Complete genome sequence and analysis of Alcaligenes faecalis strain Mc250, a new potential plant bioinoculant

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorUniversidade Federal de Ouro Preto-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Federal de Ouro Preto (UFOP)-
Autor(es): dc.contributorInstituto Pristino-
Autor(es): dc.contributorUniversidade de São Paulo (USP)-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Federal de Viçosa (UFV)-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual Paulista (Unesp)-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS)-
Autor(es): dc.creatorFelestrino, Érica Barbosa-
Autor(es): dc.creatorSanchez, Angélica Bianchini-
Autor(es): dc.creatorCaneschi, Washington Luiz-
Autor(es): dc.creatorde Carvalho Lemes, Camila Gracyelle-
Autor(es): dc.creatorde Almeida Barbosa Assis, Renata-
Autor(es): dc.creatorCordeiro, Isabella Ferreira-
Autor(es): dc.creatorFonseca, Natasha Peixoto-
Autor(es): dc.creatorVilla, Morghana Marina-
Autor(es): dc.creatorVieira, Izadora Tabuso-
Autor(es): dc.creatorKamino, Luciana Hiromi Yoshino-
Autor(es): dc.creatorDo Carmo, Flávio Fonseca-
Autor(es): dc.creatorDa Silva, Aline Maria-
Autor(es): dc.creatorThomas, Andrew Maltez-
Autor(es): dc.creatorPatané, José Salvatore Leister-
Autor(es): dc.creatorFerreira, Fernanda Carla-
Autor(es): dc.creatorde Freitas, Leandro Grassi-
Autor(es): dc.creatorde Mello Varani, Alessandro [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorFerro, Jesus Aparecido [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorSilva, Robson Soares-
Autor(es): dc.creatorAlmeida, Nalvo Franco-
Autor(es): dc.creatorGarcia, Camila Carriao Machado-
Autor(es): dc.creatorSetubal, Joao Carlos-
Autor(es): dc.creatorMoreira, Leandro Marcio-
Data de aceite: dc.date.accessioned2022-02-22T00:48:17Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2022-02-22T00:48:17Z-
Data de envio: dc.date.issued2021-06-25-
Data de envio: dc.date.issued2021-06-25-
Data de envio: dc.date.issued2020-10-31-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0241546-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11449/206804-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/11449/206804-
Descrição: dc.descriptionHere we present and analyze the complete genome of Alcaligenes faecalis strain Mc250 (Mc250), a bacterium isolated from the roots of Mimosa calodendron, an endemic plant growing in ferruginous rupestrian grasslands in Minas Gerais State, Brazil. The genome has 4,159,911 bp and 3,719 predicted protein-coding genes, in a single chromosome. Comparison of the Mc250 genome with 36 other Alcaligenes faecalis genomes revealed that there is considerable gene content variation among these strains, with the core genome representing only 39% of the protein-coding gene repertoire of Mc250. Mc250 encodes a complete denitrification pathway, a network of pathways associated with phenolic compounds degradation, and genes associated with HCN and siderophores synthesis; we also found a repertoire of genes associated with metal internalization and metabolism, sulfate/sulfonate and cysteine metabolism, oxidative stress and DNA repair. These findings reveal the genomic basis for the adaptation of this bacterium to the harsh environmental conditions from where it was isolated. Gene clusters associated with ectoine, terpene, resorcinol, and emulsan biosynthesis that can confer some competitive advantage were also found. Experimental results showed that Mc250 was able to reduce (∼60%) the virulence phenotype of the plant pathogen Xanthomonas citri subsp. citri when co-inoculated in Citrus sinensis, and was able to eradicate 98% of juveniles and stabilize the hatching rate of eggs to 4% in two species of agricultural nematodes. These results reveal biotechnological potential for the Mc250 strain and warrant its further investigation as a biocontrol and plant growth-promoting bacterium.-
Descrição: dc.descriptionNúcleo de Pesquisas em Ciências Biológicas (NUPEB) Universidade Federal de Ouro Preto-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Ciências Biológicas (DECBI) Instituto de Ciências Exatas e Biológicas (ICEB) Universidade Federal de Ouro Preto (UFOP)-
Descrição: dc.descriptionInstituto Pristino-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Bioquimica (DBQ) Instituto de Quimica (IQ) Universidade de São Paulo (USP)-
Descrição: dc.descriptionInstituto de Biotecnologia Aplicada a Agropecuária (BIOAGRO) Universidade Federal de Vicosa (UFV)-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Tecnologia Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal (FCAV) Universidade Estadual Paulista (UNESP)-
Descrição: dc.descriptionFaculdade de Computação (FACOM) Universidade Federal de Mato Grosso do Sul-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Tecnologia Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal (FCAV) Universidade Estadual Paulista (UNESP)-
Idioma: dc.languageen-
Relação: dc.relationPLoS ONE-
???dc.source???: dc.sourceScopus-
Título: dc.titleComplete genome sequence and analysis of Alcaligenes faecalis strain Mc250, a new potential plant bioinoculant-
Tipo de arquivo: dc.typelivro digital-
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