Dna barcoding for molecular identification of gynerium sagittatum (Poales: Poaceae): Genetic diversity in Savannah genotypes from córdoba, Colombia

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Autor(es): dc.contributorGrupo de Investigación BIODIMARC-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual Paulista (Unesp)-
Autor(es): dc.contributorFacultad de Salud y de Ciencias e Ingenierías-
Autor(es): dc.creatorRivera-Jiménez, Hernando J.-
Autor(es): dc.creatorRossini, Bruno C. [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorHumanez Alvarez, Alicia Del Carmen-
Autor(es): dc.creatorSilva, Saura R. [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorEscobar, Juan Yepes-
Autor(es): dc.creatorMarino, Celso L. [UNESP]-
Data de aceite: dc.date.accessioned2022-02-22T00:47:43Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2022-02-22T00:47:43Z-
Data de envio: dc.date.issued2021-06-25-
Data de envio: dc.date.issued2021-06-25-
Data de envio: dc.date.issued2020-11-30-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.15517/RBT.V68I4.39350-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11449/206648-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/11449/206648-
Descrição: dc.descriptionIntroduction: The fiber of the Gynerium sagittatum Aubl. P. Beauv is raw material for the elaboration of several handcrafts, which are symbols of Colombian cultural identity. In the manufacture process, different genotypes are used according to the fiber quality and the type of craftsmanship, but it is believed that Gynerium is a complex species, and to date, there is no agreement on whether these genotypes belong to the same species or to different species. Objective: The aim of this study was to quickly and accurately identify wild cane plants using the nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS1+ITS2), three chloroplast regions (matK, rbcL, ycf1), and their combinations. Methods: Different tests were used for discrimination: (1) inter and intraspecific distances, (2) Best Match (BM), Best Close Match (BCM), and tree-based method (3) Neighbor Joining (NJ) and (4) maximum likelihood and bayesian inference in molecular data. Results: The results showed that BM and BCM approaches revealed the low rate of correct species identification for ITS+matK (33.3 %) and ITS (28.6 %) loci, showing similarity among sequences. These results were further supported by tree-based analyses, where all individual regions and the different gene combinations had a zero discrimination rate. Conclusions: all genotypes belong to the same species of wild cane, therefore existing morphological differences can be related to phenotypic plasticity.-
Descrição: dc.descriptionUniversidade Estadual Paulista-
Descrição: dc.descriptionUniversidad de Córdoba Departamento de Biología Grupo de Investigación BIODIMARC-
Descrição: dc.descriptionUniversidade Estadual Paulista Instituto de Biotecnologia (IBTEC) UNESP-
Descrição: dc.descriptionUniversidad del Sinú “Elías Bechara Zainum” Facultad de Salud y de Ciencias e Ingenierías-
Descrição: dc.descriptionUniversidade Estadual Paulista Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Jaboticabal Departamento de Biologia Aplicada à Agropecuária-
Descrição: dc.descriptionUniversidade Estadual Paulista Departamento de Genética Instituto de Biociências-
Descrição: dc.descriptionUniversidade Estadual Paulista Instituto de Biotecnologia (IBTEC) UNESP-
Descrição: dc.descriptionUniversidade Estadual Paulista Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Jaboticabal Departamento de Biologia Aplicada à Agropecuária-
Descrição: dc.descriptionUniversidade Estadual Paulista Departamento de Genética Instituto de Biociências-
Formato: dc.format1049-1061-
Idioma: dc.languageen-
Relação: dc.relationRevista de Biologia Tropical-
???dc.source???: dc.sourceScopus-
Palavras-chave: dc.subjectChloroplast genes-
Palavras-chave: dc.subjectDNA barcode-
Palavras-chave: dc.subjectGynerium saccharoides-
Palavras-chave: dc.subjectNuclear ribosomal internal transcribed spacer-
Palavras-chave: dc.subjectWild cane-
Título: dc.titleDna barcoding for molecular identification of gynerium sagittatum (Poales: Poaceae): Genetic diversity in Savannah genotypes from córdoba, Colombia-
Título: dc.titleCódigo de barras de adn para la identificación molecular de gynerium sagittatum (Poales: poaceae): diversidad genética de genotipos de las sabanas de córdoba, Colombia-
Tipo de arquivo: dc.typelivro digital-
Aparece nas coleções:Repositório Institucional - Unesp

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