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Metadados | Descrição | Idioma |
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Autor(es): dc.contributor | University of Antwerp | - |
Autor(es): dc.contributor | University of California San Diego | - |
Autor(es): dc.contributor | Center for Advanced Technologies | - |
Autor(es): dc.contributor | University of Copenhagen | - |
Autor(es): dc.contributor | University of Connecticut | - |
Autor(es): dc.contributor | Arome Science inc. | - |
Autor(es): dc.contributor | The Scripps Research Institute | - |
Autor(es): dc.contributor | University of British Columbia | - |
Autor(es): dc.contributor | Research Triangle Park | - |
Autor(es): dc.contributor | Duke University School of Medicine | - |
Autor(es): dc.contributor | Duke University | - |
Autor(es): dc.contributor | Sookmyung Women’s University | - |
Autor(es): dc.contributor | Dongguk University | - |
Autor(es): dc.contributor | University of Luxembourg | - |
Autor(es): dc.contributor | Universidade Estadual Paulista (UNESP) | - |
Autor(es): dc.contributor | ICN | - |
Autor(es): dc.contributor | Interdisciplinary Institute for Artificial Intelligence (3iA) Côte d’Azur | - |
Autor(es): dc.contributor | European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) | - |
Autor(es): dc.contributor | University of Tuebingen | - |
Autor(es): dc.contributor | University of California Riverside | - |
Autor(es): dc.contributor | Wageningen University & Research | - |
Autor(es): dc.contributor | Kangwon National University | - |
Autor(es): dc.creator | Bittremieux, Wout | - |
Autor(es): dc.creator | Avalon, Nicole E. | - |
Autor(es): dc.creator | Thomas, Sydney P. | - |
Autor(es): dc.creator | Kakhkhorov, Sarvar A. | - |
Autor(es): dc.creator | Aksenov, Alexander A. | - |
Autor(es): dc.creator | Gomes, Paulo Wender P. | - |
Autor(es): dc.creator | Aceves, Christine M. | - |
Autor(es): dc.creator | Caraballo-Rodríguez, Andrés Mauricio | - |
Autor(es): dc.creator | Gauglitz, Julia M. | - |
Autor(es): dc.creator | Gerwick, William H. | - |
Autor(es): dc.creator | Huan, Tao | - |
Autor(es): dc.creator | Jarmusch, Alan K. | - |
Autor(es): dc.creator | Kaddurah-Daouk, Rima F. | - |
Autor(es): dc.creator | Kang, Kyo Bin | - |
Autor(es): dc.creator | Kim, Hyun Woo | - |
Autor(es): dc.creator | Kondić, Todor | - |
Autor(es): dc.creator | Mannochio-Russo, Helena | - |
Autor(es): dc.creator | Meehan, Michael J. | - |
Autor(es): dc.creator | Melnik, Alexey V. | - |
Autor(es): dc.creator | Nothias, Louis-Felix | - |
Autor(es): dc.creator | O’Donovan, Claire | - |
Autor(es): dc.creator | Panitchpakdi, Morgan | - |
Autor(es): dc.creator | Petras, Daniel | - |
Autor(es): dc.creator | Schmid, Robin | - |
Autor(es): dc.creator | Schymanski, Emma L. | - |
Autor(es): dc.creator | van der Hooft, Justin J. J. | - |
Autor(es): dc.creator | Weldon, Kelly C. | - |
Autor(es): dc.creator | Yang, Heejung | - |
Autor(es): dc.creator | Xing, Shipei | - |
Autor(es): dc.creator | Zemlin, Jasmine | - |
Autor(es): dc.creator | Wang, Mingxun | - |
Autor(es): dc.creator | Dorrestein, Pieter C. | - |
Data de aceite: dc.date.accessioned | 2025-08-21T22:58:19Z | - |
Data de disponibilização: dc.date.available | 2025-08-21T22:58:19Z | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2025-04-29 | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2023-11-30 | - |
Fonte completa do material: dc.identifier | http://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-44035-y | - |
Fonte completa do material: dc.identifier | https://hdl.handle.net/11449/301102 | - |
Fonte: dc.identifier.uri | http://educapes.capes.gov.br/handle/11449/301102 | - |
Descrição: dc.description | Despite the increasing availability of tandem mass spectrometry (MS/MS) community spectral libraries for untargeted metabolomics over the past decade, the majority of acquired MS/MS spectra remain uninterpreted. To further aid in interpreting unannotated spectra, we created a nearest neighbor suspect spectral library, consisting of 87,916 annotated MS/MS spectra derived from hundreds of millions of MS/MS spectra originating from published untargeted metabolomics experiments. Entries in this library, or “suspects,” were derived from unannotated spectra that could be linked in a molecular network to an annotated spectrum. Annotations were propagated to unknowns based on structural relationships to reference molecules using MS/MS-based spectrum alignment. We demonstrate the broad relevance of the nearest neighbor suspect spectral library through representative examples of propagation-based annotation of acylcarnitines, bacterial and plant natural products, and drug metabolism. Our results also highlight how the library can help to better understand an Alzheimer’s brain phenotype. The nearest neighbor suspect spectral library is openly available for download or for data analysis through the GNPS platform to help investigators hypothesize candidate structures for unknown MS/MS spectra in untargeted metabolomics data. | - |
Descrição: dc.description | Fulbright Association | - |
Descrição: dc.description | National Institutes of Health | - |
Descrição: dc.description | National Research Foundation of Korea | - |
Descrição: dc.description | Biotechnology and Biological Sciences Research Council | - |
Descrição: dc.description | Fonds National de la Recherche Luxembourg | - |
Descrição: dc.description | Agence Nationale de la Recherche | - |
Descrição: dc.description | U.S. Department of Energy | - |
Descrição: dc.description | Deutsche Forschungsgemeinschaft | - |
Descrição: dc.description | Gordon and Betty Moore Foundation | - |
Descrição: dc.description | Department of Computer Science University of Antwerp | - |
Descrição: dc.description | Scripps Institution of Oceanography University of California San Diego, La Jolla | - |
Descrição: dc.description | Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences University of California San Diego, La Jolla | - |
Descrição: dc.description | Collaborative Mass Spectrometry Innovation Center University of California San Diego, La Jolla | - |
Descrição: dc.description | Laboratory of Physical and Chemical Methods of Research Center for Advanced Technologies | - |
Descrição: dc.description | Department of Food Science Faculty of Science University of Copenhagen, Rolighedsvej 26 | - |
Descrição: dc.description | Department of Chemistry University of Connecticut | - |
Descrição: dc.description | Arome Science inc. | - |
Descrição: dc.description | Department of Immunology and Microbiology The Scripps Research Institute, La Jolla | - |
Descrição: dc.description | Department of Chemistry University of British Columbia | - |
Descrição: dc.description | Immunity Inflammation and Disease Laboratory Division of Intramural Research National Institute of Environmental Health Sciences National Institutes of Health Research Triangle Park | - |
Descrição: dc.description | Department of Psychiatry and Behavioral Sciences Duke University School of Medicine | - |
Descrição: dc.description | Department of Medicine Duke University | - |
Descrição: dc.description | Duke Institute of Brain Sciences Duke University | - |
Descrição: dc.description | College of Pharmacy and Research Institute of Pharmaceutical Sciences Sookmyung Women’s University | - |
Descrição: dc.description | College of Pharmacy and Integrated Research Institute for Drug Development Dongguk University | - |
Descrição: dc.description | Luxembourg Centre for Systems Biomedicine University of Luxembourg | - |
Descrição: dc.description | Department of Biochemistry and Organic Chemistry Institute of Chemistry São Paulo State University | - |
Descrição: dc.description | Université Côte d’Azur CNRS ICN | - |
Descrição: dc.description | Interdisciplinary Institute for Artificial Intelligence (3iA) Côte d’Azur | - |
Descrição: dc.description | European Molecular Biology Laboratory European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), Wellcome Genome Campus, Cambridge | - |
Descrição: dc.description | Interfaculty Institute of Microbiology and Infection Medicine University of Tuebingen | - |
Descrição: dc.description | Department of Biochemistry University of California Riverside | - |
Descrição: dc.description | Bioinformatics Group Wageningen University & Research | - |
Descrição: dc.description | Laboratory of Natural Products Chemistry College of Pharmacy Kangwon National University | - |
Descrição: dc.description | Department of Computer Science and Engineering University of California Riverside | - |
Descrição: dc.description | Department of Biochemistry and Organic Chemistry Institute of Chemistry São Paulo State University | - |
Descrição: dc.description | National Institutes of Health: 1R01AG069901-01A1 | - |
Descrição: dc.description | National Research Foundation of Korea: 2018R1A5A2023127 | - |
Descrição: dc.description | Biotechnology and Biological Sciences Research Council: 2152526 | - |
Descrição: dc.description | Fonds National de la Recherche Luxembourg: A18/BM/12341006 | - |
Descrição: dc.description | Agence Nationale de la Recherche: ANR-15-IDEX-01 | - |
Descrição: dc.description | U.S. Department of Energy: DE-AC02-05CH11231 | - |
Descrição: dc.description | Deutsche Forschungsgemeinschaft: EXC 2124 | - |
Descrição: dc.description | National Institutes of Health: F32AT011475 | - |
Descrição: dc.description | Gordon and Betty Moore Foundation: GBMF7622 | - |
Descrição: dc.description | National Research Foundation of Korea: NRF-2020R1C1C1004046 | - |
Descrição: dc.description | National Institutes of Health: P41 GM103484 | - |
Descrição: dc.description | National Institutes of Health: R03 CA211211 | - |
Descrição: dc.description | National Institutes of Health: U01AG061357 | - |
Descrição: dc.description | National Institutes of Health: U01AG061359 | - |
Descrição: dc.description | National Institutes of Health: U19 AG063744 | - |
Descrição: dc.description | National Institutes of Health: U19AG063744 | - |
Descrição: dc.description | National Institutes of Health: ZIC ES103363 | - |
Idioma: dc.language | en | - |
Relação: dc.relation | Nature Communications | - |
???dc.source???: dc.source | Scopus | - |
Título: dc.title | Open access repository-scale propagated nearest neighbor suspect spectral library for untargeted metabolomics | - |
Tipo de arquivo: dc.type | livro digital | - |
Aparece nas coleções: | Repositório Institucional - Unesp |
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