Validation of microsatellite loci for Balfourodendron riedelianum through analysis of Mendelian inheritance, genetic linkage, and genotypic linkage disequilibrium

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MetadadosDescriçãoIdioma
Autor(es): dc.contributorUniversidade de São Paulo (USP)-
Autor(es): dc.contributorInst Florestal Sao Paulo-
Autor(es): dc.contributorUniversidade Estadual Paulista (Unesp)-
Autor(es): dc.creatorAguiar, B.-
Autor(es): dc.creatorGandara, F. B.-
Autor(es): dc.creatorFreitas, M. L. M.-
Autor(es): dc.creatorMoraes, M. L. T. [UNESP]-
Autor(es): dc.creatorKageyama, P. Y.-
Autor(es): dc.creatorSebbenn, A. M.-
Data de aceite: dc.date.accessioned2022-02-22T00:04:03Z-
Data de disponibilização: dc.date.available2022-02-22T00:04:03Z-
Data de envio: dc.date.issued2020-12-09-
Data de envio: dc.date.issued2020-12-09-
Data de envio: dc.date.issued2019-01-01-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.2478/sg-2019-0015-
Fonte completa do material: dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11449/194832-
Fonte: dc.identifier.urihttp://educapes.capes.gov.br/handle/11449/194832-
Descrição: dc.descriptionBalfourodendron riedelianum is a tropical tree endemic to the Atlantic Forest biome that is currently endangered due to forest fragmentation and extensive exploitation. Three populations of the species are conserved ex situ in a provenance and progeny test at the Luiz Antonio Experimental Station, Sao Paulo State, Brazil. To verify if seven microsatellite loci developed for the species can be used as genetic markers in analyses focused on conservation and sustainable use strategies, leaf tissue samples were collected from the three provenances and from 17 seed trees in one provenance. We analyzed Mendelian inheritance and genetic linkage for the 17 seed trees and genotypic linkage disequilibrium for individuals from the three provenances. For six of the seven loci analyzed, all 17 seed trees showed heterozygosity. The inheritance and genetic linkage analyses were performed using respective locus, while the genotypic linkage disequilibrium analysis was performed for the seven loci. After Bonferroni correction, none of the 75 tests showed deviation from Mendelian segregation and genetic linkage, nor did we detect genotypic linkage disequilibrium. The results suggest that six of the seven loci can be used for population genetics studies on B. riedelianum.-
Descrição: dc.descriptionFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)-
Descrição: dc.descriptionCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)-
Descrição: dc.descriptionConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)-
Descrição: dc.descriptionUniv Sao Paulo, Escola Super Agr Luiz de Queiroz, Av Padua Dias 11,Caixa Postal 9, BR-13418900 Piracicaba, SP, Brazil-
Descrição: dc.descriptionInst Florestal Sao Paulo, CP 1322, BR-01059970 Sao Paulo, SP, Brazil-
Descrição: dc.descriptionUniv Estadual Paulista, Campus Ilha Solteira,A Brasil 56, BR-15385000 Ilha Solteira, SP, Brazil-
Descrição: dc.descriptionUniv Estadual Paulista, Campus Ilha Solteira,A Brasil 56, BR-15385000 Ilha Solteira, SP, Brazil-
Descrição: dc.descriptionFAPESP: 2014/27143-9-
Descrição: dc.descriptionCAPES: 001-
Formato: dc.format81-84-
Idioma: dc.languageen-
Publicador: dc.publisherSciendo-
Relação: dc.relationSilvae Genetica-
???dc.source???: dc.sourceWeb of Science-
Palavras-chave: dc.subjectAtlantic Forest-
Palavras-chave: dc.subjectConservation genetics-
Palavras-chave: dc.subjectInheritance-
Palavras-chave: dc.subjectMicrosatellite markers-
Palavras-chave: dc.subjectTropical tree species-
Título: dc.titleValidation of microsatellite loci for Balfourodendron riedelianum through analysis of Mendelian inheritance, genetic linkage, and genotypic linkage disequilibrium-
Tipo de arquivo: dc.typelivro digital-
Aparece nas coleções:Repositório Institucional - Unesp

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