In silico analysis of Pinus L. Chloroplast DNA to microsatellites regions

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual Paulista (Unesp)-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual de Campinas (UNICAMP)-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual do Centro Oeste – Unicentro.-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Federal de São Carlos (UFSCar)-
Autor(es): dc.creatorMoro, Michele [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorPereira, Fernanda Bortolanza [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorFilho, Jaire Alves Ferreira-
Autor(es): dc.creatorPerek, Matheus-
Autor(es): dc.creatorBandeira Peres, Fabiana Schmidt-
Autor(es): dc.creatorde Assis Furquim, Gabriel-
Autor(es): dc.creatorTambarussi, Evandro Vagner-
Data de aceite: dc.date.accessioned2022-02-22T00:23:40Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2022-02-22T00:23:40Z-
Data de envio: dc.date.issued2020-12-11-
Data de envio: dc.date.issued2020-12-11-
Data de envio: dc.date.issued2019-01-01-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.18671/scifor.v47n123.16-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11449/198134-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/11449/198134-
Descrição: dc.descriptionThe Pinus genus covers a wide variety of widely cultivated species due to adaptability, high growth and wood quality. Molecular markers have been used for many genetic analyses, and among them, the microsatellite markers (SSR) have several applications and can be found in chloroplast genome (cpDNA) as well as in nuclear genomes (ntDNA). The chloroplast microsatellites markers (cpSSR) can be used for gene flow analysis, identification of hybrids,clones, paternity tests, genetic diversity studies, phylogenetic analysis, among others. The work aimed to characterize the cpSSRs of Pinus species with cpDNA sequenced and deposited in NCBI (National Center for Biotechnology Information). In the twenty species of Pinus spp. studied, 1.542 cpSSRs were identified, with 86,45% of mononucleotide type, and the less frequent the penta- (1.10%) and hexanucleotide (1.04%) types. Predominated cpSSRs in non-coding regions (intergenic). The results indicate presence of a wide range of cpSSR for Pinus spp., which can subsidize breeding programs of interesting species.-
Descrição: dc.descriptionFaculty of Agronomic Sciences Universidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho” Unesp-
Descrição: dc.descriptionCenter for Molecular Biology and Genetic Engineering Universidade Estadual de Campinas – Unicamp-
Descrição: dc.descriptionForestry Department Universidade Estadual do Centro Oeste – Unicentro.-
Descrição: dc.descriptionForestry Department Universidade Federal de São Carlos - UFSCar-
Descrição: dc.descriptionFaculty of Agronomic Sciences Universidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho” Unesp-
Formato: dc.format545-551-
Idioma: dc.languageen-
Relação: dc.relationScientia Forestalis/Forest Sciences-
???dc.source???: dc.sourceScopus-
Palavras-chave: dc.subjectCpDNA-
Palavras-chave: dc.subjectCpSSR-
Palavras-chave: dc.subjectForest improvement-
Palavras-chave: dc.subjectGenetical improvement-
Título: dc.titleIn silico analysis of Pinus L. Chloroplast DNA to microsatellites regions-
Tipo de arquivo: dc.typelivro digital-
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