Relações evolutivas na família gênica DUF92 em plantas: uma abordagem genômica comparativa e transcricional

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorDomingues, Douglas Silva-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual Paulista (UNESP)-
Autor(es): dc.creatorBarros, Gian Carlos Costa-
Data de aceite: dc.date.accessioned2025-08-21T20:43:46Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2025-08-21T20:43:46Z-
Data de envio: dc.date.issued2022-07-14-
Data de envio: dc.date.issued2022-07-14-
Data de envio: dc.date.issued2019-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11449/235623-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/11449/235623-
Descrição: dc.descriptionMuitos dos genes identificados hoje nos genomas completos, por possuírem função desconhecida, são chamados coletivamente de DUFs (em inglês, “Domains of unknown function”). Um exemplo é a família DUF92 (código Interpro IPR009724) que corresponde a proteínas transmembrana representadas por genes de cópia única em animais. No entanto, a planta modelo Arabidopsis thaliana possui dois genes parálogos com este domínio, que tiveram suas funções descobertas recentemente. Um deles, At5g19930 (AtPGR), é sugerido como um potencial regulador responsivo à glicose no metabolismo de carboidratos nas plantas e é pouco expresso em órgãos que fazem fotossíntese. O outro parálogo, At1g78620 (VTE6), é um gene crucial na biossíntese de tocoferol (vitamina E), com alta expressão em folhas. Não se sabe, até o momento, qual a organização genômica de genes com domínio DUF92 em outras espécies vegetais com genoma sequenciado. Com isso, o objetivo do trabalho foi elucidar a história evolutiva do domínio DUF92 em plantas, para verificar se a duplicação e especialização presente no genoma de A. thaliana é um fenômeno também presente em outras espécies vegetais. Encontramos 51 genes codificantes do domínio DUF92 em 17 espécies vegetais angiospermas, das quais 10 espécies são eudicotiledôneas e sete monocotiledôneas além da angiosperma basal Amborella trichopoda. Em uma análise filogenética por máxima verossimilhança foi evidenciado a formação de dois grupos filogenéticos na família gênica que refletem o perfil observado em Arabidopsis - denominados aqui como clado PGR e clado VTE6. Identificou-se que em monocotiledôneas há uma uma aparente expansão do clado PGR em relação as eudicotiledôneas. A partir de dados públicos de RNA-seq observamos que genes do o clado PGR apresenta maiores níveis de expressão em raiz em comparação a folha, enquanto o clado VTE6 apresentou um perfil oposto de expressão, sugerindo subfuncionalização dos genes parálogos aqui analisados. Com isso, este estudo realizou uma classificação diferencial das sequências DUF92 e a indicação de subfamílias dentro dessa família multigênica.-
Descrição: dc.descriptionNão recebi financiamento-
Formato: dc.formatapplication/pdf-
Idioma: dc.languagept_BR-
Publicador: dc.publisherUniversidade Estadual Paulista (UNESP)-
Direitos: dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/restrictedAccess-
Palavras-chave: dc.subjectBiologia molecular-
Palavras-chave: dc.subjectGenética vegetal-
Palavras-chave: dc.subjectEvolução molecular-
Palavras-chave: dc.subjectDUF92-
Palavras-chave: dc.subjectGenômica comparativa-
Palavras-chave: dc.subjectFamília multigênica-
Título: dc.titleRelações evolutivas na família gênica DUF92 em plantas: uma abordagem genômica comparativa e transcricional-
Título: dc.titleEvolutionary relationships in the DUF92 gene family in plants: a comparative genomic and transcriptional approach-
Tipo de arquivo: dc.typelivro digital-
Aparece nas coleções:Repositório Institucional - Unesp

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