MOLECULAR DOCKING STUDY OF NICOTINE AND NORNICOTINE WITH THE ENZYME 5-ENOLPYRUVYLSHIKIMATE-3-PHOSPHATE SYNTHASE (Atena Editora)

Abstract

El glifosato es un ácido orgánico polar constituido por una molécula de glicina y una de fosfonometilo, es utilizado como herbicida de amplio espectro ya que inhibe la vía del shikimato evitando la síntesis de aminoácidos aromáticos, sin embargo, la OMS lo ha catalogado como extremadamente tóxico. En este estudio se realizó un análisis de acoplamiento molecular de la actividad inhibitoria de la nicotina, nornicotina y glifosato en el sitio de unión de la enzima 5-enolpiruvil-shikimato-3-P-sintasa. El glifosato presentó el modelo de mayor estabilidad, los modelos de nicotina y nornicotina presentaron mayor energía de unión y menor eficiencia. La nicotina y nornicotina presentaron baja afinidad a la enzima en comparación con el glifosato de acuerdo con los valores de K i . El glifosato interactuó con 18

residuos, la nornicotina interactuó con 17 y la nicotina interactuó con 12. Solamente el glifosato y la nornicotina interactuaron con residuos pertenecientes al sitio de unión de la enzima. El grupo metilo presente en la nicotina y ausente en la nornicotina afecta la estabilidad de unión y afinidad de los modelos, así como las interacciones con los residuos del sitio de unión.