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Metadados | Descrição | Idioma |
---|---|---|
Autor(es): dc.contributor | Domingues, Douglas Silva | - |
Autor(es): dc.contributor | Universidade Estadual Paulista (UNESP) | - |
Autor(es): dc.creator | Barros, Gian Carlos Costa | - |
Data de aceite: dc.date.accessioned | 2025-08-21T20:43:46Z | - |
Data de disponibilização: dc.date.available | 2025-08-21T20:43:46Z | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2022-07-14 | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2022-07-14 | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2019 | - |
Fonte completa do material: dc.identifier | http://hdl.handle.net/11449/235623 | - |
Fonte: dc.identifier.uri | http://educapes.capes.gov.br/handle/11449/235623 | - |
Descrição: dc.description | Muitos dos genes identificados hoje nos genomas completos, por possuírem função desconhecida, são chamados coletivamente de DUFs (em inglês, “Domains of unknown function”). Um exemplo é a família DUF92 (código Interpro IPR009724) que corresponde a proteínas transmembrana representadas por genes de cópia única em animais. No entanto, a planta modelo Arabidopsis thaliana possui dois genes parálogos com este domínio, que tiveram suas funções descobertas recentemente. Um deles, At5g19930 (AtPGR), é sugerido como um potencial regulador responsivo à glicose no metabolismo de carboidratos nas plantas e é pouco expresso em órgãos que fazem fotossíntese. O outro parálogo, At1g78620 (VTE6), é um gene crucial na biossíntese de tocoferol (vitamina E), com alta expressão em folhas. Não se sabe, até o momento, qual a organização genômica de genes com domínio DUF92 em outras espécies vegetais com genoma sequenciado. Com isso, o objetivo do trabalho foi elucidar a história evolutiva do domínio DUF92 em plantas, para verificar se a duplicação e especialização presente no genoma de A. thaliana é um fenômeno também presente em outras espécies vegetais. Encontramos 51 genes codificantes do domínio DUF92 em 17 espécies vegetais angiospermas, das quais 10 espécies são eudicotiledôneas e sete monocotiledôneas além da angiosperma basal Amborella trichopoda. Em uma análise filogenética por máxima verossimilhança foi evidenciado a formação de dois grupos filogenéticos na família gênica que refletem o perfil observado em Arabidopsis - denominados aqui como clado PGR e clado VTE6. Identificou-se que em monocotiledôneas há uma uma aparente expansão do clado PGR em relação as eudicotiledôneas. A partir de dados públicos de RNA-seq observamos que genes do o clado PGR apresenta maiores níveis de expressão em raiz em comparação a folha, enquanto o clado VTE6 apresentou um perfil oposto de expressão, sugerindo subfuncionalização dos genes parálogos aqui analisados. Com isso, este estudo realizou uma classificação diferencial das sequências DUF92 e a indicação de subfamílias dentro dessa família multigênica. | - |
Descrição: dc.description | Não recebi financiamento | - |
Formato: dc.format | application/pdf | - |
Idioma: dc.language | pt_BR | - |
Publicador: dc.publisher | Universidade Estadual Paulista (UNESP) | - |
Direitos: dc.rights | info:eu-repo/semantics/restrictedAccess | - |
Palavras-chave: dc.subject | Biologia molecular | - |
Palavras-chave: dc.subject | Genética vegetal | - |
Palavras-chave: dc.subject | Evolução molecular | - |
Palavras-chave: dc.subject | DUF92 | - |
Palavras-chave: dc.subject | Genômica comparativa | - |
Palavras-chave: dc.subject | Família multigênica | - |
Título: dc.title | Relações evolutivas na família gênica DUF92 em plantas: uma abordagem genômica comparativa e transcricional | - |
Título: dc.title | Evolutionary relationships in the DUF92 gene family in plants: a comparative genomic and transcriptional approach | - |
Tipo de arquivo: dc.type | livro digital | - |
Aparece nas coleções: | Repositório Institucional - Unesp |
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