Long-term persistence of supernumerary B chromosomes in multiple species of Astyanax fish

Registro completo de metadados
MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual Paulista (Unesp)-
Autor(es): dc.contributorUppsala University-
Autor(es): dc.contributorUniversidad de Granada-
Autor(es): dc.contributorUniversity of East Anglia-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Federal Rural do Rio de Janeiro-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Federal de São Carlos (UFSCar)-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual de Ponta Grossa (UEPG)-
Autor(es): dc.contributorUniversidade de São Paulo (USP)-
Autor(es): dc.creatorSilva, Duílio Mazzoni Zerbinato de Andrade [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorRuiz-Ruano, Francisco J.-
Autor(es): dc.creatorUtsunomia, Ricardo [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorMartín-Peciña, María-
Autor(es): dc.creatorCastro, Jonathan Pena-
Autor(es): dc.creatorFreire, Paula Paccielli [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorCarvalho, Robson Francisco [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorHashimoto, Diogo T. [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorSuh, Alexander-
Autor(es): dc.creatorOliveira, Claudio [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorPorto-Foresti, Fábio [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorArtoni, Roberto Ferreira-
Autor(es): dc.creatorForesti, Fausto [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorCamacho, Juan Pedro M.-
Data de aceite: dc.date.accessioned2022-02-22T00:50:22Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2022-02-22T00:50:22Z-
Data de envio: dc.date.issued2021-06-25-
Data de envio: dc.date.issued2021-06-25-
Data de envio: dc.date.issued2021-11-30-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.1186/s12915-021-00991-9-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11449/207477-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/11449/207477-
Descrição: dc.descriptionBackground: Eukaryote genomes frequently harbor supernumerary B chromosomes in addition to the “standard” A chromosome set. B chromosomes are thought to arise as byproducts of genome rearrangements and have mostly been considered intraspecific oddities. However, their evolutionary transcendence beyond species level has remained untested. Results: Here we reveal that the large metacentric B chromosomes reported in several fish species of the genus Astyanax arose in a common ancestor at least 4 million years ago. We generated transcriptomes of A. scabripinnis and A. paranae 0B and 1B individuals and used these assemblies as a reference for mapping all gDNA and RNA libraries to quantify coverage differences between B-lacking and B-carrying genomes. We show that the B chromosomes of A. scabripinnis and A. paranae share 19 protein-coding genes, of which 14 and 11 were also present in the B chromosomes of A. bockmanni and A. fasciatus, respectively. Our search for B-specific single-nucleotide polymorphisms (SNPs) identified the presence of B-derived transcripts in B-carrying ovaries, 80% of which belonged to nobox, a gene involved in oogenesis regulation. Importantly, the B chromosome nobox paralog is expressed > 30× more than the A chromosome paralog. This indicates that the normal regulation of this gene is altered in B-carrying females, which could potentially facilitate B inheritance at higher rates than Mendelian law prediction. Conclusions: Taken together, our results demonstrate the long-term survival of B chromosomes despite their lack of regular pairing and segregation during meiosis and that they can endure episodes of population divergence leading to species formation.-
Descrição: dc.descriptionConsejería de Conocimiento, Investigación y Universidad, Junta de Andalucía-
Descrição: dc.descriptionConsejería de Economía, Conocimiento, Empresas y Universidad, Junta de Andalucía-
Descrição: dc.descriptionConsejería de Economía, Innovación, Ciencia y Empleo, Junta de Andalucía-
Descrição: dc.descriptionConsejería de Salud y Familias, Junta de Andalucía-
Descrição: dc.descriptionJunta de Andalucía-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Biologia Estrutural e Funcional Instituto de Biociências de Botucatu Universidade Estadual Paulista UNESP Distrito de Rubião Junior-
Descrição: dc.descriptionDepartment of Organismal Biology – Systematic Biology Evolutionary Biology Centre Uppsala University-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Genética Universidad de Granada-
Descrição: dc.descriptionSchool of Biological Sciences University of East Anglia, Norwich Research Park-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Genética Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde ICBS Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Ciências Biológicas Faculdade de Ciências Universidade Estadual Paulista UNESP Campus de Bauru-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Genética e Evolução Universidade Federal de São Carlos UFSCAR-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Biologia Estrutural Molecular e Genética Universidade Estadual de Ponta Grossa UEPG-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Imunologia Instituto de Ciências Biomédicas Universidade de São Paulo USP-
Descrição: dc.descriptionCentro de Aquicultura Universidade Estadual Paulista UNESP, Campus Jaboticabal-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Biologia Estrutural e Funcional Instituto de Biociências de Botucatu Universidade Estadual Paulista UNESP Distrito de Rubião Junior-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Ciências Biológicas Faculdade de Ciências Universidade Estadual Paulista UNESP Campus de Bauru-
Descrição: dc.descriptionCentro de Aquicultura Universidade Estadual Paulista UNESP, Campus Jaboticabal-
Idioma: dc.languageen-
Relação: dc.relationBMC Biology-
???dc.source???: dc.sourceScopus-
Palavras-chave: dc.subjectAstyanax-
Palavras-chave: dc.subjectB chromosomes-
Palavras-chave: dc.subjectEvolution-
Palavras-chave: dc.subjectGenomics-
Palavras-chave: dc.subjectTranscriptomics-
Título: dc.titleLong-term persistence of supernumerary B chromosomes in multiple species of Astyanax fish-
Tipo de arquivo: dc.typelivro digital-
Aparece nas coleções:Repositório Institucional - Unesp

Não existem arquivos associados a este item.