Caracterização pan-câncer da intercomunicação de células únicas do microambiente tumoral

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Autor(es): dc.contributorCarvalho, Robson Francisco-
Autor(es): dc.creatorCury, Sarah Santiloni-
Data de aceite: dc.date.accessioned2025-08-21T21:56:50Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2025-08-21T21:56:50Z-
Data de envio: dc.date.issued2024-08-05-
Data de envio: dc.date.issued2024-08-05-
Data de envio: dc.date.issued2024-08-02-
Fonte completa do material: dc.identifierhttps://hdl.handle.net/11449/256901-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/11449/256901-
Descrição: dc.descriptionO microambiente tumoral (MAT) facilita as interações celulares no câncer através de contato direto ou por fatores secretados (secretoma). Evidências destacam o papel central das células do MAT na secreção de fatores que modulam a infiltração e a função das células tumorais. A caquexia do câncer exemplifica as repercussões dessa interação complexa dentro do MAT. Esta síndrome complexa, marcada por declínio funcional e mortalidade, é desencadeada. Principalmente, for fatores do secretoma do MAT. No entanto, nenhum estudo foi conduzido para caracterizar o repertório global do secretoma das células individuais do MAT e seu perfil de interação induzido usando sequenciamento de RNA de célula única (scRNA-Seq) em vários tipos de tumor com prevalência variável de caquexia. Reanalisamos os dados de scRNA-Seq no banco de dados Cancer Curated Cell Atlas (3CA). Usando o pacote Seurat v.4.0.6, caracterizamos os perfis de expressão gênica do secretoma em 12 tipos de tumor. Isso envolveu a análise de cada população de células dentro do MAT, somando 245 amostras tumorais e 829.984 células únicas. Os genes de cada tipo celular foram filtrados usando a lista de genes do secretoma humano do banco de dados The Human Protein Atlas. Identificamos também interações cruciais secretoma-receptor correlacionadas com a caquexia do câncer usando o CellChat v.1.6.0. Selecionamos células malignas, células T, células B, macrófagos, fibroblastos, células dendríticas e células endoteliais para análise, considerando que foram encontradas na maioria dos tipos de câncer (> 8 tipos). Análises de comunicação célula-célula baseadas no secretoma demonstraram que a alta prevalência de caquexia se correlaciona com interações aumentadas promovidas por fibroblastos, macrófagos e células malignas. Essas interações também indicam o papel essencial do secretoma dos fibroblastos em cânceres com alta prevalência de caquexia, com o câncer pancreático, impactando o maior número de vias de comunicação célula-célula. Entre as probabilidades de interação, MDK expresso por fibroblastos e seu receptor SDC4, expressos por células malignas, correlacionam-se positivamente (0,89; p=0,003) com a prevalência de caquexia. Nosso estudo fornece uma abordagem pan-câncer para entender comunicações celulares promovidas pelo secretoma tumoral na caquexia associada ao câncer a nível de célula única. Ao caracterizar perfis de expressão específicos de célula e interações ligante-receptor cruciais, identificamos os fibroblastos como principal mediador, particularmente no câncer pancreático. Esses resultados podem guiar o desenvolvimento de terapias mais direcionadas para as interações relevantes no MAT de tipos de câncer altamente associados à síndrome.-
Descrição: dc.descriptionCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)-
Descrição: dc.description88887.891948/2023-00-
Formato: dc.formatapplication/pdf-
Formato: dc.formatapplication/pdf-
Idioma: dc.languageen-
Publicador: dc.publisherUniversidade Estadual Paulista (UNESP)-
Direitos: dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/restrictedAccess-
Palavras-chave: dc.subjectSequenciamento de RNA-
Palavras-chave: dc.subjectBioinformática-
Palavras-chave: dc.subjectSecretoma-
Título: dc.titleCaracterização pan-câncer da intercomunicação de células únicas do microambiente tumoral-
Título: dc.titlePan-cancer characterization of the intercommunication of single-cell from the tumor microenvironment-
Tipo de arquivo: dc.typeplanilha-
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