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Metadados | Descrição | Idioma |
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Autor(es): dc.contributor | Universidade de São Paulo (USP) | - |
Autor(es): dc.contributor | Federal University of Juiz de Fora (UFJF) | - |
Autor(es): dc.contributor | The Pennsylvania State University | - |
Autor(es): dc.contributor | FIOCRUZ-Minas | - |
Autor(es): dc.contributor | Universidade Estadual Paulista (Unesp) | - |
Autor(es): dc.contributor | Instituto Tecnológico Vale | - |
Autor(es): dc.contributor | Universidade Federal de Lavras (UFLA) | - |
Autor(es): dc.creator | Lemos, Leandro N. | - |
Autor(es): dc.creator | Medeiros, Julliane D. | - |
Autor(es): dc.creator | Dini-Andreote, Francisco | - |
Autor(es): dc.creator | Fernandes, Gabriel R. | - |
Autor(es): dc.creator | Varani, Alessandro M. [UNESP] | - |
Autor(es): dc.creator | Oliveira, Guilherme | - |
Autor(es): dc.creator | Pylro, Victor S. | - |
Data de aceite: dc.date.accessioned | 2022-02-22T00:27:28Z | - |
Data de disponibilização: dc.date.available | 2022-02-22T00:27:28Z | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2020-12-11 | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2020-12-11 | - |
Data de envio: dc.date.issued | 2019-09-01 | - |
Fonte completa do material: dc.identifier | http://dx.doi.org/10.1111/mec.15208 | - |
Fonte completa do material: dc.identifier | http://hdl.handle.net/11449/199474 | - |
Fonte: dc.identifier.uri | http://educapes.capes.gov.br/handle/11449/199474 | - |
Descrição: dc.description | The size of bacterial genomes is often associated with organismal metabolic capabilities determining ecological breadth and lifestyle. The recently proposed Candidate Phyla Radiation (CPR)/Patescibacteria encompasses mostly unculturable bacterial taxa with relatively small genome sizes with potential for co-metabolism interdependencies. As yet, little is known about the ecology and evolution of CPR, particularly with respect to how they might interact with other taxa. Here, we reconstructed two novel genomes (namely, Candidatus Saccharibacter sossegus and Candidatus Chaer renensis) of taxa belonging to the class Saccharimonadia within the CPR/Patescibacteria using metagenomes obtained from acid mine drainage (AMD). By testing the hypothesis of genome streamlining or symbiotic lifestyle, our results revealed clear signatures of gene losses in these genomes, such as those associated with de novo biosynthesis of essential amino acids, nucleotides, fatty acids and cofactors. In addition, co-occurrence analysis provided evidence supporting potential symbioses of these organisms with Hydrotalea sp. in the AMD system. Together, our findings provide a better understanding of the ecology and evolution of CPR/Patescibacteria and highlight the importance of genome reconstruction for studying metabolic interdependencies between unculturable Saccharimonadia representatives. | - |
Descrição: dc.description | Vale Canada Limited | - |
Descrição: dc.description | Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) | - |
Descrição: dc.description | Cell and Molecular Biology Laboratory Center for Nuclear Energy in Agriculture CENA University of São Paulo USP | - |
Descrição: dc.description | Department of Parasitology Microbiology and Immunology Federal University of Juiz de Fora (UFJF) | - |
Descrição: dc.description | Department of Plant Science The Pennsylvania State University | - |
Descrição: dc.description | Huck Institutes of the Life Sciences The Pennsylvania State University | - |
Descrição: dc.description | Biosystems Informatics and Genomics Group René Rachou Institute FIOCRUZ-Minas | - |
Descrição: dc.description | Departamento de Tecnologia Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Universidade Estadual Paulista (Unesp) | - |
Descrição: dc.description | Environmental Genomics Group Instituto Tecnológico Vale | - |
Descrição: dc.description | Microbial Ecology and Bioinformatics Laboratory Department of Biology Federal University of Lavras (UFLA) | - |
Descrição: dc.description | Departamento de Tecnologia Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Universidade Estadual Paulista (Unesp) | - |
Descrição: dc.description | Vale Canada Limited: 1786221 | - |
Descrição: dc.description | CNPq: 307479/2016-1 | - |
Formato: dc.format | 4259-4271 | - |
Idioma: dc.language | en | - |
Relação: dc.relation | Molecular Ecology | - |
???dc.source???: dc.source | Scopus | - |
Palavras-chave: dc.subject | acid mine drainage | - |
Palavras-chave: dc.subject | metagenome-assembled genome | - |
Palavras-chave: dc.subject | Saccharimonadia | - |
Palavras-chave: dc.subject | symbiosis | - |
Título: dc.title | Genomic signatures and co-occurrence patterns of the ultra-small Saccharimonadia (phylum CPR/Patescibacteria) suggest a symbiotic lifestyle | - |
Tipo de arquivo: dc.type | livro digital | - |
Aparece nas coleções: | Repositório Institucional - Unesp |
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