Evaluation of the HIrisPlex-S system in a Brazilian population sample

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorUniversidade de São Paulo (USP)-
Autor(es): dc.contributorUniversity of Toronto at Mississauga-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual Paulista (Unesp)-
Autor(es): dc.contributorUniversity of Cincinnati-
Autor(es): dc.creatorCarratto, T. M.T.-
Autor(es): dc.creatorMarcorin, L.-
Autor(es): dc.creatorDebortoli, G.-
Autor(es): dc.creatorSilva, G. V.-
Autor(es): dc.creatorFracasso, N. C.A.-
Autor(es): dc.creatorOliveira, M. L.G.-
Autor(es): dc.creatorPereira, A. L.E.-
Autor(es): dc.creatorSilva, A. B.C.-
Autor(es): dc.creatorDonadi, E. A.-
Autor(es): dc.creatorSimões, A. L.-
Autor(es): dc.creatorCastelli, E. C. [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorNorton, H. L.-
Autor(es): dc.creatorParra, E. J.-
Autor(es): dc.creatorMendes-Junior, C. T.-
Data de aceite: dc.date.accessioned2022-02-22T00:32:33Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2022-02-22T00:32:33Z-
Data de envio: dc.date.issued2020-12-11-
Data de envio: dc.date.issued2020-12-11-
Data de envio: dc.date.issued2019-11-30-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.1016/j.fsigss.2019.10.180-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11449/201087-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/11449/201087-
Descrição: dc.descriptionThe main goal of DNA phenotyping is to predict externally visible characteristics (EVCs) of an individual using only its genetic information. Nowadays, the HIrisPlex-S system stands as a reliable model designed for skin color prediction. However, prediction of skin color phenotypes has not been thoroughly tested in recently admixed populations, so it is important to evaluate the applicability of this tool in these populations. This study aims to analyze the HIrisPlex-S system accuracy in an admixed sample of 276 individuals from the region of Ribeirão Preto city in Southeastern Brazil. Predictive markers were directly genotyped by Next-Generation Sequencing (NGS), Infinium Multi-Ethnic Global-8 (MEGA) Kit Array (Illumina), or imputed using the IMPUTE2 software. Skin color predictions were performed using the HIrisPlex-S online tool. Our report shows that, except for dark to black color, the tool consistently fails in determining skin phenotypes. Therefore, results reveal that the HIrisPlex-S System is less reliable when dealing with admixed population samples, not supporting its utility for forensic casework in Brazil.-
Descrição: dc.descriptionFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)-
Descrição: dc.descriptionNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada-
Descrição: dc.descriptionCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)-
Descrição: dc.descriptionConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Química Laboratório de Pesquisas Forenses e Genômicas Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto Universidade de São Paulo-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Genética Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto Universidade de São Paulo-
Descrição: dc.descriptionDepartment of Anthropology University of Toronto at Mississauga-
Descrição: dc.descriptionDivisão de Imunologia Clínica Departamento de Clínica Médica Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto Universidade de São Paulo-
Descrição: dc.descriptionSão Paulo State University (UNESP) Department of Pathology School of Medicine-
Descrição: dc.descriptionDepartment of Anthropology University of Cincinnati-
Descrição: dc.descriptionSão Paulo State University (UNESP) Department of Pathology School of Medicine-
Descrição: dc.descriptionFAPESP: #2013/15447-0-
Descrição: dc.descriptionNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada: #302590/2016-1-
Descrição: dc.descriptionCAPES: #312802/2018-8-
Descrição: dc.descriptionCNPq: #448242/2014-1-
Formato: dc.format794-796-
Idioma: dc.languageen-
Relação: dc.relationForensic Science International: Genetics Supplement Series-
???dc.source???: dc.sourceScopus-
Palavras-chave: dc.subjectDNA array-
Palavras-chave: dc.subjectDNA phenotyping-
Palavras-chave: dc.subjectNext-generation sequencing-
Título: dc.titleEvaluation of the HIrisPlex-S system in a Brazilian population sample-
Tipo de arquivo: dc.typelivro digital-
Aparece nas coleções:Repositório Institucional - Unesp

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