Atenção: Todas as denúncias são sigilosas e sua identidade será preservada.
Os campos nome e e-mail são de preenchimento opcional
Metadados | Descrição | Idioma |
---|---|---|
Autor(es): dc.contributor | Universidade Estadual Paulista (Unesp) | - |
Autor(es): dc.contributor | Cornell University | - |
Autor(es): dc.contributor | FIOCRUZ | - |
Autor(es): dc.contributor | UMR5558 | - |
Autor(es): dc.creator | Castro, Marcelo R. J. [UNESP] | - |
Autor(es): dc.creator | Goubert, Clément | - |
Autor(es): dc.creator | Carareto, Claudia M. A. [UNESP] | - |
Autor(es): dc.creator | Monteiro, Fernando A. | - |
Autor(es): dc.creator | Vieira, Cristina | - |
Data de aceite: dc.date.accessioned | 2022-02-22T00:29:15Z | - |
Data de disponibilização: dc.date.available | 2022-02-22T00:29:15Z | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2020-12-11 | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2020-12-11 | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2020-01-31 | - |
Fonte completa do material: dc.identifier | http://dx.doi.org/10.3390/genes11020170 | - |
Fonte completa do material: dc.identifier | http://hdl.handle.net/11449/200057 | - |
Fonte: dc.identifier.uri | http://educapes.capes.gov.br/handle/11449/200057 | - |
Descrição: dc.description | Transposable elements (TEs) are widely distributed repetitive sequences in the genomes across the tree of life, and represent an important source of genetic variability. Their distribution among genomes is specific to each lineage. A phenomenon associated with this feature is the sudden expansion of one or several TE families, called bursts of transposition. We previously proposed that bursts of the Mariner family (DNA transposons) contributed to the speciation of Rhodnius prolixus Stål, 1859. This hypothesis motivated us to study two additional species of the R. prolixus complex: Rhodnius montenegrensis da Rosa et al., 2012 and Rhodnius marabaensis Souza et al., 2016, together with a new, de novo annotation of the R. prolixus repeatome using unassembled short reads. Our analysis reveals that the total amount of TEs present in Rhodnius genomes (19% to 23.5%) is three to four times higher than that expected based on the original quantifications performed for the original genome description of R. prolixus. We confirm here that the repeatome of the three species is dominated by Class II elements of the superfamily Tc1-Mariner, as well as members of the LINE order (Class I). In addition to R. prolixus, we also identified a recent burst of transposition of the Mariner family in R. montenegrensis and R. marabaensis, suggesting that this phenomenon may not be exclusive to R. prolixus. Rather, we hypothesize that whilst the expansion of Mariner elements may have contributed to the diversification of the R. prolixus-R. robustus species complex, the distinct ecological characteristics of these new species did not drive the general evolutionary trajectories of these TEs. | - |
Descrição: dc.description | Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) | - |
Descrição: dc.description | Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) | - |
Descrição: dc.description | UNESP—Univ. Estadual Paulista Departamento de Biologia, São José do Rio Preto | - |
Descrição: dc.description | Department of Molecular Biology and Genetics Cornell University, 107 Biotechnology Building | - |
Descrição: dc.description | Laboratório de Epidemiologia e Sistemática Molecular Instituto Oswaldo Cruz FIOCRUZ | - |
Descrição: dc.description | Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive Université de Lyon Université Lyon 1 CNRS UMR5558 | - |
Descrição: dc.description | UNESP—Univ. Estadual Paulista Departamento de Biologia, São José do Rio Preto | - |
Idioma: dc.language | en | - |
Relação: dc.relation | Genes | - |
???dc.source???: dc.source | Scopus | - |
Palavras-chave: dc.subject | Burst of transposition | - |
Palavras-chave: dc.subject | DnaPipeTE | - |
Palavras-chave: dc.subject | Mariner family | - |
Palavras-chave: dc.subject | Repeatome | - |
Palavras-chave: dc.subject | Rhodnius marabaensis | - |
Palavras-chave: dc.subject | Rhodnius montenegrensis | - |
Palavras-chave: dc.subject | Rhodnius prolixus | - |
Título: dc.title | Homology-free detection of transposable elements unveils their dynamics in three ecologically distinct rhodnius species | - |
Tipo de arquivo: dc.type | livro digital | - |
Aparece nas coleções: | Repositório Institucional - Unesp |
O Portal eduCAPES é oferecido ao usuário, condicionado à aceitação dos termos, condições e avisos contidos aqui e sem modificações. A CAPES poderá modificar o conteúdo ou formato deste site ou acabar com a sua operação ou suas ferramentas a seu critério único e sem aviso prévio. Ao acessar este portal, você, usuário pessoa física ou jurídica, se declara compreender e aceitar as condições aqui estabelecidas, da seguinte forma: