Comparative eye and liver differentially expressed genes reveal monochromatic vision and cancer resistance in the shortfin mako shark (Isurus oxyrinchus)

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP)-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual Paulista (Unesp)-
Autor(es): dc.contributorI.P.)-
Autor(es): dc.contributorUniversidade do Algarve-
Autor(es): dc.contributorUniversidade do Porto-
Autor(es): dc.creatorDomingues, Rodrigo R.-
Autor(es): dc.creatorMastrochirico-Filho, Vito Antonio [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorMendes, Natalia J. [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorHashimoto, Diogo T. [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorCoelho, Rui-
Autor(es): dc.creatorda Cruz, Vanessa Paes [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorAntunes, Agostinho-
Autor(es): dc.creatorForesti, Fausto [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorMendonça, Fernando F.-
Data de aceite: dc.date.accessioned2022-02-22T00:32:21Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2022-02-22T00:32:21Z-
Data de envio: dc.date.issued2020-12-11-
Data de envio: dc.date.issued2020-12-11-
Data de envio: dc.date.issued2020-10-31-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.1016/j.ygeno.2020.08.037-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11449/201013-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/11449/201013-
Descrição: dc.descriptionThe shortfin mako, Isurus oxyrinchus is an oceanic pelagic shark found worldwide in tropical and subtropical waters. However, the understanding of its biology at molecular level is still incipient. We sequenced the messenger RNA isolated from eye and liver tissues. De novo transcriptome yielded a total of 705,940 transcripts. A total of 3774 genes were differentially expressed (DEGs), with 1612 in the eye and 2162 in the liver. Most DEGs in the eye were related to structural and signaling functions, including nonocular and ocular opsin genes, whereas nine out of ten most overexpressed genes in the liver were related to tumor suppression, wound healing, and human diseases. Furthermore, DEGs findings provide insights on the monochromatic shark vision and a repertory of cancer-related genes, which may be insightful to elucidate shark resistance to cancer. Therefore, our results provide valuable sequence resources for future functional and population studies.-
Descrição: dc.descriptionEuropean Regional Development Fund-
Descrição: dc.descriptionFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Ciências do Mar Instituto do Mar Universidade Federal de São Paulo – UNIFESP, Rua Carvalho de Mendonça, 144-
Descrição: dc.descriptionCentro de Aquicultura da UNESP Universidade Estadual Paulista – UNESP, Via de Acesso Prof. Paulo Donato Castellane, s/n-
Descrição: dc.descriptionInstituto Português do Mar e da Atmosfera (IPMA I.P.), Av. 5 Outubro-
Descrição: dc.descriptionCentro de Ciências do Mar (CCMAR) Universidade do Algarve, Campus de Gambelas-
Descrição: dc.descriptionLaboratório de Biologia e Genética de Peixes Instituto de Biociências de Botucatu Universidade Estadual Paulista – UNESP-
Descrição: dc.descriptionCIIMAR/CIMAR Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental Universidade do Porto, Av. General Norton de Matos, s/n-
Descrição: dc.descriptionDepartmento de Biologia Faculdade de Ciências Universidade do Porto, Rua do Campo Alegre, s/n-
Descrição: dc.descriptionCentro de Aquicultura da UNESP Universidade Estadual Paulista – UNESP, Via de Acesso Prof. Paulo Donato Castellane, s/n-
Descrição: dc.descriptionLaboratório de Biologia e Genética de Peixes Instituto de Biociências de Botucatu Universidade Estadual Paulista – UNESP-
Descrição: dc.descriptionFAPESP: 2014/19740-7-
Descrição: dc.descriptionFAPESP: 2017/02420-8-
Descrição: dc.descriptionFAPESP: 2018/21319-9-
Formato: dc.format4817-4826-
Idioma: dc.languageen-
Relação: dc.relationGenomics-
???dc.source???: dc.sourceScopus-
Palavras-chave: dc.subjectElasmobranch-
Palavras-chave: dc.subjectGene ontology-
Palavras-chave: dc.subjectPhotoreception-
Palavras-chave: dc.subjectTranscriptomics-
Palavras-chave: dc.subjectTumor suppression-
Título: dc.titleComparative eye and liver differentially expressed genes reveal monochromatic vision and cancer resistance in the shortfin mako shark (Isurus oxyrinchus)-
Tipo de arquivo: dc.typelivro digital-
Aparece nas coleções:Repositório Institucional - Unesp

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