Genomic monitoring of the SARS-CoV-2 B1.1.7 (WHO VOC Alpha) in the Sao Paulo state, Brazil

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorUniversidade de São Paulo (USP)-
Autor(es): dc.contributorButantan Institute-
Autor(es): dc.contributorNGS Soluções Genômicas-
Autor(es): dc.contributorMendelics Análise Genômica SA-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual Paulista (UNESP)-
Autor(es): dc.contributorSão José do Rio Preto-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Federal de Minas Gerais (UFMG)-
Autor(es): dc.contributorRio de Janeiro-
Autor(es): dc.creatorSlavov, Svetoslav Nanev-
Autor(es): dc.creatorBezerra, Rafael dos Santos-
Autor(es): dc.creatorRodrigues, Evandra Strazza-
Autor(es): dc.creatorSantos, Elaine Vieira-
Autor(es): dc.creatorBorges, Joseane Serrano-
Autor(es): dc.creatorde la Roque, Débora Glenda Lima-
Autor(es): dc.creatorPatané, José Salvatore Leister-
Autor(es): dc.creatorLima, Alex Ranieri Jerônimo-
Autor(es): dc.creatorRibeiro, Gabriela-
Autor(es): dc.creatorViala, Vincent Louis-
Autor(es): dc.creatorde Lima, Loyze Paola Oliveira-
Autor(es): dc.creatorMartins, Antonio Jorge-
Autor(es): dc.creatordos Santos Barros, Claudia Renata-
Autor(es): dc.creatorMarqueze, Elaine Cristina-
Autor(es): dc.creatorBernardino, Jardelina de Souza Todão-
Autor(es): dc.creatorMoretti, Debora Botequio-
Autor(es): dc.creatorBrassaloti, Ricardo Augusto-
Autor(es): dc.creatorCassano, Raquel de Lello Rocha Campos-
Autor(es): dc.creatorMariani, Pilar Drummond Sampaio Corrêa-
Autor(es): dc.creatorKitajima, João Paulo-
Autor(es): dc.creatorSantos, Bibiana-
Autor(es): dc.creatorAssato, Patricia Akemi-
Autor(es): dc.creatorda Silva da Costa, Felipe Allan-
Autor(es): dc.creatorPoleti, Mirele Daiana-
Autor(es): dc.creatorLesbon, Jessika Cristina Chagas-
Autor(es): dc.creatorMattos, Elisangela Chicaroni-
Autor(es): dc.creatorBanho, Cecilia Artico-
Autor(es): dc.creatorSacchetto, Lívia-
Autor(es): dc.creatorMoraes, Marília Mazzi-
Autor(es): dc.creatorGrotto, Rejane Maria Tommasini-
Autor(es): dc.creatorSouza-Neto, Jayme A.-
Autor(es): dc.creatorGiovanetti, Marta-
Autor(es): dc.creatorde Alcantara, Luiz Carlos Junior-
Autor(es): dc.creatorNogueira, Maurício Lacerda-
Autor(es): dc.creatorFukumasu, Heidge-
Autor(es): dc.creatorCoutinho, Luiz Lehmann-
Autor(es): dc.creatorCalado, Rodrigo Tocantins-
Autor(es): dc.creatorNeto, Raul Machado-
Autor(es): dc.creatorCovas, Dimas Tadeu-
Autor(es): dc.creatorCoccuzzo Sampaio, Sandra-
Autor(es): dc.creatorElias, Maria Carolina-
Autor(es): dc.creatorKashima, Simone-
Data de aceite: dc.date.accessioned2025-08-21T15:52:01Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2025-08-21T15:52:01Z-
Data de envio: dc.date.issued2022-04-28-
Data de envio: dc.date.issued2022-04-28-
Data de envio: dc.date.issued2022-01-14-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.1016/j.virusres.2021.198643-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11449/222975-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/11449/222975-
Descrição: dc.descriptionThe SARS-CoV-2 alpha VOC (also known as lineage B.1.1.7) initially described in the autumn, 2020 in UK, rapidly became the dominant lineage across much of Europe. Despite multiple studies reporting molecular evidence suggestive of its circulation in Brazil, much is still unknown about its genomic diversity in the state of São Paulo, the main Brazilian economic and transportation hub. To get more insight regarding its transmission dynamics into the State we performed phylogenetic analysis on all alpha VOC strains obtained between February and August 2021 from the Sao Paulo state Network for Pandemic Alert of Emerging SARS-CoV-2 variants. The performed phylogenetic analysis showed that most of the alpha VOC genomes were interspersed with viral strains sampled from different Brazilian states and other countries suggesting that multiple independent Alpha VOC introductions from Brazil and overseas have occurred in the São Paulo State over time. Nevertheless, large monophyletic clusters were also observed especially from the Central-West part of the São Paulo State (the city of Bauru) and the metropolitan region of the São Paulo city. Our results highlight the Alpha VOC molecular epidemiology in the São Paulo state and reinforce the need for continued genomic surveillance strategies for the real-time monitoring of potential emerging SARS-CoV-2 variants during the ever-growing vaccination process.-
Descrição: dc.descriptionFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)-
Descrição: dc.descriptionFinanciadora de Estudos e Projetos-
Descrição: dc.descriptionUniversity of São Paulo Ribeirão Preto Medical School Blood Center of Ribeirão Preto-
Descrição: dc.descriptionButantan Institute-
Descrição: dc.descriptionUniversity of São Paulo Centro de Genômica Funcional da ESALQ-
Descrição: dc.descriptionNGS Soluções Genômicas-
Descrição: dc.descriptionMendelics Análise Genômica SA-
Descrição: dc.descriptionSão Paulo State University (UNESP) School of Agricultural Sciences Department of Bioprocesses and Biotechnology-
Descrição: dc.descriptionDepartment of Veterinary Medicine School of Animal Science and Food Engineering University of Sao Paulo-
Descrição: dc.descriptionMedicine School of São José do Rio Preto (FAMERP) São José do Rio Preto-
Descrição: dc.descriptionMolecular Biology Laboratory Applied Biotechnology Laboratory Clinical Hospital of the Botucatu Medical School-
Descrição: dc.descriptionInstituto de Ciências Biológicas Universidade Federal de Minas Gerais Belo Horizonte-
Descrição: dc.descriptionInstituto Oswaldo Cruz FIOCRUZ Rio de Janeiro-
Descrição: dc.descriptionUniversity of São Paulo Ribeirão Preto Medical School-
Descrição: dc.descriptionSão Paulo State University (UNESP) School of Agricultural Sciences Department of Bioprocesses and Biotechnology-
Descrição: dc.descriptionMolecular Biology Laboratory Applied Biotechnology Laboratory Clinical Hospital of the Botucatu Medical School-
Descrição: dc.descriptionFAPESP: 2017/26950–6-
Descrição: dc.descriptionFAPESP: 2018/15826–5-
Descrição: dc.descriptionFAPESP: 2019/08528–0-
Descrição: dc.descriptionFAPESP: 2020/10127; 2020/05367–3-
Descrição: dc.descriptionFinanciadora de Estudos e Projetos: 207.234-
Idioma: dc.languageen-
Relação: dc.relationVirus Research-
???dc.source???: dc.sourceScopus-
Palavras-chave: dc.subjectAlpha VOC-
Palavras-chave: dc.subjectB.1.1.7-
Palavras-chave: dc.subjectBrazil-
Palavras-chave: dc.subjectGenomic surveillance-
Palavras-chave: dc.subjectSARS-CoV-2-
Palavras-chave: dc.subjectSão Paulo-
Título: dc.titleGenomic monitoring of the SARS-CoV-2 B1.1.7 (WHO VOC Alpha) in the Sao Paulo state, Brazil-
Tipo de arquivo: dc.typelivro digital-
Aparece nas coleções:Repositório Institucional - Unesp

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