The Emergence of the New P.4 Lineage of SARS-CoV-2 With Spike L452R Mutation in Brazil

Registro completo de metadados
MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual Paulista (UNESP)-
Autor(es): dc.contributorLaboratório Nacional de Computação Científica (LNCC)-
Autor(es): dc.contributorFaculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP)-
Autor(es): dc.contributorUniversidade de São Paulo (USP)-
Autor(es): dc.contributorNovo Hamburgo-
Autor(es): dc.creatorBittar, Cíntia-
Autor(es): dc.creatorPossebon, Fábio Sossai-
Autor(es): dc.creatorUllmann, Leila Sabrina-
Autor(es): dc.creatorGeraldini, Dayla Bott-
Autor(es): dc.creatorda Costa, Vivaldo G.-
Autor(es): dc.creatorde Almeida, Luiz G. P.-
Autor(es): dc.creatorda S. Sanches, Paulo Ricardo-
Autor(es): dc.creatorNascimento-Júnior, Nailton M.-
Autor(es): dc.creatorCilli, Eduardo M.-
Autor(es): dc.creatorArtico Banho, Cecília-
Autor(es): dc.creatorCampos, Guilherme R. F.-
Autor(es): dc.creatorFerreira, Helena Lage-
Autor(es): dc.creatorSacchetto, Lívia-
Autor(es): dc.creatorda Silva, Gislaine C. D.-
Autor(es): dc.creatorParra, Maisa C. P.-
Autor(es): dc.creatorMoraes, Marília M.-
Autor(es): dc.creatorda Costa, Paulo Inácio-
Autor(es): dc.creatorVasconcelos, Ana Tereza R.-
Autor(es): dc.creatorSpilki, Fernando Rosado-
Autor(es): dc.creatorNogueira, Maurício L.-
Autor(es): dc.creatorRahal, Paula-
Autor(es): dc.creatorAraujo Jr, João Pessoa-
Data de aceite: dc.date.accessioned2025-08-21T23:13:06Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2025-08-21T23:13:06Z-
Data de envio: dc.date.issued2022-04-29-
Data de envio: dc.date.issued2022-04-29-
Data de envio: dc.date.issued2021-10-01-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.3389/fpubh.2021.745310-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11449/229713-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/11449/229713-
Descrição: dc.descriptionThe emergence of several SARS-CoV-2 lineages presenting adaptive mutations is a matter of concern worldwide due to their potential ability to increase transmission and/or evade the immune response. While performing epidemiological and genomic surveillance of SARS-CoV-2 in samples from Porto Ferreira—São Paulo—Brazil, we identified sequences classified by pangolin as B.1.1.28 harboring Spike L452R mutation, in the RBD region. Phylogenetic analysis revealed that these sequences grouped into a monophyletic branch, with others from Brazil, mainly from the state of São Paulo. The sequences had a set of 15 clade defining amino acid mutations, of which six were in the Spike protein. A new lineage was proposed to Pango and it was accepted and designated P.4. In samples from the city of Porto Ferreira, P.4 lineage has been increasing in frequency since it was first detected in March 2021, corresponding to 34.7% of the samples sequenced in June, the second in prevalence after P.1. Also, it is circulating in 30 cities from the state of São Paulo, and it was also detected in one sample from the state of Sergipe and two from the state of Rio de Janeiro. Further studies are needed to understand whether P.4 should be considered a new threat.-
Descrição: dc.descriptionFinanciadora de Estudos e Projetos-
Descrição: dc.descriptionFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)-
Descrição: dc.descriptionConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)-
Descrição: dc.descriptionCenter for Information Technology-
Descrição: dc.descriptionCenter for Scientific Review-
Descrição: dc.descriptionNational Institutes of Health-
Descrição: dc.descriptionOffice of Extramural Research, National Institutes of Health-
Descrição: dc.descriptionOffice of Research Infrastructure Programs, National Institutes of Health-
Descrição: dc.descriptionFundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ)-
Descrição: dc.descriptionLaboratório de Estudos Genômicos Departamento de Biologia Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas (IBILCE) Universidade Estadual Paulista (Unesp) São José do Rio Preto-
Descrição: dc.descriptionInstituto de Biotecnologia Universidade Estadual Paulista (Unesp)-
Descrição: dc.descriptionLaboratório de Bioinformática Laboratório Nacional de Computação Científica (LNCC)-
Descrição: dc.descriptionLaboratório de Síntese e Estudos de Biomoléculas (LaSEBio) Departamento de Bioquímica e Química Orgânica Instituto de Química Universidade Estadual Paulista (Unesp)-
Descrição: dc.descriptionLaboratório de Química Medicinal Síntese Orgânica e Modelagem Molecular (LaQMedSOMM) Departamento de Bioquímica e Química Orgânica Instituto de Química Universidade Estadual Paulista (Unesp)-
Descrição: dc.descriptionLaboratório de Pesquisas em Virologia (LPV) Departamento de Doenças Dermatológicas Infecciosas e Parasitárias Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP)-
Descrição: dc.descriptionLaboratório de Medicina Veterinária Preventiva Aplicada Departamento de Medicina Veterinária Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos (FZEA) Universidade de São Paulo (USP)-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Análises Clínicas Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCFAR) Universidade Estadual Paulista (Unesp)-
Descrição: dc.descriptionLaboratório de Microbiologia Molecular Instituto de Ciências da Saúde Universidade Feevale Novo Hamburgo-
Descrição: dc.descriptionLaboratório de Estudos Genômicos Departamento de Biologia Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas (IBILCE) Universidade Estadual Paulista (Unesp) São José do Rio Preto-
Descrição: dc.descriptionInstituto de Biotecnologia Universidade Estadual Paulista (Unesp)-
Descrição: dc.descriptionLaboratório de Síntese e Estudos de Biomoléculas (LaSEBio) Departamento de Bioquímica e Química Orgânica Instituto de Química Universidade Estadual Paulista (Unesp)-
Descrição: dc.descriptionLaboratório de Química Medicinal Síntese Orgânica e Modelagem Molecular (LaQMedSOMM) Departamento de Bioquímica e Química Orgânica Instituto de Química Universidade Estadual Paulista (Unesp)-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Análises Clínicas Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCFAR) Universidade Estadual Paulista (Unesp)-
Descrição: dc.descriptionFinanciadora de Estudos e Projetos: 01.20.0029.000462/20-
Descrição: dc.descriptionFAPESP: 20/04836-0-
Descrição: dc.descriptionCNPq: 303170/2017-4-
Descrição: dc.descriptionCNPq: 404096/2020-4-
Descrição: dc.descriptionCenter for Information Technology: CREATE-NEO 1 U01 AI151807-01-
Descrição: dc.descriptionCenter for Scientific Review: CREATE-NEO 1 U01 AI151807-01-
Descrição: dc.descriptionNational Institutes of Health: CREATE-NEO 1 U01 AI151807-01-
Descrição: dc.descriptionOffice of Extramural Research, National Institutes of Health: CREATE-NEO 1 U01 AI151807-01-
Descrição: dc.descriptionOffice of Research Infrastructure Programs, National Institutes of Health: CREATE-NEO 1 U01 AI151807-01-
Descrição: dc.descriptionFAPERJ: E-26/202.903/20-
Idioma: dc.languageen-
Relação: dc.relationFrontiers in Public Health-
???dc.source???: dc.sourceScopus-
Palavras-chave: dc.subjectCOVID-19-
Palavras-chave: dc.subjectlineage P.4-
Palavras-chave: dc.subjectSARS-CoV-2-
Palavras-chave: dc.subjectSpike L452R-
Palavras-chave: dc.subjectvariants-
Título: dc.titleThe Emergence of the New P.4 Lineage of SARS-CoV-2 With Spike L452R Mutation in Brazil-
Tipo de arquivo: dc.typelivro digital-
Aparece nas coleções:Repositório Institucional - Unesp

Não existem arquivos associados a este item.