Calophyllaceae plastomes, their structure and insights in relationships within the clusioids

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual de Campinas (UNICAMP)-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Federal de Minas Gerais (UFMG)-
Autor(es): dc.contributorInstituto Federal de Minas Gerais – Campus Bambuí-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual Paulista (UNESP)-
Autor(es): dc.contributorVolker Bittrich is an independent scientist-
Autor(es): dc.creatorTrad, Rafaela Jorge-
Autor(es): dc.creatorCabral, Fernanda Nunes-
Autor(es): dc.creatorBittrich, Volker-
Autor(es): dc.creatorSilva, Saura Rodrigues da-
Autor(es): dc.creatorAmaral, Maria do Carmo Estanislau do-
Data de aceite: dc.date.accessioned2025-08-21T20:37:18Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2025-08-21T20:37:18Z-
Data de envio: dc.date.issued2022-04-29-
Data de envio: dc.date.issued2022-04-29-
Data de envio: dc.date.issued2021-11-30-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.1038/s41598-021-99178-z-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11449/229771-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/11449/229771-
Descrição: dc.descriptionA complete chloroplast genome is not yet available for numerous species of plants. Among the groups that lack plastome information is the clusioid clade (Malpighiales), which includes five families: Bonnetiaceae, Calophyllaceae, Clusiaceae, Hypericaceae, and Podostemaceae. With around 2200 species, it has few published plastomes and most of them are from Podostemaceae. Here we assembled and compared six plastomes from members of the clusioids: five from Calophyllaceae (newly sequenced) and one from Clusiaceae. Putative regions for evolutionary studies were identified and the newly assembled chloroplasts were analyzed with other available chloroplasts for the group, focusing on Calophyllaceae. Our results mostly agree with recent studies which found a general conserved structure, except for the two Podostemaceae species that have a large inversion (trnK-UUU–rbcL) and lack one intron from ycf3. Within Calophyllaceae we observed a longer LSC and reduced IRs in Mahurea exstipulata, resulting in some genic rearrangement, and a short inversion (psbJ–psbE) in Kielmeyera coriacea. Phylogenetic analyses recovered the clusioids and the five families as monophyletic and revealed that conflicts in relationships reported in the literature for the group agree with nodes concentrating uninformative or conflicting gene trees. Our study brings new insights about clusioid plastome architecture and its evolution.-
Descrição: dc.descriptionFundo de Apoio ao Ensino, à Pesquisa e Extensão, Universidade Estadual de Campinas-
Descrição: dc.descriptionConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)-
Descrição: dc.descriptionFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)-
Descrição: dc.descriptionCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)-
Descrição: dc.descriptionDepartment of Plant Biology Biology Institute University of Campinas (UNICAMP), CP 6109-
Descrição: dc.descriptionMacroecology Lab @ J3-166 Institute of Biological Sciences – ICB Federal University of Minas Gerais (UFMG), Belo Horizonte-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Ciências e Linguagens Instituto Federal de Minas Gerais – Campus Bambuí-
Descrição: dc.descriptionDepartment of Technology UNESP - São Paulo State University, Campus Jaboticabal-
Descrição: dc.descriptionVolker Bittrich is an independent scientist-
Descrição: dc.descriptionDepartment of Technology UNESP - São Paulo State University, Campus Jaboticabal-
Descrição: dc.descriptionFundo de Apoio ao Ensino, à Pesquisa e Extensão, Universidade Estadual de Campinas: 1124/13-
Descrição: dc.descriptionCNPq: 142484/2014-8-
Descrição: dc.descriptionFAPESP: 2012/51781-0-
Descrição: dc.descriptionFAPESP: 2018/02285-6-
Descrição: dc.descriptionCNPq: 562299/2010-6-
Descrição: dc.descriptionCAPES: code 001-
Idioma: dc.languageen-
Relação: dc.relationScientific Reports-
???dc.source???: dc.sourceScopus-
Título: dc.titleCalophyllaceae plastomes, their structure and insights in relationships within the clusioids-
Tipo de arquivo: dc.typelivro digital-
Aparece nas coleções:Repositório Institucional - Unesp

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