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| Metadados | Descrição | Idioma |
|---|---|---|
| Autor(es): dc.contributor | Carvalho, Robson Francisco | - |
| Autor(es): dc.creator | Mussatto, Caio Fernando Ferreira | - |
| Data de aceite: dc.date.accessioned | 2025-08-21T19:11:17Z | - |
| Data de disponibilização: dc.date.available | 2025-08-21T19:11:17Z | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2023-11-21 | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2023-11-21 | - |
| Data de envio: dc.date.issued | 2023-09-21 | - |
| Fonte completa do material: dc.identifier | https://hdl.handle.net/11449/251426 | - |
| Fonte: dc.identifier.uri | http://educapes.capes.gov.br/handle/11449/251426 | - |
| Descrição: dc.description | A caquexia, uma síndrome multifatorial caracterizada pela perda contínua de massa muscular esquelética, representa um desafio significativo na gestão do câncer, uma vez que afeta aproximadamente 80% dos pacientes com câncer avançado e tem impacto direto na sobrevivência. Este estudo aborda a necessidade premente de selecionar linhagens celulares apropriadas para investigações in vitro e pesquisa pré-clínica relacionadas à caquexia. Utilizando ferramentas de mineração de texto, Geneshot e Open Targets Platform, foram identificados 123 fatores indutores de caquexia (CIFs). Em seguida, sequenciamentos de células únicas (Single Cell RNA-seq) de 198 linhagens celulares foram obtidos, onde, usando o Celligner, selecionamos 84 linhagens celulares que possuíam uma maior correlação com tumores primários. Em seguida, utilizando a linguagem R e o pacote de feramentas, Seurat, realizamos a caracterização dos 101 CIFs presente nas linhagens. Em seguida, realizamos uma análise de correlação de Pearson, entre 10 tipos tumorais e 54 linhagens (linhagens dos mesmos tipos tumorais previamente selecionados), usando a expressão média escalada de 89 CIFs em comum, o que permitiu a identificação de 10 linhagens celulares que melhor recapitulam a caquexia, sendo uma para cada tipo tumoral. Os dados de RNA-seq revelaram 10 linhagens celulares altamente correlacionadas com a expressão dos CIFs em vários tipos de câncer, incluindo ovário, pulmão, nasofaringe, rim, cólon e mama. Essas linhagens surgiram como candidatas promissoras para estudos futuros devido as correlações estatisticamente significativas. A seleção criteriosa de linhagens celulares é de extrema importância para estudos in vitro sobre a caquexia associada ao câncer, uma vez que uma escolha inadequada pode levar a resultados insatisfatórios. Estudos anteriores destacaram a necessidade de aprimorar os métodos de seleção para garantir a representatividade das linhagens em relação aos tumores de interesse. O enfoque na expressão gênica dos CIFs mostrou ser uma estratégia valiosa na identificação das linhagens celulares mais relevantes. Este estudo contribui para o entendimento e tratamento da caquexia associada ao câncer, fornecendo uma base sólida para futuras pesquisas. A identificação de linhagens celulares representativas e a caracterização de genes associados à caquexia abrem caminho para abordagens terapêuticas mais direcionadas e avanços significativos no controle da síndrome. | - |
| Descrição: dc.description | Pró-Reitoria de Pesquisa (PROPe UNESP) | - |
| Formato: dc.format | application/pdf | - |
| Idioma: dc.language | pt_BR | - |
| Publicador: dc.publisher | Universidade Estadual Paulista (UNESP) | - |
| Direitos: dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Caquexia | - |
| Palavras-chave: dc.subject | scRNA-seq | - |
| Palavras-chave: dc.subject | CIFS | - |
| Palavras-chave: dc.subject | Linhagens celulares | - |
| Título: dc.title | Análises transcriptômicas em células únicas de fatores indutores de caquexia em linhagens celulares de câncer | - |
| Título: dc.title | Single-cell transcriptomic analysis of cachexia-inducing factors in cancer cell lines | - |
| Tipo de arquivo: dc.type | livro digital | - |
| Aparece nas coleções: | Repositório Institucional - Unesp | |
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