Linkage disequilibrium and effective population size in Gir cattle selected for yearling weight

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual Paulista (Unesp)-
Autor(es): dc.contributorInst Anim Sci-
Autor(es): dc.contributorFed Univ Grande Dourados-
Autor(es): dc.creatorToro Ospina, Alejandra M. [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorMaiorano, Amanda Marchi [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorCuri, Rogerio A. [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorPereira, Guilherme L. [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorZerlotti-Mercadante, Maria Eugenia-
Autor(es): dc.creatorSantos Goncalves Cyrillo, Joslaine Noely dos-
Autor(es): dc.creatorAspilcueta-Borquis, Rusbel R.-
Autor(es): dc.creatorSilva, Josineudson A. de V. [UNESP]-
Data de aceite: dc.date.accessioned2022-02-22T00:04:12Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2022-02-22T00:04:12Z-
Data de envio: dc.date.issued2020-12-09-
Data de envio: dc.date.issued2020-12-09-
Data de envio: dc.date.issued2019-10-13-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.1111/rda.13559-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11449/194895-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/11449/194895-
Descrição: dc.descriptionLinkage disequilibrium (LD) plays an important role in genomic selection and mapping of quantitative trait loci (QTL). This study investigated the pattern of LD and effective population size (N-e) in Gir cattle selected for yearling weight. For this purpose, 173 animals with imputed genotypes (from 18 animals genotyped with the Illumina BovineHD BeadChip and 155 animals genotyped with the Bovine LDv4 panel) were analysed. The LD was evaluated at distances of 25-50 kb, 50-100 kb, 100-500 kb and 0.5-1 Mb. The N-e was estimated based on 5 past generations. The r(2) values (a measure of LD) were, respectively, .35, .29, .18 and .032 for the distances evaluated. The LD estimates decreased with increasing distance of SNP pairs and LD persisted up to a distance of 100 kb (r(2) = .29). The N-e was greater in generations 4 and 5 (24 and 30 animals, respectively) and declined drastically after the last generation (12 animals). The results showed high levels of LD and low N-e, which were probably due to the loss of genetic variability as a consequence of the structure of the Gir population studied.-
Descrição: dc.descriptionFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)-
Descrição: dc.descriptionAgence Universitaire de la Francophonie (PRISA)-
Descrição: dc.descriptionConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)-
Descrição: dc.descriptionCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)-
Descrição: dc.descriptionSao Paulo State Univ, Fac Agr & Vet Sci, Genet Anim Breeding, Jaboticabal, SP, Brazil-
Descrição: dc.descriptionSao Paulo State Univ, Fac Vet Med & Anim Sci, Dept Breeding & Anim Nutr, Botucatu, SP, Brazil-
Descrição: dc.descriptionInst Anim Sci, Ctr Beef Cattle, Sertaozinho, Brazil-
Descrição: dc.descriptionFed Univ Grande Dourados, Fac Agr Sci, Dourados, Brazil-
Descrição: dc.descriptionSao Paulo State Univ, Fac Agr & Vet Sci, Genet Anim Breeding, Jaboticabal, SP, Brazil-
Descrição: dc.descriptionSao Paulo State Univ, Fac Vet Med & Anim Sci, Dept Breeding & Anim Nutr, Botucatu, SP, Brazil-
Descrição: dc.descriptionFAPESP: 2015/06686-7-
Descrição: dc.descriptionAgence Universitaire de la Francophonie (PRISA): 1140/2018-
Descrição: dc.descriptionCNPq: 304047/2017-1-
Formato: dc.format8-
Idioma: dc.languageen-
Publicador: dc.publisherWiley-Blackwell-
Relação: dc.relationReproduction In Domestic Animals-
???dc.source???: dc.sourceWeb of Science-
Palavras-chave: dc.subjectBos indicus-
Palavras-chave: dc.subjectgenetic variability-
Palavras-chave: dc.subjectlinkage disequilibrium-
Título: dc.titleLinkage disequilibrium and effective population size in Gir cattle selected for yearling weight-
Tipo de arquivo: dc.typelivro digital-
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