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Metadados | Descrição | Idioma |
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Autor(es): dc.contributor | Universidade de São Paulo (USP) | - |
Autor(es): dc.contributor | Mendelics Análise Genômica S.A. | - |
Autor(es): dc.contributor | Universidade Estadual Paulista (Unesp) | - |
Autor(es): dc.contributor | SENAI Innovation Institute in Biomass | - |
Autor(es): dc.creator | Crestana, Gustavo Schiavone | - |
Autor(es): dc.creator | Taniguti, Lucas Mitsuo | - |
Autor(es): dc.creator | Dos Santos, Clesivan Pereira | - |
Autor(es): dc.creator | Benevenuto, Juliana | - |
Autor(es): dc.creator | Ceresini, Paulo Cezar [UNESP] | - |
Autor(es): dc.creator | Carvalho, Giselle | - |
Autor(es): dc.creator | Kitajima, João Paulo | - |
Autor(es): dc.creator | Monteiro-Vitorello, Claudia Barros | - |
Data de aceite: dc.date.accessioned | 2022-02-22T00:53:51Z | - |
Data de disponibilização: dc.date.available | 2022-02-22T00:53:51Z | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2021-06-25 | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2021-06-25 | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2021-04-01 | - |
Fonte completa do material: dc.identifier | http://dx.doi.org/10.1094/MPMI-08-20-0218-A | - |
Fonte completa do material: dc.identifier | http://hdl.handle.net/11449/208593 | - |
Fonte: dc.identifier.uri | http://educapes.capes.gov.br/handle/11449/208593 | - |
Descrição: dc.description | Here, we present the first complete chromosome-level genome assembly of the smut fungus strain Sporisorium panici-leucophaei SPL10A, the causal agent of the sourgrass (Digitaria insularis) smut disease. Combining Illumina paired-end and Nanopore long reads, we generated a final assembly composed of 23 chromosomes (22 nuclear and one mitochondrial) with 18,915,934 bp. Gene prediction accomplished using extrinsic evidence from the sugarcane smut fungus Sporisorium scitamineum originated a total of 6,402 protein-encoding genes. The secretome (388 proteins) and the effectorome repertoires (68 candidates) were also predicted, given their crucial roles in plant-pathogen interactions. The complete telomere-to-telomere chromosome sequences of this poorly studied fungus will provide a valuable resource for future comparative genomic studies among smuts to unravel their underlying pathogenicity mechanisms. | - |
Descrição: dc.description | Genomics Group Department of Genetics University of São Paulo/Luiz de Queiroz College of Agriculture (USP/ESALQ) | - |
Descrição: dc.description | Mendelics Análise Genômica S.A. | - |
Descrição: dc.description | Molecular Phytopathology Lab Plant Health Rural Engineering and Soils Department São Paulo State University (UNESP) | - |
Descrição: dc.description | SENAI Innovation Institute in Biomass | - |
Descrição: dc.description | Molecular Phytopathology Lab Plant Health Rural Engineering and Soils Department São Paulo State University (UNESP) | - |
Formato: dc.format | 448-452 | - |
Idioma: dc.language | en | - |
Relação: dc.relation | Molecular Plant-Microbe Interactions | - |
???dc.source???: dc.source | Scopus | - |
Palavras-chave: dc.subject | Genome assembly | - |
Palavras-chave: dc.subject | Nanopore sequencing | - |
Palavras-chave: dc.subject | Plant-pathogen interaction | - |
Palavras-chave: dc.subject | Smut fungi | - |
Palavras-chave: dc.subject | Sporisorium scitamineum | - |
Título: dc.title | Complete Chromosome-scale genome sequence resource for sporisorium panici-leucophaei, the causal agent of sourgrass smut disease | - |
Aparece nas coleções: | Repositório Institucional - Unesp |
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