Analyses of Seven New Genomes of Xanthomonas citri pv. aurantifolii Strains, Causative Agents of Citrus Canker B and C, Show a Reduced Repertoire of Pathogenicity-Related Genes

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorUniversidade Federal de Ouro Preto-
Autor(es): dc.contributorInstituto Butantan-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual Paulista (Unesp)-
Autor(es): dc.contributorUniversidade de São Paulo (USP)-
Autor(es): dc.contributorFundo de Defesa da Citricultura (FUNDECITRUS)-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS)-
Autor(es): dc.creatorFonseca, Natasha Peixoto-
Autor(es): dc.creatorPatané, José S. L.-
Autor(es): dc.creatorVarani, Alessandro M. [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorFelestrino, Érica Barbosa-
Autor(es): dc.creatorCaneschi, Washington Luiz-
Autor(es): dc.creatorSanchez, Angélica Bianchini-
Autor(es): dc.creatorCordeiro, Isabella Ferreira-
Autor(es): dc.creatorLemes, Camila Gracyelle de Carvalho-
Autor(es): dc.creatorAssis, Renata de Almeida Barbosa-
Autor(es): dc.creatorGarcia, Camila Carrião Machado-
Autor(es): dc.creatorBelasque, José-
Autor(es): dc.creatorMartins, Joaquim-
Autor(es): dc.creatorFacincani, Agda Paula [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorFerreira, Rafael Marini [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorJaciani, Fabrício José-
Autor(es): dc.creatorde Almeida, Nalvo Franco-
Autor(es): dc.creatorFerro, Jesus Aparecido [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorMoreira, Leandro Marcio-
Autor(es): dc.creatorSetubal, João C.-
Data de aceite: dc.date.accessioned2022-02-22T00:27:43Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2022-02-22T00:27:43Z-
Data de envio: dc.date.issued2020-12-11-
Data de envio: dc.date.issued2020-12-11-
Data de envio: dc.date.issued2019-10-11-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2019.02361-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11449/199565-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/11449/199565-
Descrição: dc.descriptionXanthomonas citri pv. aurantifolii pathotype B (XauB) and pathotype C (XauC) are the causative agents respectively of citrus canker B and C, diseases of citrus plants related to the better-known citrus canker A, caused by Xanthomonas citri pv. citri. The study of the genomes of strains of these related bacterial species has the potential to bring new understanding to the molecular basis of citrus canker as well as their evolutionary history. Up to now only one genome sequence of XauB and only one genome sequence of XauC have been available, both in draft status. Here we present two new genome sequences of XauB (both complete) and five new genome sequences of XauC (two complete). A phylogenomic analysis of these seven genome sequences along with 24 other related Xanthomonas genomes showed that there are two distinct and well-supported major clades, the XauB and XauC clade and the Xanthomonas citri pv. citri clade. An analysis of 62 Type III Secretion System effector genes showed that there are 42 effectors with variable presence/absence or pseudogene status among the 31 genomes analyzed. A comparative analysis of secretion-system and surface-structure genes showed that the XauB and XauC genomes lack several key genes in pathogenicity-related subsystems. These subsystems, the Types I and IV Secretion Systems, and the Type IV pilus, therefore emerge as important ones in helping explain the aggressiveness of the A type of citrus canker and the apparent dominance in the field of the corresponding strain over the B and C strains.-
Descrição: dc.descriptionCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)-
Descrição: dc.descriptionConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)-
Descrição: dc.descriptionPrograma de Pós-graduação em Biotecnologia Núcleo de Pesquisas em Ciências Biológicas Universidade Federal de Ouro Preto-
Descrição: dc.descriptionLaboratório Especial de Ciclo Celular Instituto Butantan-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Tecnologia Universidade Estadual Paulista UNESP, Campus de Jaboticabal-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Fitopatologia e Nematologia Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz Universidade de São Paulo-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Bioquímica Instituto de Química Universidade de São Paulo-
Descrição: dc.descriptionFundo de Defesa da Citricultura (FUNDECITRUS)-
Descrição: dc.descriptionFaculdade de Computação Universidade Federal de Mato Grosso do Sul-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Ciências Biológicas Instituto de Ciências Exatas e Biológicas Universidade Federal de Ouro Preto-
Descrição: dc.descriptionDepartamento de Tecnologia Universidade Estadual Paulista UNESP, Campus de Jaboticabal-
Idioma: dc.languageen-
Relação: dc.relationFrontiers in Microbiology-
???dc.source???: dc.sourceScopus-
Palavras-chave: dc.subjectadaptation-
Palavras-chave: dc.subjecteffectors-
Palavras-chave: dc.subjectgenome sequencing-
Palavras-chave: dc.subjectvirulence-
Palavras-chave: dc.subjectXanthomonas evolution-
Título: dc.titleAnalyses of Seven New Genomes of Xanthomonas citri pv. aurantifolii Strains, Causative Agents of Citrus Canker B and C, Show a Reduced Repertoire of Pathogenicity-Related Genes-
Tipo de arquivo: dc.typelivro digital-
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