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Metadados | Descrição | Idioma |
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Autor(es): dc.contributor | Universidade Estadual Paulista (Unesp) | - |
Autor(es): dc.contributor | Jagiellonian University in Kraków | - |
Autor(es): dc.contributor | J. Craig Venter Institute | - |
Autor(es): dc.contributor | 10X Genomics | - |
Autor(es): dc.creator | Silva, Saura R. [UNESP] | - |
Autor(es): dc.creator | Pinheiro, Daniel G. [UNESP] | - |
Autor(es): dc.creator | Penha, Helen A. [UNESP] | - |
Autor(es): dc.creator | Płachno, Bartosz J. | - |
Autor(es): dc.creator | Michael, Todd P. | - |
Autor(es): dc.creator | Meer, Elliott J. | - |
Autor(es): dc.creator | Miranda, Vitor F. O. [UNESP] | - |
Autor(es): dc.creator | Varani, Alessandro M. [UNESP] | - |
Data de aceite: dc.date.accessioned | 2022-02-22T00:28:21Z | - |
Data de disponibilização: dc.date.available | 2022-02-22T00:28:21Z | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2020-12-11 | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2020-12-11 | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2019-12-01 | - |
Fonte completa do material: dc.identifier | http://dx.doi.org/10.3390/ijms20246130 | - |
Fonte completa do material: dc.identifier | http://hdl.handle.net/11449/199797 | - |
Fonte: dc.identifier.uri | http://educapes.capes.gov.br/handle/11449/199797 | - |
Descrição: dc.description | Utricularia amethystina Salzm. ex A.St.-Hil. & Girard (Lentibulariaceae) is a highly polymorphic carnivorous plant taxonomically rearranged many times throughout history. Herein, the complete chloroplast genomes (cpDNA) of three U. amethystina morphotypes: purple-, white-, and yellow-flowered, were sequenced, compared, and putative markers for systematic, populations, and evolutionary studies were uncovered. In addition, RNA-Seq and RNA-editing analysis were employed for functional cpDNA evaluation. The cpDNA of three U. amethystina morphotypes exhibits typical quadripartite structure. Fine-grained sequence comparison revealed a high degree of intraspecific genetic variability in all morphotypes, including an exclusive inversion in the psbM and petN genes in U. amethystina yellow. Phylogenetic analyses indicate that U. amethystina morphotypes are monophyletic. Furthermore, in contrast to the terrestrial Utricularia reniformis cpDNA, the U. amethystina morphotypes retain all the plastid NAD(P)H-dehydrogenase (ndh) complex genes. This observation supports the hypothesis that the ndhs in terrestrial Utricularia were independently lost and regained, also suggesting that different habitats (aquatic and terrestrial) are not related to the absence of Utricularia ndhs gene repertoire as previously assumed. Moreover, RNA-Seq analyses recovered similar patterns, including nonsynonymous RNA-editing sites (e.g., rps14 and petB). Collectively, our results bring new insights into the chloroplast genome architecture and evolution of the photosynthesis machinery in the Lentibulariaceae. | - |
Descrição: dc.description | Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) | - |
Descrição: dc.description | Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) | - |
Descrição: dc.description | Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) | - |
Descrição: dc.description | Departamento de Tecnologia Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Jaboticabal Universidade Estadual Paulista (Unesp) | - |
Descrição: dc.description | Department of Plant Cytology and Embryology Institute of Botany Faculty of Biology Jagiellonian University in Kraków | - |
Descrição: dc.description | J. Craig Venter Institute, La Jolla | - |
Descrição: dc.description | 10X Genomics | - |
Descrição: dc.description | Departamento de Biologia Aplicada à Agropecuária Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Jaboticabal Universidade Estadual Paulista (Unesp) | - |
Descrição: dc.description | Departamento de Tecnologia Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Jaboticabal Universidade Estadual Paulista (Unesp) | - |
Descrição: dc.description | Departamento de Biologia Aplicada à Agropecuária Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Jaboticabal Universidade Estadual Paulista (Unesp) | - |
Descrição: dc.description | FAPESP: #2013/05144-0 | - |
Descrição: dc.description | FAPESP: #2013/25164-6 | - |
Descrição: dc.description | FAPESP: #2018/02285-6 | - |
Idioma: dc.language | en | - |
Relação: dc.relation | International Journal of Molecular Sciences | - |
???dc.source???: dc.source | Scopus | - |
Palavras-chave: dc.subject | Carnivorous plants | - |
Palavras-chave: dc.subject | Chloroplast phylogenomics | - |
Palavras-chave: dc.subject | Intraspecific variation | - |
Palavras-chave: dc.subject | Lentibulariaceae | - |
Palavras-chave: dc.subject | Ndh genes | - |
Palavras-chave: dc.subject | Organelle genome | - |
Palavras-chave: dc.subject | Polymorphic species | - |
Palavras-chave: dc.subject | Utricularia amethystina | - |
Título: dc.title | Intraspecific variation within the utricularia amethystina species morphotypes based on chloroplast genomes | - |
Tipo de arquivo: dc.type | livro digital | - |
Aparece nas coleções: | Repositório Institucional - Unesp |
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