A new set of quantitative trait loci linked to lipid content in Coffea arabica

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Autor(es): dc.contributorUniversidade Tecnológica Federal do Paraná-
Autor(es): dc.contributorInstituto de Desenvolvimento Rural do Paraná-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual Paulista (UNESP)-
Autor(es): dc.contributorEmpresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA)-
Autor(es): dc.creatorMuniz, Herison Victor Lima-
Autor(es): dc.creatorAriyoshi, Caroline-
Autor(es): dc.creatorFerreira, Rafaelle Vecchia-
Autor(es): dc.creatorFelicio, Mariane Silva-
Autor(es): dc.creatorPereira, Luiz Filipe Protasio-
Data de aceite: dc.date.accessioned2025-08-21T16:18:52Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2025-08-21T16:18:52Z-
Data de envio: dc.date.issued2025-04-29-
Data de envio: dc.date.issued2023-12-31-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.1590/1984-70332024v24n2a25-
Fonte completa do material: dc.identifierhttps://hdl.handle.net/11449/300585-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/11449/300585-
Descrição: dc.descriptionLipids are compounds that play an important role in coffee bean development, contributing to beverage quality. Genome-wide association studies (GWAS) were conducted to pinpoint quantitative trait nucleotides (QTNs) linked to lipid metabolism in Coffea arabica. Genotyping by sequencing (GBS) and phenotyping data from 104 wild C. arabica accessions, Mundo Novo cultivar, and C. arabica var. Typica were utilized. GBS data were aligned to C. arabica Et039 reference genome, and both single-locus and multi-locus GWAS methods were employed. Methods were adjusted for kinship matrix, population structure, and principal component analysis. Of the 19 QTNs identified, 5 showed consistency across different population structure adjustments. The multi-locus methods mrMLM and FarmCPU proved more effective in identifying QTNs associated with lipid content. Four QTNs were situated near seven genes potentially involved in lipid metabolism. Higher frequencies of identified QTNs in accessions with elevated lipid content suggest their utility as markers for coffee plant breeding.-
Descrição: dc.descriptionConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)-
Descrição: dc.descriptionConsórcio Pesquisa Café-
Descrição: dc.descriptionUniversidade Tecnológica Federal do Paraná, Avenida Alberto Carazzai, 1640, Centro, PR-
Descrição: dc.descriptionInstituto de Desenvolvimento Rural do Paraná, Rodovia Celso Garcia Cid, km 375, Vivendas do Arvoredo, PR-
Descrição: dc.descriptionUniversidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho”, Rua Professor Doutor Antônio Celso Wagner Zanin, 250, Distrito de Rubião Junior, SP-
Descrição: dc.descriptionEmbrapa Café Parque Estação Biológica PQEB W3, DF-
Descrição: dc.descriptionUniversidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho”, Rua Professor Doutor Antônio Celso Wagner Zanin, 250, Distrito de Rubião Junior, SP-
Descrição: dc.descriptionConsórcio Pesquisa Café: 10.18.20.027.00-
Idioma: dc.languageen-
Relação: dc.relationCrop Breeding and Applied Biotechnology-
???dc.source???: dc.sourceScopus-
Palavras-chave: dc.subjectAllotetraploid-
Palavras-chave: dc.subjectcoffee-
Palavras-chave: dc.subjectGWAS-
Palavras-chave: dc.subjectSNP markers-
Título: dc.titleA new set of quantitative trait loci linked to lipid content in Coffea arabica-
Tipo de arquivo: dc.typelivro digital-
Aparece nas coleções:Repositório Institucional - Unesp

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