Replacement of the Gamma by the Delta variant in Brazil: Impact of lineage displacement on the ongoing pandemic

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Autor(es): dc.contributorInst Oswaldo Cruz-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Federal de Minas Gerais (UFMG)-
Autor(es): dc.contributorUniv Campus Biomed Roma-
Autor(es): dc.contributorOrganizacao Pan Amer Saude-
Autor(es): dc.contributorUniv KwaZulu Natal-
Autor(es): dc.contributorStellenbosch Univ-
Autor(es): dc.contributorUniv Bern-
Autor(es): dc.contributorFundacao Ezequiel Dias-
Autor(es): dc.contributorUniversidade de São Paulo (USP)-
Autor(es): dc.contributorButantan Inst-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual Paulista (UNESP)-
Autor(es): dc.contributorFundacao Oswaldo Cruz-
Autor(es): dc.contributorCoordenacao Geral Labs Saude Publ-
Autor(es): dc.contributorUniv Washington-
Autor(es): dc.contributorUniv Oxford-
Autor(es): dc.contributorUniv Sydney-
Autor(es): dc.contributorUniv Lisbon-
Autor(es): dc.creatorGiovanetti, Marta-
Autor(es): dc.creatorFonseca, Vagner-
Autor(es): dc.creatorWilkinson, Eduan-
Autor(es): dc.creatorTegally, Houriiyah-
Autor(es): dc.creatorSan, Emmanuel James-
Autor(es): dc.creatorAlthaus, Christian L.-
Autor(es): dc.creatorXavier, Joilson-
Autor(es): dc.creatorSlavov, Svetoslav Nanev-
Autor(es): dc.creatorViala, Vincent Louis-
Autor(es): dc.creatorJeronimo Lima, Alex Ranieri-
Autor(es): dc.creatorRibeiro, Gabriela-
Autor(es): dc.creatorSouza-Neto, Jayme A. [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorFukumasu, Heidge-
Autor(es): dc.creatorCoutinho, Luiz Lehmann-
Autor(es): dc.creatorCunha, Rivaldo Venancio da-
Autor(es): dc.creatorFreitas, Carla-
Autor(es): dc.creatore Melo, Carlos F. Campelo de A.-
Autor(es): dc.creatorAraujo, Wildo Navegantes de-
Autor(es): dc.creatorDo Carmo Said, Rodrigo Fabiano-
Autor(es): dc.creatorAlmiron, Maria-
Autor(es): dc.creatorOliveira, Tulio de-
Autor(es): dc.creatorSampaio, Sandra Coccuzzo-
Autor(es): dc.creatorElias, Maria Carolina-
Autor(es): dc.creatorCovas, Dimas Tadeu-
Autor(es): dc.creatorHolmes, Edward C.-
Autor(es): dc.creatorLourenco, Jose-
Autor(es): dc.creatorKashima, Simone-
Autor(es): dc.creatorJunior de Alcantara, Luiz Carlos-
Data de aceite: dc.date.accessioned2022-08-04T21:58:36Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2022-08-04T21:58:36Z-
Data de envio: dc.date.issued2022-04-28-
Data de envio: dc.date.issued2022-04-28-
Data de envio: dc.date.issued2022-04-01-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.1093/ve/veac024-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11449/218593-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/11449/218593-
Descrição: dc.descriptionThe coronavirus disease 2019 (COVID-19) epidemic in Brazil was driven mainly by the spread of Gamma (P.1), a locally emerged variant of concern (VOC) that was first detected in early January 2021. This variant was estimated to be responsible for more than 96 per cent of cases reported between January and June 2021, being associated with increased transmissibility and disease severity, a reduction in neutralization antibodies and effectiveness of treatments or vaccines, and diagnostic detection failure. Here we show that, following several importations predominantly from the USA, the Delta variant rapidly replaced Gamma after July 2021. However, in contrast to what was seen in other countries, the rapid spread of Delta did not lead to a large increase in the number of cases and deaths reported in Brazil. We suggest that this was likely due to the relatively successful early vaccination campaign coupled with natural immunity acquired following prior infection with Gamma. Our data reinforce reports of the increased transmissibility of the Delta variant and, considering the increasing concern due to the recently identified Omicron variant, argues for the necessity to strengthen genomic monitoring on a national level to quickly detect the emergence and spread of other VOCs that might threaten global health.-
Descrição: dc.descriptionNational Institutes of Health USA-
Descrição: dc.descriptionCRP-ICGEB RESEARCH GRANT 2020 Project-
Descrição: dc.descriptionOswaldo Cruz Foundation-
Descrição: dc.descriptionBrazilian Ministry of Health-
Descrição: dc.descriptionConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)-
Descrição: dc.descriptionFundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ)-
Descrição: dc.descriptionEuropean Union's Horizon 2020 research and innovation programme-project EpiPose-
Descrição: dc.descriptionSouth African Department of Science and Innovation-
Descrição: dc.descriptionSouth African Medical Research Council under the BRICS JAF-
Descrição: dc.descriptionAustralian Research Council Laureate Fellowship-
Descrição: dc.descriptionInst Oswaldo Cruz, Lab Flavivirus, Fundacao Aswaldo Cruz, FIOCRUZ,IOC, Av Brasil 4365, BR-21040360 Rio De Janeiro, RJ, Brazil-
Descrição: dc.descriptionUniv Fed Minas Gerais, Inst Ciencias Biol, Lab Genet Celular & Mol, Av Pres Antonio Carlos 6627, BR-31270901 Belo Horizonte, MG, Brazil-
Descrição: dc.descriptionUniv Campus Biomed Roma, Dept Sci & Technol Humans & Environm, Via Alvaro Portillo 21, I-00128 Rome, Italy-
Descrição: dc.descriptionOrganizacao Pan Amer Saude, Organizacao Mundial Saude, Lote 19 Ave Nacoes, BR-70312970 Brasilia, DF, Brazil-
Descrição: dc.descriptionUniv KwaZulu Natal, Coll Hlth Sci, Sch Lab Med & Med Sci, KwaZulu Natal Res Innovat & Sequencing Platfom KR, 238 Mazisi Kunene Rd, ZA-4041 Durban, South Africa-
Descrição: dc.descriptionStellenbosch Univ, Ctr Epidem Response & Innovat CERI, Sch Data Sci & Computat Thinking, Banhoek Rd & Joubert St, ZA-7600 Stellenbosch, South Africa-
Descrição: dc.descriptionUniv Bern, Inst Social & Prevent Med, Hochschulstr 6, CH-3012 Bern, Switzerland-
Descrição: dc.descriptionFundacao Ezequiel Dias, Lab Cent Saude Publ Estado Minas Gerais, Rua Conde Pereira Carneiro,80 Gameleira, BR-30510010 Belo Horizonte, MG, Brazil-
Descrição: dc.descriptionUniv Sao Paulo, Blood Ctr Ribeirao Preto, Ribeirao Preto Med Sch, R Quintino Bocaiuva 470, BR-14015160 Ribeirao Preto, SP, Brazil-
Descrição: dc.descriptionButantan Inst, Ave Doutor Vital Brasil 1500, Sao Paulo, SP, Brazil-
Descrição: dc.descriptionSao Paulo State Univ UNESP, Sch Agr Sci, R Quintino Bocaiuva 470, BR-05508900 Botucatu, SP, Brazil-
Descrição: dc.descriptionUniv Sao Paulo, Sch Anim Sci & Food Engn, Dept Vet Med, R Quintino Bocaiuva 470, Sao Paulo, Brazil-
Descrição: dc.descriptionUniv Sao Paulo, Ctr Genom Func ESALQ, R Quintino Bocaiuva 470, Piracicaba, SP, Brazil-
Descrição: dc.descriptionFundacao Oswaldo Cruz, Biomanguinhos, Av Brasil 4365, BR-21040360 Rio De Janeiro, RJ, Brazil-
Descrição: dc.descriptionCoordenacao Geral Labs Saude Publ, Minist Saude CGLAB SVS MS, Secretaria Vigilancia Saude, Esplanada Ministerios Bloco G Edificio Sede, BR-70058900 Brasilia, DF, Brazil-
Descrição: dc.descriptionUniv KwaZulu Natal, Ctr AIDS Programme Res South Africa CAPRISA, Doris Duke Med Res Inst, Nelson R Mandela Sch Med, Private Bag X7, ZA-4013 Congella, South Africa-
Descrição: dc.descriptionUniv Washington, Dept Global Hlth, Schmitz Hall 1410 NE Campus Pkway Box 355852, Seattle, WA 98195 USA-
Descrição: dc.descriptionUniv Oxford, Dept Zool, Peter Medawar Bldg,1a Mansfield Rd, Oxford, England-
Descrição: dc.descriptionUniv Sydney, Sch Life & Environm Sci, Sydney Inst Infect Dis, Sydney, NSW, Australia-
Descrição: dc.descriptionUniv Sydney, Sch Med Sci, Sydney, NSW, Australia-
Descrição: dc.descriptionUniv Lisbon, Biosyst & Integrat Sci Inst BioISI, P-1749016 Lisbon, Portugal-
Descrição: dc.descriptionSao Paulo State Univ UNESP, Sch Agr Sci, R Quintino Bocaiuva 470, BR-05508900 Botucatu, SP, Brazil-
Descrição: dc.descriptionNational Institutes of Health USA: U01 AI151698-
Descrição: dc.descriptionCRP-ICGEB RESEARCH GRANT 2020 Project: CRP/BRA20-03-
Descrição: dc.descriptionCRP-ICGEB RESEARCH GRANT 2020 Project: CRP/20/03-
Descrição: dc.descriptionOswaldo Cruz Foundation: VPGDI-027-FIO-20-2-2-30-
Descrição: dc.descriptionBrazilian Ministry of Health: SCON2021-00180-
Descrição: dc.descriptionCNPq: 426559/2018-5-
Descrição: dc.descriptionFAPERJ: E-26/202.930/2016-
Descrição: dc.descriptionFAPERJ: E-26/202.248/2018(238504)-
Descrição: dc.descriptionFAPERJ: E26/202.665/2019(247400)-
Descrição: dc.descriptionEuropean Union's Horizon 2020 research and innovation programme-project EpiPose: 101003688-
Descrição: dc.descriptionSouth African Medical Research Council under the BRICS JAF: 2020/049-
Descrição: dc.descriptionAustralian Research Council Laureate Fellowship: FL170100022-
Formato: dc.format6-
Idioma: dc.languageen-
Publicador: dc.publisherOxford Univ Press-
Relação: dc.relationVirus Evolution-
???dc.source???: dc.sourceWeb of Science-
Palavras-chave: dc.subjectGenomic monitoring-
Palavras-chave: dc.subjectvariants replacment-
Palavras-chave: dc.subjectBrazil-
Palavras-chave: dc.subjectGamma-
Palavras-chave: dc.subjectDelta-
Título: dc.titleReplacement of the Gamma by the Delta variant in Brazil: Impact of lineage displacement on the ongoing pandemic-
Tipo de arquivo: dc.typelivro digital-
Aparece nas coleções:Repositório Institucional - Unesp

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