weninger, Keith | - |
Autor(es): dc.creator | Orban, John | - |
Autor(es): dc.creator | Srivastava, Anand | - |
Autor(es): dc.creator | Jolly, Mohit Kumar | - |
Autor(es): dc.creator | Onuchic, Jose N. | - |
Autor(es): dc.creator | Uversky, Vladimir N. | - |
Autor(es): dc.creator | Salgia, Ravi | - |
Data de aceite: dc.date.accessioned | 2025-08-21T15:49:10Z | - |
Data de disponibilização: dc.date.available | 2025-08-21T15:49:10Z | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2025-04-29 | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2022-03-01 | - |
Fonte completa do material: dc.identifier | http://dx.doi.org/10.1063/5.0080512 | - |
Fonte completa do material: dc.identifier | https://hdl.handle.net/11449/301216 | - |
Fonte: dc.identifier.uri | http://educapes.capes.gov.br/handle/11449/301216 | - |
Descrição: dc.description | Intrinsically disordered proteins (IDPs) are proteins that lack rigid 3D structure. Hence, they are often misconceived to present a challenge to Anfinsen's dogma. However, IDPs exist as ensembles that sample a quasi-continuum of rapidly interconverting conformations and, as such, may represent proteins at the extreme limit of the Anfinsen postulate. IDPs play important biological roles and are key components of the cellular protein interaction network (PIN). Many IDPs can interconvert between disordered and ordered states as they bind to appropriate partners. Conformational dynamics of IDPs contribute to conformational noise in the cell. Thus, the dysregulation of IDPs contributes to increased noise and “promiscuous” interactions. This leads to PIN rewiring to output an appropriate response underscoring the critical role of IDPs in cellular decision making. Nonetheless, IDPs are not easily tractable experimentally. Furthermore, in the absence of a reference conformation, discerning the energy landscape representation of the weakly funneled IDPs in terms of reaction coordinates is challenging. To understand conformational dynamics in real time and decipher how IDPs recognize multiple binding partners with high specificity, several sophisticated knowledge-based and physics-based in silico sampling techniques have been developed. Here, using specific examples, we highlight recent advances in energy landscape visualization and molecular dynamics simulations to discern conformational dynamics and discuss how the conformational preferences of IDPs modulate their function, especially in phenotypic switching. Finally, we discuss recent progress in identifying small molecules targeting IDPs underscoring the potential therapeutic value of IDPs. Understanding structure and function of IDPs can not only provide new insight on cellular decision making but may also help to refine and extend Anfinsen's structure/function paradigm. | - |
Descrição: dc.description | Department of Medical Oncology and Therapeutics Research City of Hope National Medical Center | - |
Descrição: dc.description | Departamento de Física Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas Universidade Estadual Paulista (UNESP), São José do Rio Preto | - |
Descrição: dc.description | Department of Chemical Sciences Indian Institute of Science Education and Research Kolkata, West Bengal | - |
Descrição: dc.description | Translational Bioinformatics Center for Informatics Department of Computational and Quantitative Medicine City of Hope National Medical Center | - |
Descrição: dc.description | Center for Informatics Division of Research Informatics City of Hope National Medical Center | - |
Descrição: dc.description | Center for BioSystems Science and Engineering Indian Institute of Science | - |
Descrição: dc.description | Molecular Biophysics Unit Indian Institute of Science, Karnataka | - |
Descrição: dc.description | Department of Mathematics Indian Institute of Science | - |
Descrição: dc.description | Department of Physics North Carolina State University | - |
Descrição: dc.description | W. M. Keck Laboratory for Structural Biology University of Maryland Institute for Bioscience and Biotechnology Research | - |
Descrição: dc.description | Department of Chemistry and Biochemistry University of Maryl | - |
Descrição: dc.description | Center for Theoretical Biological Physics Rice University | - |
Descrição: dc.description | Department of Molecular Medicine College of Medicine Byrd Alzheimer's Institute University of South Florida | - |
Descrição: dc.description | Protein Research Group Institute for Biological Instrumentation the Russian Academy of Sciences | - |
Descrição: dc.description | Departamento de Física Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas Universidade Estadual Paulista (UNESP), São José do Rio Preto | - |
Idioma: dc.language | en | - |
Relação: dc.relation | Biophysics Reviews | - |
???dc.source???: dc.source | Scopus | - |
Título: dc.title | Intrinsically disordered proteins: Ensembles at the limits of Anfinsen's dogma | - |
Tipo de arquivo: dc.type | vídeo | - |
Aparece nas coleções: | Repositório Institucional - Unesp |
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