Computational Analysis of Transposable Elements and CircRNAs in Plants

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorFederal University of Technology—Paraná (UTFPR)-
Autor(es): dc.contributorEmpresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA)-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual Paulista (UNESP)-
Autor(es): dc.contributorUniversidad de Chile-
Autor(es): dc.contributorUniversidade de São Paulo (USP)-
Autor(es): dc.creatorOliveira, Liliane Santana-
Autor(es): dc.creatorPatera, Andressa Caroline-
Autor(es): dc.creatorDomingues, Douglas Silva [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorSanches, Danilo Sipoli-
Autor(es): dc.creatorLopes, Fabricio Martins-
Autor(es): dc.creatorBugatti, Pedro Henrique-
Autor(es): dc.creatorSaito, Priscila Tiemi Maeda-
Autor(es): dc.creatorMaracaja-Coutinho, Vinicius-
Autor(es): dc.creatorDurham, Alan Mitchell-
Autor(es): dc.creatorPaschoal, Alexandre Rossi-
Data de aceite: dc.date.accessioned2022-08-04T22:10:17Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2022-08-04T22:10:17Z-
Data de envio: dc.date.issued2022-04-28-
Data de envio: dc.date.issued2022-04-28-
Data de envio: dc.date.issued2020-12-31-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-1645-1_9-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11449/221925-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/11449/221925-
Descrição: dc.descriptionThis chapter provides two main contributions: (1) a description of computational tools and databases used to identify and analyze transposable elements (TEs) and circRNAs in plants; and (2) data analysis on public TE and circRNA data. Our goal is to highlight the primary information available in the literature on circular noncoding RNAs and transposable elements in plants. The exploratory analysis performed on publicly available circRNA and TEs data help discuss four sequence features. Finally, we investigate the association on circRNAs:TE in plants in the model organism Arabidopsis thaliana.-
Descrição: dc.descriptionDepartment of Computer Science Federal University of Technology—Paraná (UTFPR)-
Descrição: dc.descriptionEmbrapa Soja-
Descrição: dc.descriptionGroup of Genomics and Transcriptomes in Plants Instituto de Biociências de Rio Claro Universidade Estadual Paulista (UNESP)-
Descrição: dc.descriptionCentro de Modelamiento Molecular Biofísica y Bioinformática—CM2B2 Facultad de Ciencias Quimicas y Farmaceuticas Universidad de Chile-
Descrição: dc.descriptionDepartment of Computer Science Instituto de Matemática e Estatística Universidade de São Paulo (USP)-
Descrição: dc.descriptionGroup of Genomics and Transcriptomes in Plants Instituto de Biociências de Rio Claro Universidade Estadual Paulista (UNESP)-
Formato: dc.format147-172-
Idioma: dc.languageen-
Relação: dc.relationMethods in Molecular Biology-
???dc.source???: dc.sourceScopus-
Palavras-chave: dc.subjectBioinformatics-
Palavras-chave: dc.subjectCircRNAs-
Palavras-chave: dc.subjectCircular RNA-
Palavras-chave: dc.subjectComputational methods-
Palavras-chave: dc.subjectData analysis-
Palavras-chave: dc.subjectDatabases-
Palavras-chave: dc.subjectInteraction-
Palavras-chave: dc.subjectMobile elements-
Palavras-chave: dc.subjectNoncoding-
Palavras-chave: dc.subjectTransposable elements-
Título: dc.titleComputational Analysis of Transposable Elements and CircRNAs in Plants-
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