Genomic evaluation of commercial herds with different pedigree structures using the single-step genomic BLUP in Nelore cattle

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual Paulista (UNESP)-
Autor(es): dc.contributorUniversidade de São Paulo (USP)-
Autor(es): dc.contributorAssociação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP)-
Autor(es): dc.contributorInstituto Nacional de Pesquisa Agropecuária (INIA)-
Autor(es): dc.creatorLondoño-Gil, Marisol-
Autor(es): dc.creatorCardona-Cifuentes, Daniel-
Autor(es): dc.creatorEspigolan, Rafael-
Autor(es): dc.creatorPeripolli, Elisa-
Autor(es): dc.creatorLôbo, Raysildo B.-
Autor(es): dc.creatorPereira, Angélica S. C.-
Autor(es): dc.creatorAguilar, Ignacio-
Autor(es): dc.creatorBaldi, Fernando-
Data de aceite: dc.date.accessioned2025-08-21T23:41:37Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2025-08-21T23:41:37Z-
Data de envio: dc.date.issued2023-07-29-
Data de envio: dc.date.issued2023-07-29-
Data de envio: dc.date.issued2023-04-01-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.1007/s11250-023-03508-4-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11449/246883-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/11449/246883-
Descrição: dc.descriptionThe aim of this work was to evaluate the impact of applying genomic information in pedigree uncertainty situations on genetic evaluations for growth- and cow productivity–related traits in Nelore commercial herds. Records for accumulated cow productivity (ACP) and adjusted weight at 450 days of age (W450) were used, as well as genotypes of registered and commercial herd animals, genotyped with the Clarifide Nelore 3.1 panel (~29,000 SNPs). The genetic values for commercial and registered populations were estimated using different approaches that included (ssGBLUP) or did not include genomic information (BLUP), with different pedigree structures. Different scenarios were tested, varying the proportion of young animals with unknown sires (0, 25, 50, 75, and 100%), and unknown maternal grandsires (0, 25, 50, 75, and 100%). The prediction accuracies and abilities were calculated. The estimated breeding value accuracies decreased as the proportion of unknown sires and maternal grandsires increased. The genomic estimated breeding value accuracy using the ssGBLUP was higher in scenarios with a lower proportion of known pedigree when compared to the BLUP methodology. The results obtained with the ssGBLUP showed that it is possible to obtain reliable direct and indirect predictions for young animals from commercial herds without pedigree structure.-
Descrição: dc.descriptionFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)-
Descrição: dc.descriptionFaculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Via de Acesso Prof. Paulo Donato Castellane s/n, CEP, SP-
Descrição: dc.descriptionFaculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos Universidade de São Paulo, Av. Duque de Caxias Norte, 225m Campus Fernando Costa – USP, CEP, SP-
Descrição: dc.descriptionAssociação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP), Rua João Godoy, 463, Jardim América, CEP, SP-
Descrição: dc.descriptionFaculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia Universidade de São Paulo, Av. Duque de Caxias Norte, 225 Campus Fernando Costa Jardim Elite, CEP, SP-
Descrição: dc.descriptionInstituto Nacional de Pesquisa Agropecuária (INIA), CEP 90200-
Descrição: dc.descriptionFaculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Via de Acesso Prof. Paulo Donato Castellane s/n, CEP, SP-
Descrição: dc.descriptionFAPESP: 2016/22751-6-
Idioma: dc.languageen-
Relação: dc.relationTropical Animal Health and Production-
???dc.source???: dc.sourceScopus-
Palavras-chave: dc.subjectBeef cattle-
Palavras-chave: dc.subjectGenomic prediction-
Palavras-chave: dc.subjectGenomic selection-
Palavras-chave: dc.subjectPedigree uncertainty-
Título: dc.titleGenomic evaluation of commercial herds with different pedigree structures using the single-step genomic BLUP in Nelore cattle-
Tipo de arquivo: dc.typelivro digital-
Aparece nas coleções:Repositório Institucional - Unesp

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